説明
La Pontificia Universidad Javeriana cuenta con una colección de microorganismos de interés clínico, biotecnológico, industrial y ambiental, que nace de la necesidad de implementar métodos de conservación que permiten garantizar la viabilidad de las cepas de estudio de importantes proyectos de investigación y docencia, pertenecientes al Departamento de Microbiología de la Facultad de Ciencias Básicas, por largos periodos de tiempo. Es una de las pocas colecciones que presta servicios a otras universidades de Colombia y es la única colección en Colombia que ofrece servicios como la identificación fenotípica, liofilización de bacterias, depósito y mantenimiento de las cepas.
La colección posee un número importante de cepas de origen ambiental y sigue aumentando sus esfuerzos para conservar aún más microorganismos, ya que Colombia es el segundo país del mundo con los mayores recursos naturales de la biodiversidad en términos de flora y fauna. La CMPUJ se encuentra registrada con el número 857 de la WFCC, se puede consultar la información por la página general de la WFCC http://www.wfcc.info/ y cuenta con 847 registros biológicos de los cuales 588 se encuentran en colección.
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、846 レコードが含まれています。
拡張データ テーブルは4 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。
- Occurrence (コア)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Loan
- Multimedia
この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。
ダウンロード
DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード：
バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Alvarado Fernández A M, Rodríguez Gómez E R, Palacios Calderón L M, Trespalacios Rangel A A, Ballesteros Ballesteros J A (2023): Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana. v1.8. Pontificia Universidad Javeriana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ppbz1y
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Pontificia Universidad Javeriana。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5が割り当てられています。 Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているPontificia Universidad Javeriana が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Microorganismos; Bacterias; Hongos filamentosos; Levaduras; Archaeas; Specimen; Occurrence
連絡先
リソースを作成した人:
リソースに関する質問に答えることができる人:
メタデータを記載した人:
地理的範囲
Los datos registrados abarcan todo el territorio colombiano, incluyendo departamentos como: Cundinamarca, Boyacá, Antioquia, entre otros; provenientes de diferentes fuentes de aislamiento.
| 座標（緯度経度） | 南 西 [-4.434, -79.014], 北 東 [12.64, -66.709] |
|---|
生物分類学的範囲
Actualmente, en colección se tienen 588 especímenes. Para los hongos hay 48 géneros y 43 especies, para las bacterias 88 géneros y 155 especies y para las arqueas cuatro géneros y cinco especies; entre las que se encuentran hongos, bacterias y archaeas con diferentes características, como: las nitrificadoras, productoras de enzimas, de ambientes extremos, con condiciones anaerobias, con diferentes perfiles de susceptibilidad, entre otros. Adicionalmente, se documenta el historial de microorganismos que han estado en la colección y actualmente están dados de baja, teniendo para hongos 15 géneros, para bacterias 65 géneros y cuatro para arqueas.
| Phylum | Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Synergistetes, Thermotogae, Deinococcus-thermus, Ascomycota, Basidiomycota, Zygomycota |
|---|---|
| Class | Halobacteria, Methanomicrobia, Methanobacteria, Thermoplasmata |
時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2002-01-01 / 2022-03-10 |
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収集方法
La colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ), agrupa múltiples muestreos, en los cuales podemos encontrar, muestreos sobre humanos, suelo, nematodos, plantas, entre otros.
| Study Extent | El área de estudio abarca todo el territorio colombiano. |
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Method step description:
- A continuación, se detalla el procedimiento para el ingreso de cepas a la colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ): 1. Solicitud de depósito al correo de las encargadas de la colección
- Solicitud y revisión de documentación solicitada (Carta formal solicitando el servicio de depósito, copia del permiso de colecta (obligatorio) y del permiso de acceso a recursos genéticos (si aplica), copia de reporte “relación de material recolectado” realizado frente a al ANLA, copia del certificado de la publicación de los datos en el Sistema de Información de Biodiversidad – SiB, plantilla DarwinCore diligenciada como se envió al SiB, formulario de depósito para el ingreso de las cepas a la colección, información asociada al microorganismo (descripciones, fotos si se tienen, secuencias, bioquímicas, etc).
- Recepción del cultivo (2 cajas con medio de cultivo óptimo para el microorganismo y 3 viales con el método de conservación utilizado por el depositante) y asignación de un código CMPUJ por parte de la colección.
- Revisión y autenticación del cultivo microbiano (evaluación de pureza y viabilidad) contrastando los resultados con el cultivo de caja y la información que envió el depositante.
- Selección del método de conservación más adecuado para el microorganismo.
- Elaboración de bancos, en donde se enviarán copias al depositante para su verificación junto con el formato respectivo.
- Depósito en la colección, en donde se emite un certificado de depósito de la CMPUJ para los microrganismos una vez estén conservados.
- Seguimiento de la pureza y viabilidad, monitoreados a los 3 meses, 6 meses, 12 meses, y de ahí en adelante anualmente hasta llegar a los años estipulados según la modalidad del depósito.
コレクションデータ
| コレクション名 | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| コレクション識別子 | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 148 |
| Parent Collection Identifier | CMPUJ |
| コレクション名 | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| コレクション識別子 | https://www.gbif.org/grscicoll/collection/15d34b06-81d4-4c94-9f4d-6cfe39490817 |
| Parent Collection Identifier | CMPUJ |
| 標本保存方法 | Refrigerated, Freeze-dried, Deep frozen |
|---|
追加のメタデータ
| 目的 | Compartir información relacionada con los microorganismos depositados en la colección, los cuales representan una parte de la biodiversidad de Colombia. Por otro lado, informar que microorganismos existen en la colección para entablar futuros convenios. |
|---|---|
| メンテナンス内容 | Cada vez que se requiera ya que esta relacionado con la cantidad de microorganismos que ingresen a la colección. |
| 代替識別子 | 10.15472/ppbz1y |
| 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cmpuj |