Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

Versão mais recente publicado por Universidad Industrial de Santander em Feb 6, 2020 Universidad Industrial de Santander

La colección microbiana o cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental (LMMA) de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS), tiene su origen la actividad de recolección de muestras de diversos ambientes con fines académicos y de investigación, así como donaciones y compra de cepas de referencia, del Grupo de Investigación de Microbiología y Genética (GIMG).

En total, 695 especímenes (56.5%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. De estos, solo 202 especímenes (~30%), han sido identificados al nivel de especie.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 1,230 registros. Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

  • Occurrence (core)
    1230
  • MeasurementOrFact 
    4920
  • Preservation 
    1230

Este IPT armazena os dados e, portanto, serve como um repositório de dados. Os dados e os metadados do recurso estão disponíveis para download no seção de downloads. A tabela de versões lista outras versões do recurso que foram disponibilizadas ao público e permite o rastreamento das alterações realizadas no recurso ao longo do tempo.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 1,230 registros em Spanish (66 KB) - Frequência de atualização: quando necessário
Metadados como um arquivo EML download em Spanish (14 KB)
Metadados como um arquivo RTF download em Spanish (13 KB)

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Fuentes J, Suescún J (2020): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v2.3. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Colombian Biodiversity Information System.

Palavras-chave

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Occurrence; Specimen

Contatos

Quem criou esse recurso:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Quem preencher os metadados:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santader
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santader

Quem mais foi associado com o recurso:

Pesquisador Principal
Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Provedor de Conteúdo
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Cobertura Geográfica

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua.

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [-3.864, -79.277], Norte Leste [11.953, -66.094]

Cobertura Taxonômica

En total, el 56.3 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 16.4 % a nivel de especie.

Filo  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria,  Ascomycota,  Basidiomycota,  Bacteroidetes

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 2015-01-01 / 2020-01-01

Dados Sobre o Projeto

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander) Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado) Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia) Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales) Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

Título Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
Identificador 8864, 9423, 5187, 8162
Financiamento Financiación externa 8864: Gobernación de Santander Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión

O pessoal envolvido no projeto:

Jorge Fuentes

Métodos de Amostragem

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Área de Estudo El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón y volcanes de lodo presentes en varias localidades de Colombia.
Controle de Qualidade El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Descrição dos passos do método:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Dados de Coleção

Nome da Coleção Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Identificador da Coleção Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Identificador da Coleção Parental UIS
Métodos de preservação do espécime Congelado,  Seco
Unidades de Curadoria Entre 1 e 3 Crioviales ,  Entre 1 e 3 Papel filtro

Metadados Adicionais

Propósito Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
Identificadores alternativos 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma