Description
La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 863 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
- Occurrence (noyau)
- MeasurementOrFacts
- Preservation
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Téléchargements
Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :
| Données sous forme de fichier DwC-A (zip) | télécharger 863 enregistrements dans Espagnol (40 kB) - Fréquence de mise à jour: quand cela est nécessaire |
|---|---|
| Métadonnées sous forme de fichier EML | télécharger dans Espagnol (16 kB) |
| Métadonnées sous forme de fichier RTF | télécharger dans Espagnol (15 kB) |
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2021): Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v1.2. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5nv2wo
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f. Universidad Industrial de Santander publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.
Mots-clé
Occurrence; Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Observation
Données externes
Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats
| Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA) | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma UTF-8 DWC-A |
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Contacts
Personne ayant créé cette ressource:
Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:
Personne ayant renseigné les métadonnées:
Autres personnes associées à la ressource:
Couverture géographique
Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [5,707, -74,526], Nord Est [8,145, -72,473] |
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Couverture taxonomique
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
| Phylum | Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria, Ascomycota, Basidiomycota, Bacteroidetes |
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Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2018-01-01 / 2019-01-01 |
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Données sur le projet
Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander
| Titre | Santander Bio |
|---|---|
| Identifiant | Santander_BIO |
| Financement | Financiación externa 8864: Gobernación de Santander |
| Description du domaine d'étude / de recherche | Departamento de Santander, Colombia |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).
| Etendue de l'étude | El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia). |
|---|---|
| Contrôle qualité | El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; Elemento temporal: eventDate. |
Description des étapes de la méthode:
- Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
- Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
- Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
- Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
- Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.
Données de collection
| Nom de la collection | Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS |
|---|---|
| Identifiant de collection | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241 |
| Identifiant de la collection parente | UIS |
| Méthode de conservation des spécimens | Deep frozen, Dried |
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| Unités de conservation | Entre (nombre minimal) 1 et (nombre maximal) 3 Crioviales |
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Métadonnées additionnelles
| Objet | Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas. |
|---|---|
| Identifiants alternatifs | 10.15472/5nv2wo |
| afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma_santanderbio |