Descrição
La Pontificia Universidad Javeriana cuenta con una colección de microorganismos de interés clínico, biotecnológico, industrial y ambiental, que nace de la necesidad de implementar métodos de conservación que permiten garantizar la viabilidad de las cepas de estudio de importantes proyectos de investigación y docencia, pertenecientes al Departamento de Microbiología de la Facultad de Ciencias Básicas, por largos periodos de tiempo. Es una de las pocas colecciones que presta servicios a otras universidades de Colombia y es la única colección en Colombia que ofrece servicios como la identificación fenotípica, liofilización de bacterias, depósito y mantenimiento de las cepas.
La colección posee un número importante de cepas de origen ambiental y sigue aumentando sus esfuerzos para conservar aún más microorganismos, ya que Colombia es el segundo país del mundo con los mayores recursos naturales de la biodiversidad en términos de flora y fauna. La CMPUJ se encuentra registrada con el número 857 de la WFCC, se puede consultar la información por la página general de la WFCC http://www.wfcc.info/ y cuenta con 847 registros biológicos de los cuales 588 se encuentran en colección.
Registros de Dados
Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 846 registros.
Também existem 4 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.
- Occurrence (core)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Loan
- Multimedia
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Downloads
Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:
Versões
A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.
Como citar
Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:
Alvarado Fernández A M, Rodríguez Gómez E R, Palacios Calderón L M, Trespalacios Rangel A A, Ballesteros Ballesteros J A (2023): Colección de Microorganismos-Pontificia Universidad Javeriana. v1.8. Pontificia Universidad Javeriana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ppbz1y
Direitos
Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:
O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Pontificia Universidad Javeriana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5. Pontificia Universidad Javeriana publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Colombian Biodiversity Information System.
Palavras-chave
Microorganismos; Bacterias; Hongos filamentosos; Levaduras; Archaeas; Specimen; Occurrence
Contatos
Quem criou esse recurso:
Quem pode responder a perguntas sobre o recurso:
Quem preencher os metadados:
Cobertura Geográfica
Los datos registrados abarcan todo el territorio colombiano, incluyendo departamentos como: Cundinamarca, Boyacá, Antioquia, entre otros; provenientes de diferentes fuentes de aislamiento.
| Coordenadas delimitadoras | Sul Oeste [-4,434, -79,014], Norte Leste [12,64, -66,709] |
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Cobertura Taxonômica
Actualmente, en colección se tienen 588 especímenes. Para los hongos hay 48 géneros y 43 especies, para las bacterias 88 géneros y 155 especies y para las arqueas cuatro géneros y cinco especies; entre las que se encuentran hongos, bacterias y archaeas con diferentes características, como: las nitrificadoras, productoras de enzimas, de ambientes extremos, con condiciones anaerobias, con diferentes perfiles de susceptibilidad, entre otros. Adicionalmente, se documenta el historial de microorganismos que han estado en la colección y actualmente están dados de baja, teniendo para hongos 15 géneros, para bacterias 65 géneros y cuatro para arqueas.
| Filo | Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Bacteroidetes, Synergistetes, Thermotogae, Deinococcus-thermus, Ascomycota, Basidiomycota, Zygomycota |
|---|---|
| Class | Halobacteria, Methanomicrobia, Methanobacteria, Thermoplasmata |
Cobertura Temporal
| Data Inicial / Data final | 2002-01-01 / 2022-03-10 |
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Métodos de Amostragem
La colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ), agrupa múltiples muestreos, en los cuales podemos encontrar, muestreos sobre humanos, suelo, nematodos, plantas, entre otros.
| Área de Estudo | El área de estudio abarca todo el territorio colombiano. |
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Descrição dos passos do método:
- A continuación, se detalla el procedimiento para el ingreso de cepas a la colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana (CMPUJ): 1. Solicitud de depósito al correo de las encargadas de la colección
- Solicitud y revisión de documentación solicitada (Carta formal solicitando el servicio de depósito, copia del permiso de colecta (obligatorio) y del permiso de acceso a recursos genéticos (si aplica), copia de reporte “relación de material recolectado” realizado frente a al ANLA, copia del certificado de la publicación de los datos en el Sistema de Información de Biodiversidad – SiB, plantilla DarwinCore diligenciada como se envió al SiB, formulario de depósito para el ingreso de las cepas a la colección, información asociada al microorganismo (descripciones, fotos si se tienen, secuencias, bioquímicas, etc).
- Recepción del cultivo (2 cajas con medio de cultivo óptimo para el microorganismo y 3 viales con el método de conservación utilizado por el depositante) y asignación de un código CMPUJ por parte de la colección.
- Revisión y autenticación del cultivo microbiano (evaluación de pureza y viabilidad) contrastando los resultados con el cultivo de caja y la información que envió el depositante.
- Selección del método de conservación más adecuado para el microorganismo.
- Elaboración de bancos, en donde se enviarán copias al depositante para su verificación junto con el formato respectivo.
- Depósito en la colección, en donde se emite un certificado de depósito de la CMPUJ para los microrganismos una vez estén conservados.
- Seguimiento de la pureza y viabilidad, monitoreados a los 3 meses, 6 meses, 12 meses, y de ahí en adelante anualmente hasta llegar a los años estipulados según la modalidad del depósito.
Dados de Coleção
| Nome da Coleção | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| Identificador da Coleção | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 148 |
| Identificador da Coleção Parental | CMPUJ |
| Nome da Coleção | Colección de Microorganismos de la Pontifica Universidad Javeriana |
|---|---|
| Identificador da Coleção | https://www.gbif.org/grscicoll/collection/15d34b06-81d4-4c94-9f4d-6cfe39490817 |
| Identificador da Coleção Parental | CMPUJ |
| Métodos de preservação do espécime | Refrigerado, Liofilizado, Congelado |
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Metadados Adicionais
| Propósito | Compartir información relacionada con los microorganismos depositados en la colección, los cuales representan una parte de la biodiversidad de Colombia. Por otro lado, informar que microorganismos existen en la colección para entablar futuros convenios. |
|---|---|
| Descrição da manutenção | Cada vez que se requiera ya que esta relacionado con la cantidad de microorganismos que ingresen a la colección. |
| Identificadores alternativos | 10.15472/ppbz1y |
| 9f99a46b-d812-45a2-b51a-3f48f65357b5 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cmpuj |