Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

最新バージョン Universidad Industrial de Santander によって公開 Feb 6, 2020 Universidad Industrial de Santander

La colección microbiana o cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental (LMMA) de la Escuela de Biología de la Universidad Industrial de Santander (UIS), tiene su origen la actividad de recolección de muestras de diversos ambientes con fines académicos y de investigación, así como donaciones y compra de cepas de referencia, del Grupo de Investigación de Microbiología y Genética (GIMG).

En total, 695 especímenes (56.5%) cuentan con algún grado de identificación taxonómica. De estos, solo 202 especímenes (~30%), han sido identificados al nivel de especie.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、1,230 レコードが含まれています。 拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

  • Occurrence (コア)
    1230
  • MeasurementOrFact 
    4920
  • Preservation 
    1230

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 1,230 レコード Spanish で (66 KB) - 更新頻度: as needed
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (14 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (13 KB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Fuentes J, Suescún J (2020): Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v2.3. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uq6pal

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Universidad Industrial de Santander。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14eが割り当てられています。   Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversidad Industrial de Santander が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Occurrence; Specimen

連絡先

リソースを作成した人:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

リソースに関する質問に答えることができる人:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

メタデータを記載した人:

Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santader
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santader

他に、リソースに関連付けられていた人:

研究代表者
Jorge Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander
データ提供者
Jhon Suescún
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander

地理的範囲

Los aislados microbianos fueron obtenidos de distintas localidades de Colombia, donde se destacan reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo y cuerpos de agua.

座標(緯度経度) 南 西 [-3.864, -79.277], 北 東 [11.953, -66.094]

生物分類学的範囲

En total, el 56.3 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 16.4 % a nivel de especie.

Phylum  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria,  Ascomycota,  Basidiomycota,  Bacteroidetes

時間的範囲

開始日 / 終了日 2015-01-01 / 2020-01-01

プロジェクトデータ

Proyecto 8864 (Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander) Proyecto 9423 (Modelo geológico del Campo Escuela Colorado) Proyecto 5187 (Estudio de las poblaciones microbianas asociadas con mantos de carbón de la formación Guaduas en Colombia) Proyecto 8162(Evaluación de la capacidad lítica de bacteriófagos relacionados con bacterias sulfato reductoras para el control de procesos de biocorrosión en sistemas industriales) Los proyectos desarrollados abordaron aspectos de la microbiología del subsuelo profundo. Fueron de interés el estudio de consorcios microbianos involucrados en la producción de metano, la biodegradación de hidrocarburos policíclicos aromáticos y la biocorrosión en diferentes ambientes (reservorios de petróleo, minas de carbón, volcanes de lodo).

タイトル Proyectos desarrollados en la Universidad Industrial de Santander
識別子 8864, 9423, 5187, 8162
ファンデイング Financiación externa 8864: Gobernación de Santander Financiación externa 9423: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 5187: Vicerrectoría de Investigación y Extensión Financiación interna 8162: Vicerrectoría de Investigación y Extensión

プロジェクトに携わる要員:

Jorge Fuentes

収集方法

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (tierra, lodo, agua, biofilm, lodo), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Study Extent El área de muestreo es variable e incluye reservorios de petróleo, minas de carbón y volcanes de lodo presentes en varias localidades de Colombia.
Quality Control El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Method step description:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, acetato, etanol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, terrific, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

コレクションデータ

コレクション名 Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
コレクション識別子 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Parent Collection Identifier UIS
標本保存方法 Deep frozen,  Dried
Curatorialユニット 範囲 1 ~ 3 Crioviales ,  範囲 1 ~ 3 Papel filtro

追加のメタデータ

目的 Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
代替識別子 10.15472/uq6pal
95f8be9e-48a3-490b-8bd8-b03cc775b14e
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma