Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS

Description

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 1,290 records.

4 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

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Versions

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Fuentes Lorenzo J L (2023): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS. v2.9. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.

Keywords

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; PERMISO_COLECTA; Occurrence; Specimen

External data

The resource data is also available in other formats

Contacts

Geographic Coverage

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo, cuerpos de agua, composta, fermentación del cacao, entre otros.

Taxonomic Coverage

La colección abarca los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63). Estos especímenes representan 9 filos microbianos diferentes [Actinomycetota(24), Ascomycota (20), Bacteroidetes (4), Bacillota (51), Basidiomycota (9), Firmicutes (195) y Proteobacteria (354), Pseudomonadota (58) y Thermodesulfobacteriota (7)] y se distribuyen en 94 géneros microbianos. Estos son: Achromobacter (2), Acinetobacter (12), Actinomyces (1), Agrobacterium (1), Alcaligenes (1), Bacillus (174), Beauveria (1), Beijerinckia (5), Bosea (1), Brevibacterium (1), Burkholderia (3), Buttiauxella (4), Byssomerulius (1), Candida (7), Carnobacterium (2), Cedecea (2), Chromobacterium (4), Chryseobacterium (3), Citrobacter (13), Clostridium (9), Comamonas (2), Coniochaeta(1), Corynebacterium (1), Cupriavidus (3), Cutibacterium (10), Cytobacillus(1), Delftia (1), Derxia (1), Desulfotomaculum (3), Desulfovibrio (7), Dictyopanus (1), Edwardsiella (1), Enterobacter (16), Enterococcus (9), Escherichia (18), Ewingella (1), Exiguobacterium (2), Geobacillus (1), Goffeauzyma (1), Halomonas (10), Hannaella (1), Hanseniaspora (1), Hyphodontia (1), Klebsiella (28), Kluyvera (1), Kocuria (2), Lactococcus (5), Leclercia(1), Lelliottia (16), Leuconostoc (2), Listeria (1), Lysinibacillus (7), Marinobacter (11), Mesobacillus (1), Microbacterium (2), Micrococcus (3), Microvirgula (1), Mixta (2), Morganella (2), Naganishia (1),Obesumbacterium (13), Ochrobactrum (6), Paenibacillus (1), Pantoea (2), Paraclostridium (3), Pectobacterium (2), Penicillium (1), Pichia (1), Pleurotus (1), Proteus (2), Providencia (1), Pseudomonas (96), Psychrobacillus (2), Raoultella (3), Rhizobium (2), Rummeliibacillus (3), Saccharomyces (3), Salmonella (2), Serratia (69), Shigella (1), Sporolactobacillus (2), Staphylococcus (11), Stenotrophomonas (2), Streptococcus (1), Streptomyces(1), Thauera (3), Torulaspora (1), Trametes (1), Trichoderma (2), Viridibacillus (1), Wickerhamomyces (1), Yersinia (6), Zobellella (6), Zoogloea (1).

Temporal Coverage

Project Data

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander). Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado). Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia). Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales). Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

The personnel involved in the project:

Sampling Methods

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Method step description:

1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos.
2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Collection Data

Additional Metadata