Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS

Descrição

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 1.290 registros.

Também existem 4 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

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Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Fuentes Lorenzo J L (2023): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS. v2.9. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Colombian Biodiversity Information System.

Palavras-chave

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; PERMISO_COLECTA; Occurrence; Specimen

Dados externos

Os dados de recurso também estão disponíveis em outros formatos

Contatos

Cobertura Geográfica

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo, cuerpos de agua, composta, fermentación del cacao, entre otros.

Cobertura Taxonômica

La colección abarca los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63). Estos especímenes representan 9 filos microbianos diferentes [Actinomycetota(24), Ascomycota (20), Bacteroidetes (4), Bacillota (51), Basidiomycota (9), Firmicutes (195) y Proteobacteria (354), Pseudomonadota (58) y Thermodesulfobacteriota (7)] y se distribuyen en 94 géneros microbianos. Estos son: Achromobacter (2), Acinetobacter (12), Actinomyces (1), Agrobacterium (1), Alcaligenes (1), Bacillus (174), Beauveria (1), Beijerinckia (5), Bosea (1), Brevibacterium (1), Burkholderia (3), Buttiauxella (4), Byssomerulius (1), Candida (7), Carnobacterium (2), Cedecea (2), Chromobacterium (4), Chryseobacterium (3), Citrobacter (13), Clostridium (9), Comamonas (2), Coniochaeta(1), Corynebacterium (1), Cupriavidus (3), Cutibacterium (10), Cytobacillus(1), Delftia (1), Derxia (1), Desulfotomaculum (3), Desulfovibrio (7), Dictyopanus (1), Edwardsiella (1), Enterobacter (16), Enterococcus (9), Escherichia (18), Ewingella (1), Exiguobacterium (2), Geobacillus (1), Goffeauzyma (1), Halomonas (10), Hannaella (1), Hanseniaspora (1), Hyphodontia (1), Klebsiella (28), Kluyvera (1), Kocuria (2), Lactococcus (5), Leclercia(1), Lelliottia (16), Leuconostoc (2), Listeria (1), Lysinibacillus (7), Marinobacter (11), Mesobacillus (1), Microbacterium (2), Micrococcus (3), Microvirgula (1), Mixta (2), Morganella (2), Naganishia (1),Obesumbacterium (13), Ochrobactrum (6), Paenibacillus (1), Pantoea (2), Paraclostridium (3), Pectobacterium (2), Penicillium (1), Pichia (1), Pleurotus (1), Proteus (2), Providencia (1), Pseudomonas (96), Psychrobacillus (2), Raoultella (3), Rhizobium (2), Rummeliibacillus (3), Saccharomyces (3), Salmonella (2), Serratia (69), Shigella (1), Sporolactobacillus (2), Staphylococcus (11), Stenotrophomonas (2), Streptococcus (1), Streptomyces(1), Thauera (3), Torulaspora (1), Trametes (1), Trichoderma (2), Viridibacillus (1), Wickerhamomyces (1), Yersinia (6), Zobellella (6), Zoogloea (1).

Cobertura Temporal

Dados Sobre o Projeto

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander). Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado). Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia). Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales). Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

O pessoal envolvido no projeto:

Métodos de Amostragem

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Descrição dos passos do método:

1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos.
2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Dados de Coleção

Metadados Adicionais