OCCURRENCE

Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS

Последняя версия опубликована Universidad Industrial de Santander 25 октября 2023 г. Universidad Industrial de Santander
El cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (Cepario LMMA–UIS) es una colección microbiana que cuenta con un total de 1290 especímenes que abarcan los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63), colectados entre 2011 y 2023. Estos fueron crio-preservados (-80 ºC) en glicerol. La mayoría de estos especímenes (97,6%), son productos de la actividad de investigación del Grupo de Investigación en Microbiología y Genética (COL0083849). Una fracción minoritarias (2.4%), son depósitos de otros grupos de investigación o cepas de referencias adquiridas. A la fecha 722 especímenes (56%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. La colección está representada por 9 filos, 13 clases, 29 órdenes, 56 familias... Больше
Дата публикации:
25 октября 2023 г.
Техническое обеспечение:
Universidad Industrial de Santander
Лицензия:
CC-BY-NC 4.0

Описание

El cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (Cepario LMMA–UIS) es una colección microbiana que cuenta con un total de 1290 especímenes que abarcan los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63), colectados entre 2011 y 2023. Estos fueron crio-preservados (-80 ºC) en glicerol. La mayoría de estos especímenes (97,6%), son productos de la actividad de investigación del Grupo de Investigación en Microbiología y Genética (COL0083849). Una fracción minoritarias (2.4%), son depósitos de otros grupos de investigación o cepas de referencias adquiridas. A la fecha 722 especímenes (56%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. La colección está representada por 9 filos, 13 clases, 29 órdenes, 56 familias, 94 géneros y 138 especies microbianas.

Записи данных

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  • Occurrence (core)
    1290
  • Preservation 
    2580
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    2580
  • MaterialSample 
    1290
  • Permit 
    1290

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Версии

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Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Fuentes Lorenzo J L (2023): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS. v2.9. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Colombian Biodiversity Information System.

Ключевые слова

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; PERMISO_COLECTA; Occurrence; Specimen

Внешние данные

Ресурс также доступен в других форматах

Cepario virtual LMMA-UIS http://cepariolmma.uis.edu.co UTF-8 Página web 1
0047_cepariolmmauis_20210323 https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=0047_cepariolmmauis_20210323 UTF-8 DWC-A 1

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Calle 9na y Cra 27
680002 Bucaramanga
Santander
CO
+573042412338

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Cra 27 y calle 9na
680002 Bucaramanga
Santander
CO
+573042412338

Кем заполнены метаданные:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Cra 27 calle 9
680002 Bucaramanga
Santander
CO

Географический охват

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo, cuerpos de agua, composta, fermentación del cacao, entre otros.

Ограничивающие координаты Юг Запад [-3,864, -79,277], Север Восток [11,953, -66,094]

Таксономический охват

La colección abarca los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63). Estos especímenes representan 9 filos microbianos diferentes [Actinomycetota(24), Ascomycota (20), Bacteroidetes (4), Bacillota (51), Basidiomycota (9), Firmicutes (195) y Proteobacteria (354), Pseudomonadota (58) y Thermodesulfobacteriota (7)] y se distribuyen en 94 géneros microbianos. Estos son: Achromobacter (2), Acinetobacter (12), Actinomyces (1), Agrobacterium (1), Alcaligenes (1), Bacillus (174), Beauveria (1), Beijerinckia (5), Bosea (1), Brevibacterium (1), Burkholderia (3), Buttiauxella (4), Byssomerulius (1), Candida (7), Carnobacterium (2), Cedecea (2), Chromobacterium (4), Chryseobacterium (3), Citrobacter (13), Clostridium (9), Comamonas (2), Coniochaeta(1), Corynebacterium (1), Cupriavidus (3), Cutibacterium (10), Cytobacillus(1), Delftia (1), Derxia (1), Desulfotomaculum (3), Desulfovibrio (7), Dictyopanus (1), Edwardsiella (1), Enterobacter (16), Enterococcus (9), Escherichia (18), Ewingella (1), Exiguobacterium (2), Geobacillus (1), Goffeauzyma (1), Halomonas (10), Hannaella (1), Hanseniaspora (1), Hyphodontia (1), Klebsiella (28), Kluyvera (1), Kocuria (2), Lactococcus (5), Leclercia(1), Lelliottia (16), Leuconostoc (2), Listeria (1), Lysinibacillus (7), Marinobacter (11), Mesobacillus (1), Microbacterium (2), Micrococcus (3), Microvirgula (1), Mixta (2), Morganella (2), Naganishia (1),Obesumbacterium (13), Ochrobactrum (6), Paenibacillus (1), Pantoea (2), Paraclostridium (3), Pectobacterium (2), Penicillium (1), Pichia (1), Pleurotus (1), Proteus (2), Providencia (1), Pseudomonas (96), Psychrobacillus (2), Raoultella (3), Rhizobium (2), Rummeliibacillus (3), Saccharomyces (3), Salmonella (2), Serratia (69), Shigella (1), Sporolactobacillus (2), Staphylococcus (11), Stenotrophomonas (2), Streptococcus (1), Streptomyces(1), Thauera (3), Torulaspora (1), Trametes (1), Trichoderma (2), Viridibacillus (1), Wickerhamomyces (1), Yersinia (6), Zobellella (6), Zoogloea (1).

Phylum  Actinobacteria,  Ascomycota,  Bacteroidetes,  Basidiomycota,  Firmicutes,  Proteobacteria

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2011-01-09 / 2023-02-15

Данные проекта

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander). Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado). Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia). Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales). Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

Название Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
Финансирование Financiación externa 8864: Gobernación de Santander. Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión. Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión. Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión.

Исполнители проекта:

Principal Investigator
Jorge Luis Fuentes Lorenzo

Методы сбора

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Охват исследования El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua continentales, presentes en varias localidades de Colombia.
Контроль качества El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos geográficos: stateProvince y county.

Описание этапа методики:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos.
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Данные коллекции

Название коллекции Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Идентификатор коллекции Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Идентификатор родительской коллекции Cepario-LMMA-UIS
Название коллекции Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Идентификатор коллекции https://www.gbif.org/grscicoll/collection/64bce5dd-1c5a-4c08-a8c2-5147452e206e
Идентификатор родительской коллекции Cepario-LMMA-UIS
Методы сохранения образцов Deep frozen,  Dried
Единицы хранения Между 1 и 3 Crioviales ,  Между 1 и 3 Papel filtro

Дополнительные метаданные

Цель Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
Альтернативные идентификаторы 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma