Description
Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Posee 458 registros de cnidarios, correspondientes a 95 especies, las cuales se encuentran repartidas en 3 clases (Anthozoa, Hydrozoa y Scyphozoa). Los organismos que dominan los registros en la colección son los corales duros (Anthozoa: Scleractinia) y los octocorales (Anthozoa: Octocorallia). Los registros provienen en su mayoría, de la región del Pacífico colombiano (79%), seguidos de la región del Caribe colombiano (21%). Estos registros datan desde el año 1970 hasta el año 2022, en donde el Biólogo Henry Von Prahl fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar seriamente esta colección en los años 1980's. Esta colección de referencia se estableció formalmente ante el instituto Alexander Von Humboldt en el año 2002.
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 458 records.
2 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.
- Occurrence (core)
- Permit
- Identifier
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Salazar Hernandez J A, Londoño-Cruz E, Montoya-Cadavid E, Zapata Rivera F A (2023): Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco). v7.3. Universidad del Valle. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/otu4ix
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Universidad del Valle. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 9ae949d2-1319-45f0-8ff8-d67d5379ebe9. Universidad del Valle publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
Occurrence; Specimen; Cnidaria; Cnidarios; Corales duros; Octocorales; Corales blandos; Medusas; Arrecife coralino; Pacífico colombiano; Universidad del Valle
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Geographic Coverage
Este conjunto de datos posee información de 363 registros de cnidarios en el Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. Asimismo, se cuentan con 95 registros del Caribe colombiano, correspondientes a los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta un máximo de 30 metros.
| Bounding Coordinates | South West [1.538, -79.541], North East [12.983, -71.631] |
|---|
Taxonomic Coverage
Los 458 registros de cnidarios de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 7 órdenes, 28 familias, 51 géneros, 93 especies y 4 variedades.
| Class | Anthozoa (Anémonas, Corales y Plumas de mar), Hydrozoa (Hidras, pequeñas Medusas y pólipos coloniales), Scyphozoa (Medusas) |
|---|---|
| Order | Anthoathecata, Leptothecata, Malacalcyonacea, Rhizostomeae, Scleractinia (Corales duros), Scleralcyonacea, Siphonophorae |
| Family | Acroporidae, Agariciidae, Aglaopheniidae, Astrangiidae, Astrocoeniidae, Briareidae, Carijoidae, Caryophylliidae, Dendrophylliidae, Faviidae, Fungiidae, Gorgoniidae, Meandrinidae, Merulinidae, Milleporidae, Montastraeidae, Oculinidae, Paramuriceidae, Physaliidae, Plexauridae, Pocilloporidae, Poritidae, Psammocoridae, Pterogorgiidae, Rhizangiidae, Stomolophidae, Stylasteridae, Scleractinia incertae sedis |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 1970-01-01 / 2022-04-09 |
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Project Data
Este recurso contiene información asociada a material biológico proveniente de diferentes proyectos custodiados en la colección de Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle - CRBMco, el cual ha sido depositados por personal de la Universidad, tanto docente como de estudiantes e investigadores, que lo han obtenido en el marco de diferentes actividades académicas y de investigación adelantadas por la universidad.
| Title | Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco) |
|---|---|
| Identifier | BID-CA2020-055-NAC |
| Funding | La CRBMUV hace parte de la Vicerrectoría de Investigación de la Universidad del Valle, dependencia que provee los recursos de funcionamiento básicos, complementados con los recursos generados por proyectos a cargo de los docentes encargados de cada colección. En el año 2013, mediante el Convenio de Cooperación No. 13-13-014-242 entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad del Valle, se realizó la estandarización y georreferenciación de las localidades asociadas a los registros disponibles hasta ese momento, y se publicaron en el entonces funcional IPT-Valle del Cauca. Recursos adicionales para la documentación, digitalización y publicación de los datos de la colección fueron provistos entre el 2021-07-01 y 2023-06-30 por el Proyecto BID-CA2020-055-NAC "Increasing the accessibility of marine information from Colombians Natural History Collections by mobilizing data, strengthening infrastructure, and training" financiado por la unión Europea a través del Programa BID Caribe (Biodiversity Information for Development Programme) y GBIF (The Global Biodiversity Information Facility). El proyecto fue realizado bajo la coordinación del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras "José Benito Vives de Andréis" - INVEMAR en conjunto con la Universidad del Magdalena; Universidad de Antioquia; Universidad del Valle; Universidad Tecnológica del Chocó; Universidad el Bosque; la Red Nacional de Museos de Ciencia, Historia Natural y Colecciones Biológicas; el SiB Colombia; SiBM-OBIS Colombia y GBIF. Los corales de la colección y sus datos asociados fueron fortalecidos y actualizados durante el desarrollo de dicho proyecto, siendo el actual recurso uno de los productos asociado al entregable "Invertebrados de las colecciones marinas de la Universidad del Valle" |
| Study Area Description | Caribe en los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Pacífico Colombiano, departamentos de Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. En general áreas con profundidades entre 0 y 30 m. |
| Design Description | Desarrollo de actividades curatoriales y control de calidad de información siguiendo cuatro criterios de trabajo: 1. Criterios curatoriales: verificación física de lotes (existencia, preservación, etiquetas); verificación de datos de los registros biológicos asociados (concordancia de datos de etiqueta e información disponible, complementación de datos). 2. Criterios taxonómicos: validación de nombres científicos hasta el nivel más bajo de identificación del lote. Corroboración del taxón con especialista. Validación de autoridad taxonómica con base en WoRMS - World Register of Marine Species (https://www.marinespecies.org/). 3. Criterio espacial: Validación de la georrefenciación del punto de recolecta del espécimen representado en coordenadas decimales; especificación de la profundidad de obtención en metros; y validación de correspondencia de la localidad indicada. Herramientas: Conversor de coordenadas Canadensys (https://data.canadensys.net/tools/coordinates); Google Earth Pro 2022, versión 7.3.6.9345; Marine Regions Gazetteer 2022 (https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search); Geovisor ANH - Agencia Nacional de hidrocarburos v.3.1 (https://geovisor.anh.gov.co/tierras/). 4. Criterios de documentación: estandarización de datos acorde a Darwin Core considerando el uso de vocabularios controlados y la documentación de los Términos de obligatorio diligenciamiento acorde a los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros (Nodo OBiS Colombia y SiB Colombia), y los requeridos de forma general por los sistemas globales de OBiS y GBIF. |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
Los especímenes de cnidarios (en especial corales) son colectados manualmente en su mayoría, manejando gran precaución al momento de la extracción de las colonias. Luego, en caso de corales duros, se les realiza un tratamiento con hipoclorito para blanquear las colonias y dejar solo el esqueleto coralino. Para el resto de cnidarios, estos son fijados en alcohol al 70% y posteriormente, son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente, los organismos son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% a los lotes que lo requirieron y se renovaron/agregaron nuevas etiquetas a los lotes donde estuvieran deterioradas o no las presentaran.
| Study Extent | Pacífico colombiano y Caribe colombiano |
|---|---|
| Quality Control | Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS). |
Method step description:
- Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
- Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
- Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
- Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros.
- Curaduría física: Se corroboró el estado del alcohol (en la colección húmeda), del recipiente/bolsa y de las etiquetas asociadas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos no estuvieran presentes en la colección, se reportaban como extraviados en la base de datos (CRBMeq-UV).
Collection Data
| Collection Name | CRBMco |
|---|---|
| Collection Identifier | https://www.gbif.org/es/grscicoll/collection/57fcf4e1-a122-4bdd-a710-6554aba7bca5 |
| Specimen preservation methods | Alcohol, Dried, Microscopic preparation |
|---|
| Curatorial Units | Between 1 and 458 Lotes , Between 1 and 458 Registros Biologicos |
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Bibliographic Citations
- WoRMS (2023). Cnidaria. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1267 on 2023-02-17
- Brusca, R. C., Brusca, G. J., & Martínez, F. P. (2005). Invertebrados (1.ª ed., p. 1032). España: McGraw-Hill Interamericana de España S.L. ISBN-10: 8448602463
- Cantera, J. & Londoño-Cruz, E. (Eds.). 2011. Colombia Pacífico: Una visión sobre su biodiversidad marina. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 420 p. ISBN: 978-958-670-954-5
- Universidad del Valle (2014 -). Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle, 486 registros, aportados por Lizcano-Sandoval, L.D. (Creador del recurso), Zapata, F.A. (Curador de la colección, Contacto del recurso) & Carmona, A. (Proveedor de los metadatos, Contacto del recurso), En línea, http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=corales_univalle, versión 1 (actualizado el 12/11/2014).
- Bayer, F. M. 1981. Key to the genera of Octocorallia exclusive of Pennatulacea (Coelenterata: Anthozoa), with diagnoses of new taxa. Proceedings of the Biological Society of Washington 94: 902-947 (1981)
- Breedy, O. & Guzmán, H. M. 2007. A revision of the genus Leptogorgia Milne Edwards & Haime, 1857 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae) in the eastern Pacific. Zootaxa 1419: 1-90
- Breedy, O., Guzmán, H. M. & Vargas, S. 2009. A revision of the genus Eugorgia Verrill, 1868 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae). Zootaxa 2151: 1-46
- Cairns, S. D. & Kitahara, M. V. 2012. An illustrated key to the genera and subgenera of the recent azooxanthellate Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa), with an attached glossary. ZooKeys 227: 1-47
- Reyes, J., Santodomingo, N. & Flórez, P. 2010. Corales Escleractinios de Colombia. Invemar Serie de Publicaciones Especiales, No. 14. Santa Marta, 246 p
- Verón, J. E. N. 2000. Corals of the world. Vol. 1-3. Australian Institute of Marine Sciences, Australia. 1381 p.
Additional Metadata
| Alternative Identifiers | 9ae949d2-1319-45f0-8ff8-d67d5379ebe9 |
|---|---|
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=corales_univalle |