Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana

Última versión Publicado por Pontificia Universidad Javeriana en Jul 3, 2019 Pontificia Universidad Javeriana

La Pontificia Universidad Javeriana cuenta con una colección de microorganismos de interés clínico, biotecnológico, industrial y ambiental, que nace de la necesidad de implementar métodos de conservación que permiten garantizar la viabilidad de las cepas de estudio de importantes proyectos de investigación y docencia, pertenecientes al Departamento de Microbiología de la Facultad de Ciencias Básicas, por largos periodos de tiempo. Es una de las pocas colecciones que presta servicios a otras universidades de Colombia y es la única colección en Colombia que ofrece servicios como la identificación fenotípica, liofilización de bacterias, depósito y mantenimiento de las cepas. La colección posee un número importante de cepas de origen ambiental y sigue aumentando sus esfuerzos para conservar aún más microorganismos, ya que Colombia es el segundo país del mundo con los mayores recursos naturales de la biodiversidad en términos de flora y fauna. La CMPUJ se encuentra registrada con el número 857 de la WFCC y se puede consultar la información por la página general de la WFCC http://www.wfcc.info/ .

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 766 registros. también existen 5 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    766
  • Preservation 
    2298
  • MeasurementOrFact 
    2298
  • Loan 
    766
  • ResourceRelationship 
    766
  • Multimedia 
    61

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 766 registros en Español (61 KB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Alvarado Fernández A M, Rodríguez Gómez E R, Palacios Calderón L M, Trespalacios Rangel A A (2019): Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana. v1.3. Pontificia Universidad Javeriana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ppbz1y

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Pontificia Universidad Javeriana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5.  Pontificia Universidad Javeriana publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

Occurrence; Microorganismos; bacterias; hongos filamentosos; levaduras; archaeas; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Angela María Alvarado Fernández
Curadora de hongos
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4187
Eliana Rocio Rodríguez Gómez
Curadora de bacterias
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4107
Laura Milena Palacios Calderón
Estudiante-pasante
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4107
Alba Alicia Trespalacios Rangel
Directora de la colección
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4047

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Alba Alicia Trespalacios Rangel
Directora de la colección
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4047
Eliana Rocio Rodríguez Gómez
Curadora de bacterias
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4107
Angela María Alvarado Fernández
Curadora de hongos
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4187

¿Quién documentó los metadatos?:

Angela María Alvarado Fernández
Curadora de hongos
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4187
Eliana Rocio Rodríguez Gómez
Curadora de bacterias
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca 3208320 ext. 4107
Laura Milena Palacios Calderón
Estudiante-pasante
Pontificia Universidad Javeriana Carrera 7 No. 43 - 82, Edificio 50 110231 Bogotá Cundinamarca CO 3208320 ext. 4107

Cobertura Geográfica

Los datos registrados abarcan todo el territorio colombiano, incluyendo departamentos como: cundinamarca, Boyacá, Antioquia, entre otros; provenientes de diferentes fuentes de aislamiento.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-4.434, -79.014], Latitud Máxima Longitud Máxima [12.64, -66.709]

Cobertura Taxonómica

Actualmente, en colección se tienen 522 especímenes. Para los hongos hay 32 géneros y 31 especies y para las bacterias 19 géneros y 136 especies; entre las que se encuentran hongos, bacterias-archaeas con diferentes características, como: las nitrificadoras, productoras de enzimas, de ambientes extremos, con condiciones anaerobias, con diferentes perfiles de susceptibilidad, entre otros. Adicionalmente, se documenta el historial de microorganismos que han estado en la colección y actualmente están dados de baja; teniendo para hongos 7 géneros y 9 especies, y para bacterias 15 géneros y 82 especies.

Familia  Enterobacteriaceae,  Staphylococcaceae,  Saccharomycetaceae,  Aspergillaceae,  Methanospirillaceae

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2002-01-09 / 2018-10-19

Métodos de Muestreo

La colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ), agrupa múltiples muestreos, en los cuales podemos encontrar, muestreos sobre humanos, suelo, nematodos, plantas, entre otros.

Área de Estudio El área de estudio abarca todo el territorio colombiano.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. PROCEDIMIENTO PARA EL INGRESO DE CEPAS A LA COLECCIÓN DE MICROORGANISMOS DE LA PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA (CMPUJ)
  2. 1. solicitud de depósito al correo de las encargadas de la colección
  3. 2. Solicitud y revisión de documentación solicitada (Carta formal solicitando el servicio de depósito, copia del permiso de colecta (obligatorio) y del permiso de acceso a recursos genéticos (si aplica), copia de reporte “relación de material recolectado” realizado frente a al ANLA, copia del certificado de la publicación de los datos en el Sistema de Información de Biodiversidad – SiB, plantilla DarwinCore diligenciada como se envió al SiB, formulario de depósito para el ingreso de las cepas a la colección, información asociada al microorganismo (descripciones, fotos si se tienen, secuencias, bioquímicas, etc))
  4. 3. Recepción del cultivo (2 cajas con medio de cultivo óptimo para el microorganismo y 3 viales con el método de conservación utilizado por el depositante) y asignación de un código CMPUJ por parte de la colección.
  5. 4. Revisión y autenticación del cultivo microbiano (evaluación de pureza y viabilidad) contrastando los resultados con el cultivo de caja y la información que envió el depositante.
  6. 5. Selección del método de conservación más adecuado para el microorganismo
  7. 6. Elaboración de bancos, en donde se enviaran copias al depositante para su verificación junto con el formato respectivo.
  8. 7. Depósito en la colección, en donde se emite un certificado de deposito de la CMPUJ para los micorrganismo una vez estén conservados
  9. 8. Seguimiento de la pureza y viabilidad, monitoreados a los 3 meses, 6 meses, 12 meses, y de ahí en adelante anualmente hasta llegar a los años estipulados según la modalidad del deposito.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Colección de Microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones 148
Identificador de la Colección Parental CMPUJ
Métodos de preservación de los ejemplares Refrigerado,  Liofilizado,  Congelado

Metadatos Adicionales

Propósito Compartir información relacionada con los microorganismos depositados en la colección, los cuales representan una parte de la biodiversidad de Colombia. Por otro lado, informar que microorganismos existen en la colección para entablar futuros convenios.
Descripción de mantenimiento Cada vez que se requiera ya que esta relacionado con la cantidad de microorganismos que ingresen a la colección.
Identificadores Alternativos 10.15472/ppbz1y
9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cmpuj