Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

Última versión Publicado por Universidad Industrial de Santander en May 6, 2019 Universidad Industrial de Santander

La colección microbiana o cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental (LMMA) de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS), tiene su origen la actividad de recolección de muestras de diversos ambientes del subsuelo profundo con fines académicos y de investigación, así como donaciones y compra de cepas de referencia, del Grupo de Investigación de Microbiología y Genética (GIMG).

En total, el 77.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género, el 9.8 % a nivel de especie y el 20,7 % de los especímenes solamente a nivel de reino.

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 357 registros. también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    357
  • MeasurementOrFact 
    1428
  • Preservation 
    357

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 357 registros en Español (24 KB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Fuentes J, Suescún J (2019): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v2.1. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Occurrence; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

¿Quién documentó los metadatos?:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santader
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santader

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Investigador Principal
Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Proveedor de Contenido
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Cobertura Geográfica

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-3.864, -79.277], Latitud Máxima Longitud Máxima [11.953, -66.094]

Cobertura Taxonómica

En total, el 77.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género, el 9.8 % a nivel de especie y el 20,7 % de los especímenes solamente a nivel de reino.

Reino  Fungi
Filo  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2015-01-01 / 2019-01-01

Datos del Proyecto

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander) Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado) Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia) Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales) Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

Título Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
Identificador 8864, 9423, 5187, 8162
Fuentes de Financiación Financiación externa 8864: Gobernación de Santander Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión

Personas asociadas al proyecto:

Jorge Fuentes

Métodos de Muestreo

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Área de Estudio El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón y volcanes de lodo presentes en varias localidades de Colombia.
Control de Calidad El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Identificador de la Colección Parental UIS
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado,  Secado
Unidades Curatoriales Entre 1 y 3 Crioviales

Metadatos Adicionales

Propósito Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
Identificadores Alternativos 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma