Описание
Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción.
En concordancia con la visión de la Universidad EAFIT, la colección de microorganismos tiene como visión contribuir al progreso de la Nación mediante la conservación y el acceso de la colección. Específicamente se proyecta ampliar la colección de microorganismos para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la biodiversidad nativa colombiana y su potencial en diferentes ámbitos industriales.
El objetivo de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT es conservar en condiciones óptimas las cepas microbianas aisladas del territorio nacional con el fin de acceder a su información molecular y bioquímica con fines científicos no comerciales. Adicionalmente se tiene por objetivo fortalecer el Inventario Nacional de la Biodiversidad y difundir el conocimiento científico acerca de la riqueza de microorganismos y su potencial e importancia en los ecosistemas colombianos. El énfasis de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT está inicialmente enfocado a la conservación de bacterias, hongos y levaduras con el fin de investigar su potencial en diferentes áreas de la industria: agrícola, alimentos y química.
El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos (RR.BB) colectados en los departamentos de Antioquia y Caldas, desde el año 2014 al 2019. Los RR.BB se encuentran distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 994 записей.
Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
- Occurrence (core)
- Permit
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Загрузки
Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Villegas-Escobar V, Londoño F (2023): Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). v2.5. Universidad EAFIT. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5br1gx
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Universidad EAFIT. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1. Universidad EAFIT отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Colombian Biodiversity Information System.
Ключевые слова
Microorganismos; bacterias; levaduras; Occurrence; Specimen
Внешние данные
Ресурс также доступен в других форматах
1566_microorganismosendofitos_20170303 | http://ipt.sibcolombia.net/cr-sib/resource.do?r=1566_microorganismosendofitos_20170303 UTF-8 DWC-A |
---|
Контакты
Кто является создателем ресурса:
Кто может ответить на вопросы о ресурсе:
Кем заполнены метаданные:
Кто еще связан с данным ресурсом:
Географический охват
Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko en la Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad en la Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407".
Ограничивающие координаты | Юг Запад [5,077, -76,667], Север Восток [7,914, -75,367] |
---|
Таксономический охват
El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos, distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino. Microorganismos (Bacterias y Levaduras). Filo Proteobacteria (familias: Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Xanthomonadaceae). Filo Actinobacteria (familias Microbacteriaceae, Mycobacteriaceae). Filo Firmicutes (familia: Bacillaceae) Filo Bacteriodetes (familia: Flavobacteriaceae)
Genus | Xhantomonas (Xhantomonas), Variovorax (Variovorax), Rhizobium (Rhizobium), Bacillus (Bacillus), Microbacterium (Microbacterium), Stenotrophomonas (Stenotrophomonas), Pantoea (Pantoea), Curtobacterium (Curtobacterium), Enterobacter (Enterobacter), Candida (Candida), Acitenobacter (Acitenobacter), Herbaspirillum (Herbaspirillum), Rhodotorula (Rhodotorula), Methylobacterium (Methylobacterium), Acinetobacter (Acinetobacter), Staphylococcus (Staphylococcus), Paenibacillus (Paenibacillus) |
---|
Временной охват
Дата начала / Дата окончания | 2014-12-26 / 2019-03-10 |
---|
Данные проекта
Se colectaron en dos proyectos: 1)Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.
Название | Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano. |
---|---|
Финансирование | EAFIT-AUGURA y Colciencias |
Описание района исследования | La investigación se desarrolló en la Universidad EAFIT - Medellín - Colombia |
Исполнители проекта:
Методы сбора
Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia.
Охват исследования | Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). |
---|
Описание этапа методики:
- Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido.
- Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE.
- Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO4*7H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO4*7H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0).
- Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica.
Данные коллекции
Название коллекции | Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp. |
---|---|
Идентификатор коллекции | Registro Nacional de Colecciones Biológicas:226 |
Идентификатор родительской коллекции | EA-ED |
Методы сохранения образцов | Deep frozen |
---|
Дополнительные метаданные
[autoridad]ANLA[numero]Resolución 1566[titular]Universidad EAFIT[nit o cedula]890901389-5[fecha]2014-12-24
Альтернативные идентификаторы | 10.15472/5br1gx |
---|---|
6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1 | |
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=eafit_endofitos_musa |