Description
La Pontificia Universidad Javeriana cuenta con una colección de microorganismos de interés clínico, biotecnológico, industrial y ambiental, que nace de la necesidad de implementar métodos de conservación que permiten garantizar la viabilidad de las cepas de estudio de importantes proyectos de investigación y docencia, pertenecientes al Departamento de Microbiología de la Facultad de Ciencias Básicas, por largos periodos de tiempo. Es una de las pocas colecciones que presta servicios a otras universidades de Colombia y es la única colección en Colombia que ofrece servicios como la identificación fenotípica, liofilización de bacterias, depósito y mantenimiento de las cepas.
La colección posee un número importante de cepas de origen ambiental y sigue aumentando sus esfuerzos para conservar aún más microorganismos, ya que Colombia es el segundo país del mundo con los mayores recursos naturales de la biodiversidad en términos de flora y fauna. La CMPUJ se encuentra registrada con el número 857 de la WFCC, se puede consultar la información por la página general de la WFCC http://www.wfcc.info/ y cuenta con 847 registros biológicos de los cuales 588 se encuentran en colección.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 846 enregistrements.
4 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
- Occurrence (noyau)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Loan
- Multimedia
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Téléchargements
Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :
| Données sous forme de fichier DwC-A (zip) | télécharger 846 enregistrements dans Espagnol (79 kB) - Fréquence de mise à jour: quand cela est nécessaire |
|---|---|
| Métadonnées sous forme de fichier EML | télécharger dans Espagnol (22 kB) |
| Métadonnées sous forme de fichier RTF | télécharger dans Espagnol (17 kB) |
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Alvarado Fernández A M, Rodríguez Gómez E R, Palacios Calderón L M, Trespalacios Rangel A A, Ballesteros Ballesteros J A (2023): Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana. v1.8. Pontificia Universidad Javeriana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ppbz1y
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Pontificia Universidad Javeriana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5. Pontificia Universidad Javeriana publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.
Mots-clé
Microorganismos; Bacterias; Hongos filamentosos; Levaduras; Archaeas; Specimen; Occurrence
Contacts
Personne ayant créé cette ressource:
Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:
Personne ayant renseigné les métadonnées:
Couverture géographique
Los datos registrados abarcan todo el territorio colombiano, incluyendo departamentos como: Cundinamarca, Boyacá, Antioquia, entre otros; provenientes de diferentes fuentes de aislamiento.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-4,434, -79,014], Nord Est [12,64, -66,709] |
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Couverture taxonomique
Actualmente, en colección se tienen 588 especímenes. Para los hongos hay 48 géneros y 43 especies, para las bacterias 88 géneros y 155 especies y para las arqueas cuatro géneros y cinco especies; entre las que se encuentran hongos, bacterias y archaeas con diferentes características, como: las nitrificadoras, productoras de enzimas, de ambientes extremos, con condiciones anaerobias, con diferentes perfiles de susceptibilidad, entre otros. Adicionalmente, se documenta el historial de microorganismos que han estado en la colección y actualmente están dados de baja, teniendo para hongos 15 géneros, para bacterias 65 géneros y cuatro para arqueas.
| Phylum | Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Synergistetes, Thermotogae, Deinococcus-thermus, Ascomycota, Basidiomycota, Zygomycota |
|---|---|
| Class | Halobacteria, Methanomicrobia, Methanobacteria, Thermoplasmata |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2002-01-01 / 2022-03-10 |
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Méthodes d'échantillonnage
La colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ), agrupa múltiples muestreos, en los cuales podemos encontrar, muestreos sobre humanos, suelo, nematodos, plantas, entre otros.
| Etendue de l'étude | El área de estudio abarca todo el territorio colombiano. |
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Description des étapes de la méthode:
- A continuación, se detalla el procedimiento para el ingreso de cepas a la colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ): 1. Solicitud de depósito al correo de las encargadas de la colección
- Solicitud y revisión de documentación solicitada (Carta formal solicitando el servicio de depósito, copia del permiso de colecta (obligatorio) y del permiso de acceso a recursos genéticos (si aplica), copia de reporte “relación de material recolectado” realizado frente a al ANLA, copia del certificado de la publicación de los datos en el Sistema de Información de Biodiversidad – SiB, plantilla DarwinCore diligenciada como se envió al SiB, formulario de depósito para el ingreso de las cepas a la colección, información asociada al microorganismo (descripciones, fotos si se tienen, secuencias, bioquímicas, etc).
- Recepción del cultivo (2 cajas con medio de cultivo óptimo para el microorganismo y 3 viales con el método de conservación utilizado por el depositante) y asignación de un código CMPUJ por parte de la colección.
- Revisión y autenticación del cultivo microbiano (evaluación de pureza y viabilidad) contrastando los resultados con el cultivo de caja y la información que envió el depositante.
- Selección del método de conservación más adecuado para el microorganismo.
- Elaboración de bancos, en donde se enviarán copias al depositante para su verificación junto con el formato respectivo.
- Depósito en la colección, en donde se emite un certificado de depósito de la CMPUJ para los microrganismos una vez estén conservados.
- Seguimiento de la pureza y viabilidad, monitoreados a los 3 meses, 6 meses, 12 meses, y de ahí en adelante anualmente hasta llegar a los años estipulados según la modalidad del depósito.
Données de collection
| Nom de la collection | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| Identifiant de collection | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 148 |
| Identifiant de la collection parente | CMPUJ |
| Nom de la collection | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| Identifiant de collection | https://www.gbif.org/grscicoll/collection/15d34b06-81d4-4c94-9f4d-6cfe39490817 |
| Identifiant de la collection parente | CMPUJ |
| Méthode de conservation des spécimens | Refrigerated, Freeze-dried, Deep frozen |
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Métadonnées additionnelles
| Objet | Compartir información relacionada con los microorganismos depositados en la colección, los cuales representan una parte de la biodiversidad de Colombia. Por otro lado, informar que microorganismos existen en la colección para entablar futuros convenios. |
|---|---|
| Description de la fréquence de mise à jour | Cada vez que se requiera ya que esta relacionado con la cantidad de microorganismos que ingresen a la colección. |
| Identifiants alternatifs | 10.15472/ppbz1y |
| 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cmpuj |