OCCURRENCE

Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp)

最新バージョン Universidad EAFIT によって公開 2023/12/27 Universidad EAFIT
Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción.... 以上

説明

Nuestra colección de microorganismos busca albergar nuevos microorganismos de bacterias, levaduras y hongos obtenidos de diferentes ambientes. Los microorganismos son los organismos más numerosos y diversos del universo los cuales juegan un papel muy importante en el equilibrio de los ecosistemas. Los microorganismos son organismos unicelulares pequeños que solo pueden visualizarse al microscopio. Se pueden clasificar como bacterias, arqueas, eucariotes. Los virus también son clasificados como microorganismos, pero requieren de un hospedero para su reproducción.

En concordancia con la visión de la Universidad EAFIT, la colección de microorganismos tiene como visión contribuir al progreso de la Nación mediante la conservación y el acceso de la colección. Específicamente se proyecta ampliar la colección de microorganismos para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la biodiversidad nativa colombiana y su potencial en diferentes ámbitos industriales.

El objetivo de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT es conservar en condiciones óptimas las cepas microbianas aisladas del territorio nacional con el fin de acceder a su información molecular y bioquímica con fines científicos no comerciales. Adicionalmente se tiene por objetivo fortalecer el Inventario Nacional de la Biodiversidad y difundir el conocimiento científico acerca de la riqueza de microorganismos y su potencial e importancia en los ecosistemas colombianos. El énfasis de la colección de microorganismos de la Universidad EAFIT está inicialmente enfocado a la conservación de bacterias, hongos y levaduras con el fin de investigar su potencial en diferentes áreas de la industria: agrícola, alimentos y química.

El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos (RR.BB) colectados en los departamentos de Antioquia y Caldas, desde el año 2014 al 2019. Los RR.BB se encuentran distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、994 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

  • Occurrence (コア)
    994
  • Permit 
    994

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ダウンロード

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DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 994 レコード Spanish で (35 kB) - 更新頻度: unknown
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バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Villegas-Escobar V, Londoño F (2023): Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp). v2.5. Universidad EAFIT. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5br1gx

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Universidad EAFIT。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1が割り当てられています。   Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversidad EAFIT が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Microorganismos; bacterias; levaduras; Occurrence; Specimen

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

連絡先

リソースを作成した人:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
Medellín
Antioquia
CO
4 2619500
Felix Londoño
Dirección de Investigación
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500

リソースに関する質問に答えることができる人:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9823
http://www.eafit.edu.co/docentes-investigadores/Paginas/valeska-villegas.aspx
Yehimy Xilena Rueda Isaza
Analista de laboratorio en Colecciones Biológicas
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9921

メタデータを記載した人:

Valeska Villegas-Escobar
Profesor Titular
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9823
http://www.eafit.edu.co/docentes-investigadores/Paginas/valeska-villegas.aspx
Yehimy Xilena Rueda Isaza
Analista de laboratorio en Colecciones Biológicas
Universidad EAFIT
Carrera 49 No 7 Sur 50
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 2619500 Ext. 9921

他に、リソースに関連付けられていた人:

連絡先
Sebastian Zapata Henao
Director de Cenibanano
Asociación de Bananeros de Colombia - Augura
Calle 3 sur # 41-65
050022 Medellín
Antioquia
CO
(604) 5403480

地理的範囲

Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko en la Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad en la Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407".

座標(緯度経度) 南 西 [5.077, -76.667], 北 東 [7.914, -75.367]

生物分類学的範囲

El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos, distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino. Microorganismos (Bacterias y Levaduras). Filo Proteobacteria (familias: Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Xanthomonadaceae). Filo Actinobacteria (familias Microbacteriaceae, Mycobacteriaceae). Filo Firmicutes (familia: Bacillaceae) Filo Bacteriodetes (familia: Flavobacteriaceae)

Genus  Xhantomonas (Xhantomonas),  Variovorax (Variovorax),  Rhizobium (Rhizobium),  Bacillus (Bacillus),  Microbacterium (Microbacterium),  Stenotrophomonas (Stenotrophomonas),  Pantoea (Pantoea),  Curtobacterium (Curtobacterium),  Enterobacter (Enterobacter),  Candida (Candida),  Acitenobacter (Acitenobacter),  Herbaspirillum (Herbaspirillum),  Rhodotorula (Rhodotorula),  Methylobacterium (Methylobacterium),  Acinetobacter (Acinetobacter),  Staphylococcus (Staphylococcus),  Paenibacillus (Paenibacillus)

時間的範囲

開始日 / 終了日 2014-12-26 / 2019-03-10

プロジェクトデータ

Se colectaron en dos proyectos: 1)Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.

タイトル Desarrollo de dos estrategias biotecnológicas para el control de Ralstonia solanacearum, agente causal de la enfermedad del Moko en Musa spp. , 2) Efecto de la aplicación de rizobacterias en el microbioma, desarrollo y sanidad de plantas de banano.
ファンデイング EAFIT-AUGURA y Colciencias
Study Area Description La investigación se desarrolló en la Universidad EAFIT - Medellín - Colombia

プロジェクトに携わる要員:

研究代表者
Valeska Villegas-Escobar

収集方法

Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia.

Study Extent Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp).

Method step description:

  1. Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido.
  2. Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE.
  3. Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO4*7H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO4*7H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0).
  4. Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica.

コレクションデータ

コレクション名 Colección de microorganismos endófitos aislados de Musa sp.
コレクション識別子 Registro Nacional de Colecciones Biológicas:226
Parent Collection Identifier EA-ED
標本保存方法 Deep frozen

追加のメタデータ

[autoridad]ANLA[numero]Resolución 1566[titular]Universidad EAFIT[nit o cedula]890901389-5[fecha]2014-12-24

代替識別子 10.15472/5br1gx
6d9c888a-b651-401a-a59b-edc50be157f1
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=eafit_endofitos_musa