Descripción
La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 863 registros.
también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
- Occurrence (core)
- MeasurementOrFacts
- Preservation
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Descargas
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Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2021): Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v1.2. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5nv2wo
Derechos
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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad Industrial de Santander. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f. Universidad Industrial de Santander publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.
Palabras clave
Occurrence; Microorganisms; Taxonomy; Geomicrobiology; Observation
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA) | https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma UTF-8 DWC-A |
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Contactos
¿Quién creó el recurso?:
¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:
¿Quién documentó los metadatos?:
¿Quién más está asociado con el recurso?:
Cobertura geográfica
Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [5,707, -74,526], Latitud Máxima Longitud Máxima [8,145, -72,473] |
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Cobertura taxonómica
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
| Filo | Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria, Ascomycota, Basidiomycota, Bacteroidetes |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 2018-01-01 / 2019-01-01 |
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Datos del proyecto
Investigación de la biodiversidad y los servicios ecosistémicos para la gestión integral del territorio. Descubriendo los ecosistemas estratégicos para el fortalecimiento de la gobernanza en el departamento de Santander
| Título | Santander Bio |
|---|---|
| Identificador | Santander_BIO |
| Fuentes de Financiación | Financiación externa 8864: Gobernación de Santander |
| Descripción del área de estudio | Departamento de Santander, Colombia |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).
| Área de Estudio | El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia). |
|---|---|
| Control de Calidad | El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; Elemento temporal: eventDate. |
Descripción de la metodología paso a paso:
- Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
- Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
- Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
- Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
- Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS |
|---|---|
| Identificador de la Colección | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241 |
| Identificador de la Colección Parental | UIS |
| Métodos de preservación de los ejemplares | Congelado, Secado |
|---|
| Unidades curatoriales | Entre 1 y 3 Crioviales |
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Metadatos adicionales
| Propósito | Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas. |
|---|---|
| Identificadores alternativos | 10.15472/5nv2wo |
| afb1b40e-e1e5-4bea-8b19-fbdeb977737f | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma_santanderbio |