OCCURRENCE

Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp)

Dernière version Publié par Universidad EAFIT le 27 décembre 2023 Universidad EAFIT
Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción.... plus
Date de publication:
27 décembre 2023
Hébergé par:
Universidad EAFIT
Licence:
CC-BY-NC 4.0

Description

Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción.

En concordancia con la visión de la Universidad EAFIT, la colección de microorganismos tiene como visión contribuir al progreso de la Nación mediante la conservación y el acceso de la colección. Específicamente se proyecta ampliar la colección de microorganismos para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la biodiversidad nativa colombiana y su potencial en diferentes ámbitos industriales.

El objetivo de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT es conservar en condiciones óptimas las cepas microbianas aisladas del territorio nacional con el fin de acceder a su información molecular y bioquímica con fines científicos no comerciales. Adicionalmente se tiene por objetivo fortalecer el Inventario Nacional de la Biodiversidad y difundir el conocimiento científico acerca de la riqueza de microorganismos y su potencial e importancia en los ecosistemas colombianos. El énfasis de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT está inicialmente enfocado a la conservación de bacterias, hongos y levaduras con el fin de investigar su potencial en diferentes áreas de la industria: agrícola, alimentos y química.

El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos (RR.BB) colectados en los departamentos de Antioquia y Caldas, desde el año 2014 al 2019. Los RR.BB se encuentran distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 994 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

  • Occurrence (noyau)
    994
  • Permit 
    994

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Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Villegas-Escobar V, Londoño F (2023): Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). v2.5. Universidad EAFIT. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5br1gx

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Universidad EAFIT. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1.  Universidad EAFIT publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.

Mots-clé

Microorganismos; bacterias; levaduras; Occurrence; Specimen

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
Medellín
Antioquia
CO
4 2619500
Felix Londoño
Dirección de Investigación
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9823
http://www.eafit.edu.co/docentes-investigadores/Paginas/valeska-villegas.aspx
Yehimy Xilena Rueda Isaza
Analista de laboratorio en Colecciones Biológicas
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9921

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor Titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9823
http://www.eafit.edu.co/docentes-investigadores/Paginas/valeska-villegas.aspx
Yehimy Xilena Rueda Isaza
Analista de laboratorio en Colecciones Biológicas
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9921

Autres personnes associées à la ressource:

Personne de Contact
Sebastian Zapata Henao
Director de Cenibanano
Asociación de Bananeros de Colombia - Augura
Calle 3 sur # 41-65
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 5403480

Couverture géographique

Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko en la Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad en la Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407".

Enveloppe géographique Sud Ouest [5,077, -76,667], Nord Est [7,914, -75,367]

Couverture taxonomique

El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos, distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino. Microorganismos (Bacterias y Levaduras). Filo Proteobacteria (familias: Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Xanthomonadaceae). Filo Actinobacteria (familias Microbacteriaceae, Mycobacteriaceae). Filo Firmicutes (familia: Bacillaceae) Filo Bacteriodetes (familia: Flavobacteriaceae)

Genus  Xhantomonas (Xhantomonas),  Variovorax (Variovorax),  Rhizobium (Rhizobium),  Bacillus (Bacillus),  Microbacterium (Microbacterium),  Stenotrophomonas (Stenotrophomonas),  Pantoea (Pantoea),  Curtobacterium (Curtobacterium),  Enterobacter (Enterobacter),  Candida (Candida),  Acitenobacter (Acitenobacter),  Herbaspirillum (Herbaspirillum),  Rhodotorula (Rhodotorula),  Methylobacterium (Methylobacterium),  Acinetobacter (Acinetobacter),  Staphylococcus (Staphylococcus),  Paenibacillus (Paenibacillus)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2014-12-26 / 2019-03-10

Données sur le projet

Se colectaron en dos proyectos: 1)Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.

Titre Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.
Financement EAFIT-AUGURA y Colciencias
Description du domaine d'étude / de recherche La investigación se desarrolló en la Universidad EAFIT - Medellín - Colombia

Les personnes impliquées dans le projet:

Chercheur Principal
Valeska Villegas-Escobar

Méthodes d'échantillonnage

Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia.

Etendue de l'étude Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp).

Description des étapes de la méthode:

  1. Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido.
  2. Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE.
  3. Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO4*7H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO4*7H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0).
  4. Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica.

Données de collection

Nom de la collection Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp.
Identifiant de collection Registro Nacional de Colecciones Biológicas:226
Identifiant de la collection parente EA-ED
Méthode de conservation des spécimens Deep frozen

Métadonnées additionnelles

[autoridad]ANLA[numero]Resolución 1566[titular]Universidad EAFIT[nit o cedula]890901389-5[fecha]2014-12-24

Identifiants alternatifs 10.15472/5br1gx
6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=eafit_endofitos_musa