Registros de ectoparásitos para la detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del departamento de Santander

說明

資料紀錄

此資源出現紀錄的資料已發佈為達爾文核心集檔案（DwC-A），其以一或多組資料表構成分享生物多樣性資料的標準格式。 核心資料表包含 151 筆紀錄。

亦存在 1 筆延伸集的資料表。延伸集中的紀錄補充核心集中紀錄的額外資訊。 每個延伸集資料表中資料筆數顯示如下。

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下載

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版本

以下的表格只顯示可公開存取資源的已發布版本。

如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Sandoval Ramírez C M, Pinilla Leon J C, Ramírez J D, Hernández Castro D C, Muñoz C M (2023): Registros de ectoparásitos para la detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del departamento de Santander. v1.2. Universidad de Santander - UDES. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/kbnkvn

權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 Universidad de Santander - UDES。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊，並指定以下之GBIF UUID: 17e160c4-11ea-432e-95af-d65e84ec5953。  Universidad de Santander - UDES 發佈此資源，並經由Colombian Biodiversity Information System同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Caninos; Ectoparásitos; Garrapatas; Pulgas; Canis familiaris; Ocurrence; Observation; PERMISO_COLECTA

聯絡資訊

地理涵蓋範圍

Área metropolitana de las ciudades de Bucaramanga, Floridablanca, Girón y Piedecuesta, jurisdicción del departamento de Santander.

分類群涵蓋範圍

El presente conjunto de datos cuenta con 151 registros biológicos, de los cuales 76 son de la especie Ctenocephalides felis, 70 de Rhipicephalus sanguineus, cuatro para el género Wolbachia y uno para Rickettsia.

時間涵蓋範圍

計畫資料

Las pulgas y garrapatas son ectoparásitos comunes de mamíferos domésticos como el perro (Canis lupus familiaris). En Colombia se conoce que estos mamíferos pueden ser reservorios de bacterias del género Rickettsia, agentes etiológicos de fiebres hemorrágicas que pueden desencadenar en casos fatales cuando no son detectadas a tiempo. Por otra parte, en la actual pandemia de Covid-19, no existen estudios encaminados a la detección de SARS-CoV-2 en mascotas en el país, aun cuando existe evidencia de infección por el virus en otros países. Objetivos: detectar SARS-CoV-2 en caninos e identificar Rickettsia spp., asociadas a ectoparásitos (pulgas y garrapatas) de caninos procedentes del área metropolitana de la ciudad de Bucaramanga. Metodología: Pulgas y garrapatas fueron colectadas manualmente en perros infestados, además de muestras respiratorias e intestinales. La identificación de los ectoparásitos se realizará utilizando caracteres morfológicos (claves dicotómicas) y moleculares (COII y COI). La detección de Rickettsia se realizará usando pooles de pulgas y garrapatas, que serán organizados por especie, y se usará para la identificación de las bacterias un fragmento del gen de la enzima citrato sintasa (gltA) y una proteína de membrana (ompB); para SARS-CoV-2 en caninos se amplificará los genes E y Rd/Rp.

參與計畫的人員:

取樣方法

SARS-CoV-2: En las clínicas veterinarias se tomaron hisopados en perros con y sin signos respiratorios. Ectoparásitos: Las garrapatas fueron extraídas mediante el método de colección directa. Se colectaron especies de garrapatas en diferentes estados evolutivos (larva, ninfa y adulto). Durante el mismo tiempo se colectaron las formas adultas de especies de pulgas. Los especímenes colectados fueron depositados en viales con etanol absoluto y etiquetados con la información de campo tales como fecha, albergue y tipo de hospedador.

方法步驟描述:

1. SARS-CoV-2: En las clínicas veterinarias se tomaron hisopados en perros con y sin signos respiratorios. Los hisopados fueron almacenados en una alícuota de RNAlater entre 4-20°C hasta la extracción de ARN. Además, se realizó una toma de muestra de sangre en tubos sin EDTA para extracción de suero.
2. Ectoparásitos: Las garrapatas fueron extraídas mediante el método de colección directa, consistente en la revisión de toda la superficie corporal de cada animal durante 15 minutos, en las partes del cuerpo donde generalmente se encuentran garrapatas (orejas, cabeza, cuello, patas delanteras y traseras, región torácica, abdominal y perianal). Durante ese tiempo, las garrapatas se desprendieron a contrapelo de la piel de los animales, mediante pinzas o con suaves movimientos de tracción (Benavidez-Montaño et al., 2018) y así evitar que el gnatosoma (aparato bucal) de la garrapata se desprenda del cuerpo del perro y quede clavado en el interior de la piel, lo cual inutiliza la muestra. Se colectaron especies de garrapatas en diferentes estados evolutivos (larva, ninfa y adulto). Durante el mismo tiempo se colectaron las formas adultas de especies de pulgas. Los especímenes colectados fueron depositados en viales con etanol absoluto y etiquetados con la información de campo tales como fecha, albergue y tipo de hospedador.
3. En paralelo con el proceso de identificación utilizando caracteres morfológicos, se seleccionó una muestra al azar de los ectoparásitos colectados en los diferentes albergues. Se procedió a la identificación taxonómica mediante biología molecular. En las pulgas se utilizó el marcador mitocondrial COII. Este fue amplificado con los primers F-Leu y R-Leu. Para la identificación de las garrapatas se utilizó el gen COI usando la pareja de primers S0725 y S0726. La secuenciación de los amplicones se realizó por la técnica de Sanger. El material recolectado fue destruido durante el procesamiento y, por lo tanto, no se depositó en ninguna colección de referencia.

引用文獻

1. Benavides Montaño, J. A., Jaramillo Cruz, C. A., y Mesa Cobo, N. C. (2018). Garrapatas ixodidae (ACARI) en el Valle del Cauca, Colombia. Boletín Científico Centro de Museos Museo de Historia Natural, 22(1), 131–150. https://doi.org/10.17151/bccm.2018.22.1.12

額外的詮釋資料