Description
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 349 531 enregistrements.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Raz L, Agudelo-Zamora H D (2023): Herbario Nacional Colombiano (COL). v13.16. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ea8sek
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Universidad Nacional de Colombia. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 18da9e5d-8966-4893-bf70-b3911152d991. Universidad Nacional de Colombia publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du Colombian Biodiversity Information System.
Mots-clé
Occurrence; Specimen
Contacts
- Chercheur Principal
- Profesora/ Directora Programa Informática de la Biodiversidad
- Cra 30 # 45 - 03. Edif 425 of 106
- 571-3165000 ext 11508
- Créateur
- Programa Informática de la Biodiversidad
- Cra 30 # 45 - 03. Edif 425 of 213
- +5713165000 ext 11513
- Chercheur Principal
- Profesora Asociada
- Cra 30 # 45 - 03. Edif 425 of 106
- 571-3165000 ext 11508
- Personne De Contact
- Director Instituto de Ciencias Naturales
- Cra 30 # 45 - 03. Edif 425 of 106
- 571-3165000 ext 11508
Couverture géographique
En su mayoría los ejemplares provienen de Colombia, sin embargo también existen ejemplares de muchos otros países, por ejemplo de las colecciones en Europa del Padre Enrique Pérez Arbeláez, fundador del Herbario Nacional Colombiano. En ese sentido la cobertura es mundial, pero se enfoca en Colombia.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-90, -180], Nord Est [90, 180] |
|---|
Couverture taxonomique
Este conjunto de datos contiene un total de 346.537 registros del reino Plantae. Los datos están distribuidos en 17 filos, 34 clases, 159 ordenes, 535 familias, 4.304 géneros y 26.928 especies. Un 74% esta clasificado a especie, 18% a género, 2% a nivel de familia y 6% a otras categorías.
| Kingdom | Plantae (Plantas) |
|---|---|
| Phylum | Anthocerotophyta, Ascomycota, Basidiomycota, Bryophyta, Cercozoa, Charophyta, Chlorophyta, includeeditCycadophyta, Gnetophyta, Lycopodiophyta, Magnoliophyta, Marchantiophyta, Phaeophyta, Pinophyta, Pteridophyta, Rhodophyta, Tracheophyta |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 1783-01-01 / 2019-10-13 |
|---|
Données sur le projet
Este recurso contiene información perteneciente a diversos proyectos llevados a cabo dentro de la Universidad Nacional de Colombia, estos incluyen el convenio especial de cooperación no. 13-238 entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad Nacional de Colombia y el proyecto "Colecciones basadas en datos para acciones de conservación: involucrando a los tomadores de decisiones para salvar epífitas amenazadas en Colombia" con el identificador BID-CA2020-047-USE y duración del 1 de septiembre de 2021 al 28 de febrero de 2023; Este proyecto combina las capacidades de cinco de los herbarios más grandes de Colombia (COL, HUA, JAUM, FMB, y CUVC) y sus instituciones anfitrionas para democratizar la información sobre los registros biológicos de las epífitas y las colecciones de visitantes florales para que sea útil en acciones de conservación. Este proyecto está dirigido por un consorcio de expertos nacionales con una experiencia bien establecida en linajes epífitos que garantizarán identificaciones precisas de los especímenes vinculados a los datos abiertos recientemente publicados.
| Titre | Proyectos asociados al Herbario Nacional Colombiano del Instituto de Ciencias Naturales |
|---|---|
| Financement | Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad Nacional de Colombia. El proyecto BID-CA2020-047-USE cuenta con la financiación de la Unión Europea-BID Caribbean Program y Global Biodiversity Information Facility (GBIF) |
| Description du design | Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander Von Humboldt y la Universidad Nacional de Colombia para: a) Apoyar la publicación de la información de las colecciones biológicas del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional a través del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB). b) Apoyar la consolidación del servicio de georreferenciación nacional para colecciones biológicas y c) Aportar en la creación de capacidades para el manejo de información para el inventario nacional de la biodiversidad, como insumos dentro de la estrategia ENIBIO y del proceso adelantado en el marco del convenio 13 – 014 suscrito con el Fondo Adaptación. La Universidad Nacional de Colombia se compromete a: 1. Sistematizar, depurar taxonómicamente, incluir o verificar la georreferenciación y publicar a través del SiB Colombia al menos 60.000 registros biológicos de colecciones biológicas del Instituto de Ciencias Naturales, de acuerdo a los criterios de priorización taxonómicos y geográficos establecidos conjuntamente. 2. Elaborar y validar con el Instituto Humboldt, a través del supervisor del convenio, los protocolos de georreferenciación que servirán de base para la operación del servicio de georreferenciación de colecciones biológicas, con base en la información publicada por el Instituto Humboldt y en los módulos operativos ya implementados en Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad. 3. Permitir el acceso, uso y disposición a través del SiB Colombia, de la base de datos de localidades de registros biológicos del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia, que servirá de insumo para el servicio de georreferenciación para colecciones biológicas. 4. Consolidar listados taxonómicos actualizados de grupos biológicos, acordados previamente junto con el Instituto Humboldt, de acuerdo a los criterios de priorización taxonómicos y geográficos establecidos conjuntamente. 5. Impartir de manera conjunta con el Instituto Humboldt dos actividades de capacitación identificadas como estratégicas en el ámbito de la ENIBIO. 6. Aportar una contrapartida en especie por un valor total de doscientos treinta y un millones setecientos quince mil cuatrocientos ochenta y ocho pesos ($231.715.488), representados en $11,715,488 del valor del tiempo dedicado por la directora del proyecto (5h semanales), $50.000.000 de equipos existentes en el Instituto de Ciencias Naturales, $20.000.000 de insumos y materiales y $150.000.000 de uso de infraestructura de la Universidad, conforme al certificado de contrapartida adjunto al presente acuerdo. 7. Designar interlocutores técnicos para la supervisión y el flujo de información del proyecto. El Instituto Humboldt se compromete a: 1. Asesorar y adelantar el acompañamiento técnico necesario para la estandarización de los registros biológicos y las localidades del instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia, que serán publicados a través del SiB Colombia. 2. Articular los aportes técnicos e insumos de información del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia en el servicio de georreferenciación nacional para colecciones biológicas, en el marco del SiB Colombia. 3. Desarrollar de manera conjunta con el Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia dos actividades de capacitación identificadas en el ámbito de la ENIBIO. 4. Realizar el seguimiento técnico y financiero respectivo al desarrollo del presente convenio. 6. Aportar una contrapartida de cuatrocientos millones de pesos representada en recursos financieros. 7. Designar interlocutores técnicos para la supervisión y el flujo de información del proyecto. CLAUSULA TERCERA.- RESULTADOS: En el marco del presente acuerdo se obtendrán los siguientes resultados: Por parte de la Universidad Nacional de Colombia: 1. Al menos 60.000 registros biológicos publicados a través del SiB Colombia depurados taxonómicamente y georreferenciados. 2. Protocolos de georreferenciación de localidades de registros biológicos, actualizados y validados junto con el Instituto Humboldt. 3. Base de datos de localidades de registros biológicos del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia disponible a través del SiB Colombia con su respectivo crédito. 4. Listados taxonómicos actualizados de grupos biológicos seleccionados. 5. Informe final con los resultados de la cooperación técnica con el Instituto Humboldt en el marco de la ENIBIO. Por parte del Instituto Humboldt: 1. Un informe del proceso de publicación de registros biológicos. 2. Memorias de reuniones técnicas desarrolladas en cumplimiento del objeto del convenio. 3. Publicación en la página web del SIB Colombia de los protocolos de georreferenciación resultantes dentro de este convenio, con su respectivo crédito. Adicionalmente se movilizaron 4.221 datos en el marco del proyecto "Colecciones basadas en datos para acciones de conservación: involucrando a los actores en la toma de decisiones para salvar epífitas globalmente amenazadas en Colombia", financiado por el BID Caribe (BID-CA2020-047-USE). |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes déchantillonnage
Se seleccionaron familias importantes para sistematizar, se buscaron los ejemplares en los armarios, se codificaron y se fotografiaron. Luego se realizó la sistematización y georreferenciación a partir de las fotografías.
| Etendue de létude | Ejemplares del Herbario Nacional Colombiano. |
|---|---|
| Contrôle qualité | Se revisó cada semana el 1% de los ejemplares en busca de errores. Si se encontraron en más del 50% de ese 1%, se revisaron todos los ejemplares del lote y se corrigieron. Ajuste de vocabularios controlados en: 1) Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; 2) Elementos geográficos: country, stateProvince y county. |
Description des étapes de la méthode:
- Los ejemplares de las colecciones son tomados y codificados con un código de barras. Los ejemplares de herbario son fotografiados bajo condiciones estandarizadas con una cámara de 21,1 megapixeles, pues el fotografiado de herbarios a gran escala, se recomienda como un medio para acelerar el proceso de descubrimiento de especies (Escocia et al, 2010). Estos procedimientos siguen manuales de buenas prácticas y protocolos generados y mejorados continuamente en el ICN.
- Todos los datos de la etiqueta son capturados, incluido el hábitat y datos descriptivos de la morfología, en la base de datos del programa para colecciones biológicas Specify 6. Posteriormente los ejemplares son devueltos a su lugar en la colección. Los ejemplares de herbario son reingresados después de ser fotografiados y la sistematización se realiza con base en la fotografía.
- Paralelo a este proceso, biólogos con asesoría de los especialistas del Instituto de Ciencias Naturales revisan y actualizan la información del árbol taxonómico de Specify de las especies en cuestión a medida que se sistematizan nuevos registros. Este árbol taxonómico es la base que servirá para la taxonomía del PIFFS.
- Posteriormente, para enriquecer el valor de los datos, las localidades de los registros son georreferenciadas por un geógrafo, siguiendo el método del radio-punto (Chapman & Wieczorek 2006, SUA et al., 2004) estableciendo así un punto y una precisión. Un ingeniero apoya la administración de la base de datos y asiste a los sistematizadores en la solución de problemas.
- Para la actualización y mantenimiento de la taxonomía en el PIFFS, otro ingeniero de sistemas instalará una plataforma estandarizada para el intercambio de información sobre biodiversidad (IPT) y trabajará junto con la empresa contratista que realice el PIFFS para que esta plataforma sirva de puente entre nuestra base de datos y el PIFFS.
Données de collection
| Nom de la collection | Herbario Nacional Colombiano |
|---|---|
| Identifiant de collection | Registro Nacional de Colecciones Biológicas:6 |
| Identifiant de la collection parente | COL |
| Nom de la collection | Herbario Nacional Colombiano |
|---|---|
| Identifiant de collection | https://www.gbif.org/grscicoll/collection/a27424fb-02ff-4144-b82f-bf07e1aadbcb |
| Identifiant de la collection parente | COL |
| Méthode de conservation des spécimens | Dried and pressed |
|---|
| Unités de conservation | Compteur 600 000 incertitude (+/-) 10 000 Pliegos |
|---|
Citations bibliographiques
- CHAPMAN A.D. and J. Wieczorek (eds). 2006. Guide to Best Practices in Georeferencing. Global biodiversity Information Facility. Copenhaguen. 80 p.
- SUA, S., MATEUS, R.D. and VARGAS, J.C. 2004. Georreferenciación de registros biológicos y gacetero digital de localidades. Instituto de Investigación de Recursos biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá D.C. P. 22.
Métadonnées additionnelles
| Objet | |
|---|---|
| Identifiants alternatifs | doi:10.15472/ea8sek |
| 18da9e5d-8966-4893-bf70-b3911152d991 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=herb_col |