Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

Последняя версия опубликована Universidad Industrial de Santander Feb 6, 2020 Universidad Industrial de Santander

La colección microbiana o cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental (LMMA) de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS), tiene su origen la actividad de recolección de muestras de diversos ambientes con fines académicos y de investigación, así como donaciones y compra de cepas de referencia, del Grupo de Investigación de Microbiología y Genética (GIMG).

En total, 695 especímenes (56.5%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. De estos, solo 202 especímenes (~30%), han sido identificados al nivel de especie.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 1,230 записей. Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

  • Occurrence (core)
    1230
  • MeasurementOrFact 
    4920
  • Preservation 
    1230

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем (репозиторием) данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. Перечень версий служит для отображения истории публикации версий данного ресурса.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 1,230 Записи в Spanish (66 KB) - Частота обновления: as needed
Метаданные в формате EML Скачать в Spanish (14 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в Spanish (13 KB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Fuentes J, Suescún J (2020): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v2.3. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e.  Universidad Industrial de Santander отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Colombian Biodiversity Information System.

Ключевые слова

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Occurrence; Specimen

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Кем заполнены метаданные:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santader
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santader

Кто еще связан с данным ресурсом:

Principal Investigator
Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Content Provider
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

Географический охват

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua.

Ограничивающие координаты Юг Запад [-3.864, -79.277], Север Восток [11.953, -66.094]

Таксономический охват

En total, el 56.3 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 16.4 % a nivel de especie.

Phylum  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria,  Ascomycota,  Basidiomycota,  Bacteroidetes

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2015-01-01 / 2020-01-01

Данные проекта

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander) Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado) Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia) Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales) Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

Название Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
Идентификатор 8864, 9423, 5187, 8162
Финансирование Financiación externa 8864: Gobernación de Santander Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión

Исполнители проекта:

Jorge Fuentes

Методы сбора

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Охват исследования El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón y volcanes de lodo presentes en varias localidades de Colombia.
Контроль качества El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Описание этапа методики:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Данные коллекции

Название коллекции Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Идентификатор коллекции Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Идентификатор родительской коллекции UIS
Методы сохранения образцов Deep frozen,  Dried
Единицы хранения Между 1 и 3 Crioviales ,  Между 1 и 3 Papel filtro

Дополнительные метаданные

Цель Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
Альтернативные идентификаторы 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma