OCCURRENCE

Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS

最新版本 由 Universidad Industrial de Santander 發佈於 2023年10月25日 Universidad Industrial de Santander
El cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (Cepario LMMA–UIS) es una colección microbiana que cuenta con un total de 1290 especímenes que abarcan los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63), colectados entre 2011 y 2023. Estos fueron crio-preservados (-80 ºC) en glicerol. La mayoría de estos especímenes (97,6%), son productos de la actividad de investigación del Grupo de Investigación en Microbiología y Genética (COL0083849). Una fracción minoritarias (2.4%), son depósitos de otros grupos de investigación o cepas de referencias adquiridas. A la fecha 722 especímenes (56%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. La colección está representada por 9 filos, 13 clases, 29 órdenes, 56 familias... 增加顯示內容

說明

El cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (Cepario LMMA–UIS) es una colección microbiana que cuenta con un total de 1290 especímenes que abarcan los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63), colectados entre 2011 y 2023. Estos fueron crio-preservados (-80 ºC) en glicerol. La mayoría de estos especímenes (97,6%), son productos de la actividad de investigación del Grupo de Investigación en Microbiología y Genética (COL0083849). Una fracción minoritarias (2.4%), son depósitos de otros grupos de investigación o cepas de referencias adquiridas. A la fecha 722 especímenes (56%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. La colección está representada por 9 filos, 13 clases, 29 órdenes, 56 familias, 94 géneros y 138 especies microbianas.

資料紀錄

此資源出現紀錄的資料已發佈為達爾文核心集檔案(DwC-A),其以一或多組資料表構成分享生物多樣性資料的標準格式。 核心資料表包含 1,290 筆紀錄。

亦存在 4 筆延伸集的資料表。延伸集中的紀錄補充核心集中紀錄的額外資訊。 每個延伸集資料表中資料筆數顯示如下。

  • Occurrence (核心)
    1290
  • Preservation 
    2580
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    2580
  • MaterialSample 
    1290
  • Permit 
    1290

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下載

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版本

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如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Fuentes Lorenzo J L (2023): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS. v2.9. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 Universidad Industrial de Santander。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊,並指定以下之GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e。  Universidad Industrial de Santander 發佈此資源,並經由Colombian Biodiversity Information System同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; PERMISO_COLECTA; Occurrence; Specimen

外部資料

此資源尚有其他格式可用

Cepario virtual LMMA-UIS http://cepariolmma.uis.edu.co UTF-8 Página web 1
0047_cepariolmmauis_20210323 https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=0047_cepariolmmauis_20210323 UTF-8 DWC-A 1

聯絡資訊

資源建立者:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Calle 9na y Cra 27
680002 Bucaramanga
Santander
CO
+573042412338

可回覆此資源相關問題者:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Cra 27 y calle 9na
680002 Bucaramanga
Santander
CO
+573042412338

元數據填寫者:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Cra 27 calle 9
680002 Bucaramanga
Santander
CO

地理涵蓋範圍

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo, cuerpos de agua, composta, fermentación del cacao, entre otros.

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [-3.864, -79.277], 緯度北界 經度東界 [11.953, -66.094]

分類群涵蓋範圍

La colección abarca los reinos Bacteria (1227) y Fungi (63). Estos especímenes representan 9 filos microbianos diferentes [Actinomycetota(24), Ascomycota (20), Bacteroidetes (4), Bacillota (51), Basidiomycota (9), Firmicutes (195) y Proteobacteria (354), Pseudomonadota (58) y Thermodesulfobacteriota (7)] y se distribuyen en 94 géneros microbianos. Estos son: Achromobacter (2), Acinetobacter (12), Actinomyces (1), Agrobacterium (1), Alcaligenes (1), Bacillus (174), Beauveria (1), Beijerinckia (5), Bosea (1), Brevibacterium (1), Burkholderia (3), Buttiauxella (4), Byssomerulius (1), Candida (7), Carnobacterium (2), Cedecea (2), Chromobacterium (4), Chryseobacterium (3), Citrobacter (13), Clostridium (9), Comamonas (2), Coniochaeta(1), Corynebacterium (1), Cupriavidus (3), Cutibacterium (10), Cytobacillus(1), Delftia (1), Derxia (1), Desulfotomaculum (3), Desulfovibrio (7), Dictyopanus (1), Edwardsiella (1), Enterobacter (16), Enterococcus (9), Escherichia (18), Ewingella (1), Exiguobacterium (2), Geobacillus (1), Goffeauzyma (1), Halomonas (10), Hannaella (1), Hanseniaspora (1), Hyphodontia (1), Klebsiella (28), Kluyvera (1), Kocuria (2), Lactococcus (5), Leclercia(1), Lelliottia (16), Leuconostoc (2), Listeria (1), Lysinibacillus (7), Marinobacter (11), Mesobacillus (1), Microbacterium (2), Micrococcus (3), Microvirgula (1), Mixta (2), Morganella (2), Naganishia (1),Obesumbacterium (13), Ochrobactrum (6), Paenibacillus (1), Pantoea (2), Paraclostridium (3), Pectobacterium (2), Penicillium (1), Pichia (1), Pleurotus (1), Proteus (2), Providencia (1), Pseudomonas (96), Psychrobacillus (2), Raoultella (3), Rhizobium (2), Rummeliibacillus (3), Saccharomyces (3), Salmonella (2), Serratia (69), Shigella (1), Sporolactobacillus (2), Staphylococcus (11), Stenotrophomonas (2), Streptococcus (1), Streptomyces(1), Thauera (3), Torulaspora (1), Trametes (1), Trichoderma (2), Viridibacillus (1), Wickerhamomyces (1), Yersinia (6), Zobellella (6), Zoogloea (1).

Phylum  Actinobacteria,  Ascomycota,  Bacteroidetes,  Basidiomycota,  Firmicutes,  Proteobacteria

時間涵蓋範圍

起始日期 / 結束日期 2011-01-09 / 2023-02-15

計畫資料

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander). Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado). Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia). Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales). Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

計畫名稱 Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
經費來源 Financiación externa 8864: Gobernación de Santander. Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión. Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión. Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión.

參與計畫的人員:

研究主持人
Jorge Luis Fuentes Lorenzo

取樣方法

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

研究範圍 El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua continentales, presentes en varias localidades de Colombia.
品質控管 El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos geográficos: stateProvince y county.

方法步驟描述:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos.
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

收藏資料

蒐藏名稱 Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
蒐藏編號 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
上層採集品識別碼 Cepario-LMMA-UIS
蒐藏名稱 Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
蒐藏編號 https://www.gbif.org/grscicoll/collection/64bce5dd-1c5a-4c08-a8c2-5147452e206e
上層採集品識別碼 Cepario-LMMA-UIS
標本保存方法 Deep frozen,  Dried
管理單位 在...之間 1 和 3 Crioviales ,  在...之間 1 和 3 Papel filtro

額外的詮釋資料

目的 Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
替代的識別碼 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma