Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

Latest version published by Universidad Industrial de Santander on Jul 26, 2019 Universidad Industrial de Santander

La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).

En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.

Data Records

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  • Occurrence (core)
    863
  • MeasurementOrFact 
    1726
  • Preservation 
    863

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How to cite

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Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2019): Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v1.0. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5nv2wo

Rights

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The publisher and rights holder of this work is Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

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Keywords

Occurrence; Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Specimen

External data

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Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma UTF-8 DWC-A

Contacts

Who created the resource:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO
Jhon Alexander Suescun Sepulveda
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO

Who can answer questions about the resource:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO
Jhon Alexander Suescun Sepulveda
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO

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Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO
Jhon Alexander Suescun Sepulveda
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO

Who else was associated with the resource:

Principal Investigator
Jorge Luis Fuentes
Director y Curador
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO
Content Provider
Jhon Alexander Suescun Sepulveda
Auxiliar de curación
Universidad Industrial de Santander Cra 27, Calle 9na Bucaramanga Santander CO

Geographic Coverage

Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.

Bounding Coordinates South West [5.707, -74.526], North East [8.145, -72.473]

Taxonomic Coverage

En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.

Phylum  Actinobacteria,  Firmicutes,  Proteobacteria,  Ascomycota,  Basidiomycota,  Bacteroidetes

Temporal Coverage

Start Date / End Date 2018-01-01 / 2019-01-01

Project Data

Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander

Title Santander Bio
Identifier Proyecto 8864
Funding Financiación externa 8864: Gobernación de Santander
Study Area Description Departamento de Santander, Colombia

The personnel involved in the project:

Jorge Luis Fuentes Lorenzo

Sampling Methods

El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).

Study Extent El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
Quality Control El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Method step description:

  1. Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
  2. Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
  3. Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
  4. Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
  5. Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.

Collection Data

Collection Name Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Collection Identifier Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Parent Collection Identifier UIS
Specimen preservation methods Deep frozen,  Dried
Curatorial Units Between 1 and 3 Crioviales

Additional Metadata

Purpose Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.
Alternative Identifiers 10.15472/5nv2wo
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma_santanderbio