Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

最新版本 由 Universidad Industrial de Santander 發佈於 Feb 6, 2020 Universidad Industrial de Santander

La colección microbiana o cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental (LMMA) de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS), tiene su origen la actividad de recolección de muestras de diversos ambientes con fines académicos y de investigación, así como donaciones y compra de cepas de referencia, del Grupo de Investigación de Microbiología y Genética (GIMG).

En total, 695 especímenes (56.5%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. De estos, solo 202 especímenes (~30%), han sido identificados al nivel de especie.

Data Records

The data in this 出現紀錄 resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 1,230 records. 2 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.

  • Occurrence (核心)
    1230
  • MeasurementOrFact 
    4920
  • Preservation 
    1230

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

下載

下載最新版本的Darwin Core Archive (DwC-A)資源,或資源元數據的EML或RTF文字檔。

DwC-A資料集 下載 1,230 紀錄 在 Spanish 中 (66 KB) - Update frequency: 需要時
元數據EML檔 下載 在 Spanish 中 (14 KB)
元數據RTF文字檔 下載 在 Spanish 中 (13 KB)

版本

The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.

如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Fuentes J, Suescún J (2020): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v2.3. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

Rights

研究者應尊重以下權利聲明。:

The publisher and rights holder of this work is Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊,並指定以下之GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e。  Universidad Industrial de Santander 發佈此資源,並經由Colombian Biodiversity Information System同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Occurrence; Specimen

聯絡資訊

資源建立者:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

可回覆此資源相關問題者:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

元數據填寫者:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santader
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santader

與此資源的相關者:

研究主持人
Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
內容提供者
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

地理涵蓋範圍

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua.

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [-3.864, -79.277], 緯度北界 經度東界 [11.953, -66.094]

分類群涵蓋範圍

En total, el 56.3 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 16.4 % a nivel de especie.

Phylum  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria,  Ascomycota,  Basidiomycota,  Bacteroidetes

時間涵蓋範圍

起始日期 / 結束日期 2015-01-01 / 2020-01-01

計畫資料

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander) Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado) Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia) Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales) Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

計畫名稱 Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
辨識碼 8864, 9423, 5187, 8162
經費來源 Financiación externa 8864: Gobernación de Santander Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión

The personnel involved in the project:

Jorge Fuentes

取樣方法

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

研究範圍 El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón y volcanes de lodo presentes en varias localidades de Colombia.
品質控管 El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

方法步驟描述:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

收藏資料

蒐藏名稱 Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
蒐藏編號 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
上層採集品識別碼 UIS
Specimen preservation methods Deep frozen,  Dried
管理單位 在...之間 1 和 3 Crioviales ,  在...之間 1 和 3 Papel filtro

額外的元數據

目的 Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
替代的識別碼 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma