Description
La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 863 records.
2 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.
- Occurrence (core)
- MeasurementOrFacts
- Preservation
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Versions
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2021): Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v1.2. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5nv2wo
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f. Universidad Industrial de Santander publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
Occurrence; Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Observation
External data
The resource data is also available in other formats
| Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA) | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma UTF-8 DWC-A |
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Contacts
Who created the resource:
Who can answer questions about the resource:
Who filled in the metadata:
Who else was associated with the resource:
Geographic Coverage
Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.
| Bounding Coordinates | South West [5.707, -74.526], North East [8.145, -72.473] |
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Taxonomic Coverage
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
| Phylum | Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria, Ascomycota, Basidiomycota, Bacteroidetes |
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Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2018-01-01 / 2019-01-01 |
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Project Data
Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander
| Title | Santander Bio |
|---|---|
| Identifier | Santander_BIO |
| Funding | Financiación externa 8864: Gobernación de Santander |
| Study Area Description | Departamento de Santander, Colombia |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).
| Study Extent | El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia). |
|---|---|
| Quality Control | El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; Elemento temporal: eventDate. |
Method step description:
- Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
- Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
- Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
- Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
- Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.
Collection Data
| Collection Name | Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS |
|---|---|
| Collection Identifier | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241 |
| Parent Collection Identifier | UIS |
| Specimen preservation methods | Deep frozen, Dried |
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| Curatorial Units | Between 1 and 3 Crioviales |
|---|
Additional Metadata
| Purpose | Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas. |
|---|---|
| Alternative Identifiers | 10.15472/5nv2wo |
| afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma_santanderbio |