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Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco)

Última versión Publicado por Universidad del Valle en 26 de agosto de 2023 Universidad del Valle
Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Posee 458 registros de cnidarios, correspondientes a 95 especies, las cuales se encuentran repartidas en 3 clases (Anthozoa, Hydrozoa y Scyphozoa). Los organismos que dominan los registros en la colección son los corales duros (Anthozoa: Scleractinia) y los octocorales (Anthozoa: Octocorallia). Los registros provienen en su mayoría, de la región del Pacífico colombiano (79%), seguidos de la región del Caribe colombiano (21%). Estos registros datan desde el año 1970 hasta el año 2022, en donde el Biólogo Henry Von Prahl fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar seriamente esta colección en los años 1980's. Esta colección de referencia se estableció formalme... Más
Fecha de publicación:
26 de agosto de 2023
Alojado por:
Universidad del Valle
Licencia:
CC-BY 4.0

Descripción

Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Posee 458 registros de cnidarios, correspondientes a 95 especies, las cuales se encuentran repartidas en 3 clases (Anthozoa, Hydrozoa y Scyphozoa). Los organismos que dominan los registros en la colección son los corales duros (Anthozoa: Scleractinia) y los octocorales (Anthozoa: Octocorallia). Los registros provienen en su mayoría, de la región del Pacífico colombiano (79%), seguidos de la región del Caribe colombiano (21%). Estos registros datan desde el año 1970 hasta el año 2022, en donde el Biólogo Henry Von Prahl fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar seriamente esta colección en los años 1980's. Esta colección de referencia se estableció formalmente ante el instituto Alexander Von Humboldt en el año 2002.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 458 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    458
  • Permit 
    458
  • Identifier
    458

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Salazar Hernandez J A, Londoño-Cruz E, Montoya-Cadavid E, Zapata Rivera F A (2023): Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco). v7.3. Universidad del Valle. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/otu4ix

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad del Valle. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 9ae949d2-1319-45f0-8ff8-d67d5379ebe9.  Universidad del Valle publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras clave

Occurrence; Specimen; Cnidaria; Cnidarios; Corales duros; Octocorales; Corales blandos; Medusas; Arrecife coralino; Pacífico colombiano; Universidad del Valle

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

John Alexander Salazar Hernandez
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
3015315725
Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+60 2 3212100, ext. 2894
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/edgardo-londono
Erika Montoya-Cadavid
Profesional en Biología Marina
Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives de Andreis” INVEMAR
Calle 25 No. 2-55, Playa Salguero, Santa Marta D.T.C.H.
470006 Santa Marta
Magdalena
CO
(+57) (+5) 4380 808, ext. 252
Fernando Alberto Zapata Rivera
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+57 2 321 21 00, ext. 3231
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/fernando-zapata

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Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
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+60 2 3212100, ext. 2894
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/edgardo-londono
Andres Felipe Carmona Guerra
Laboratorista de apoyo de Biología Marina
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
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+57 2 321 21 00, ext. 3232
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/funcionarios
Fernando Alberto Zapata Rivera
Profesor
Universidad del Valle
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Valle del Cauca
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¿Quién documentó los metadatos?:

John Alexander Salazar Hernandez
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
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Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
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¿Quién más está asociado con el recurso?:

Punto de Contacto
Andres Felipe Carmona Guerra
Laboratorista de apoyo de Biología Marina
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
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Valle del Cauca
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Cobertura geográfica

Este conjunto de datos posee información de 363 registros de cnidarios en el Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. Asimismo, se cuentan con 95 registros del Caribe colombiano, correspondientes a los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta un máximo de 30 metros.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [1,538, -79,541], Latitud Máxima Longitud Máxima [12,983, -71,631]

Cobertura taxonómica

Los 458 registros de cnidarios de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 7 órdenes, 28 familias, 51 géneros, 93 especies y 4 variedades.

Class  Anthozoa (Anémonas, Corales y Plumas de mar),  Hydrozoa (Hidras, pequeñas Medusas y pólipos coloniales),  Scyphozoa (Medusas)
Orden  Anthoathecata,  Leptothecata,  Malacalcyonacea,  Rhizostomeae,  Scleractinia (Corales duros),  Scleralcyonacea,  Siphonophorae
Familia  Acroporidae,  Agariciidae,  Aglaopheniidae,  Astrangiidae,  Astrocoeniidae,  Briareidae,  Carijoidae,  Caryophylliidae,  Dendrophylliidae,  Faviidae,  Fungiidae,  Gorgoniidae,  Meandrinidae,  Merulinidae,  Milleporidae,  Montastraeidae,  Oculinidae,  Paramuriceidae,  Physaliidae,  Plexauridae,  Pocilloporidae,  Poritidae,  Psammocoridae,  Pterogorgiidae,  Rhizangiidae,  Stomolophidae,  Stylasteridae,  Scleractinia incertae sedis

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1970-01-01 / 2022-04-09

Datos del proyecto

Este recurso contiene información asociada a material biológico proveniente de diferentes proyectos custodiados en la colección de Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle - CRBMco, el cual ha sido depositados por personal de la Universidad, tanto docente como de estudiantes e investigadores, que lo han obtenido en el marco de diferentes actividades académicas y de investigación adelantadas por la universidad.

Título Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco)
Identificador BID-CA2020-055-NAC
Fuentes de Financiación La CRBMUV hace parte de la Vicerrectoría de Investigación de la Universidad del Valle, dependencia que provee los recursos de funcionamiento básicos, complementados con los recursos generados por proyectos a cargo de los docentes encargados de cada colección. En el año 2013, mediante el Convenio de Cooperación No. 13-13-014-242 entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad del Valle, se realizó la estandarización y georreferenciación de las localidades asociadas a los registros disponibles hasta ese momento, y se publicaron en el entonces funcional IPT-Valle del Cauca. Recursos adicionales para la documentación, digitalización y publicación de los datos de la colección fueron provistos entre el 2021-07-01 y 2023-06-30 por el Proyecto BID-CA2020-055-NAC "Increasing the accessibility of marine information from Colombians Natural History Collections by mobilizing data, strengthening infrastructure, and training" financiado por la unión Europea a través del Programa BID Caribe (Biodiversity Information for Development Programme) y GBIF (The Global Biodiversity Information Facility). El proyecto fue realizado bajo la coordinación del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras "José Benito Vives de Andréis" - INVEMAR en conjunto con la Universidad del Magdalena; Universidad de Antioquia; Universidad del Valle; Universidad Tecnológica del Chocó; Universidad el Bosque; la Red Nacional de Museos de Ciencia, Historia Natural y Colecciones Biológicas; el SiB Colombia; SiBM-OBIS Colombia y GBIF. Los corales de la colección y sus datos asociados fueron fortalecidos y actualizados durante el desarrollo de dicho proyecto, siendo el actual recurso uno de los productos asociado al entregable "Invertebrados de las colecciones marinas de la Universidad del Valle"
Descripción del área de estudio Caribe en los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Pacífico Colombiano, departamentos de Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. En general áreas con profundidades entre 0 y 30 m.
Descripción del diseño Desarrollo de actividades curatoriales y control de calidad de información siguiendo cuatro criterios de trabajo: 1. Criterios curatoriales: verificación física de lotes (existencia, preservación, etiquetas); verificación de datos de los registros biológicos asociados (concordancia de datos de etiqueta e información disponible, complementación de datos). 2. Criterios taxonómicos: validación de nombres científicos hasta el nivel más bajo de identificación del lote. Corroboración del taxón con especialista. Validación de autoridad taxonómica con base en WoRMS - World Register of Marine Species (https://www.marinespecies.org/). 3. Criterio espacial: Validación de la georrefenciación del punto de recolecta del espécimen representado en coordenadas decimales; especificación de la profundidad de obtención en metros; y validación de correspondencia de la localidad indicada. Herramientas: Conversor de coordenadas Canadensys (https://data.canadensys.net/tools/coordinates); Google Earth Pro 2022, versión 7.3.6.9345; Marine Regions Gazetteer 2022 (https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search); Geovisor ANH - Agencia Nacional de hidrocarburos v.3.1 (https://geovisor.anh.gov.co/tierras/). 4. Criterios de documentación: estandarización de datos acorde a Darwin Core considerando el uso de vocabularios controlados y la documentación de los Términos de obligatorio diligenciamiento acorde a los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros (Nodo OBiS Colombia y SiB Colombia), y los requeridos de forma general por los sistemas globales de OBiS y GBIF.

Personas asociadas al proyecto:

Punto de Contacto
Edgardo Londoño
Verificador
Erika Montoya-Cadavid
Procesador
John Salazar Hernandez

Métodos de muestreo

Los especímenes de cnidarios (en especial corales) son colectados manualmente en su mayoría, manejando gran precaución al momento de la extracción de las colonias. Luego, en caso de corales duros, se les realiza un tratamiento con hipoclorito para blanquear las colonias y dejar solo el esqueleto coralino. Para el resto de cnidarios, estos son fijados en alcohol al 70% y posteriormente, son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente, los organismos son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% a los lotes que lo requirieron y se renovaron/agregaron nuevas etiquetas a los lotes donde estuvieran deterioradas o no las presentaran.

Área de Estudio Pacífico colombiano y Caribe colombiano
Control de Calidad Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
  2. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
  3. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
  4. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros.
  5. Curaduría física: Se corroboró el estado del alcohol (en la colección húmeda), del recipiente/bolsa y de las etiquetas asociadas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos no estuvieran presentes en la colección, se reportaban como extraviados en la base de datos (CRBMeq-UV).

Datos de la colección

Nombre de la Colección CRBMco
Identificador de la Colección https://www.gbif.org/es/grscicoll/collection/57fcf4e1-a122-4bdd-a710-6554aba7bca5
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol,  Secado,  Preparación microscópica
Unidades curatoriales Entre 1 y 458 Lotes ,  Entre 1 y 458 Registros Biologicos

Referencias bibliográficas

  1. WoRMS (2023). Cnidaria. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1267 on 2023-02-17
  2. Brusca, R. C., Brusca, G. J., & Martínez, F. P. (2005). Invertebrados (1.ª ed., p. 1032). España: McGraw-Hill Interamericana de España S.L. ISBN-10: 8448602463
  3. Cantera, J. & Londoño-Cruz, E. (Eds.). 2011. Colombia Pacífico: Una visión sobre su biodiversidad marina. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 420 p. ISBN: 978-958-670-954-5
  4. Universidad del Valle (2014 -). Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle, 486 registros, aportados por Lizcano-Sandoval, L.D. (Creador del recurso), Zapata, F.A. (Curador de la colección, Contacto del recurso) & Carmona, A. (Proveedor de los metadatos, Contacto del recurso), En línea, http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=corales_univalle, versión 1 (actualizado el 12/11/2014).
  5. Bayer, F. M. 1981. Key to the genera of Octocorallia exclusive of Pennatulacea (Coelenterata: Anthozoa), with diagnoses of new taxa. Proceedings of the Biological Society of Washington 94: 902-947 (1981)
  6. Breedy, O. & Guzmán, H. M. 2007. A revision of the genus Leptogorgia Milne Edwards & Haime, 1857 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae) in the eastern Pacific. Zootaxa 1419: 1-90
  7. Breedy, O., Guzmán, H. M. & Vargas, S. 2009. A revision of the genus Eugorgia Verrill, 1868 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae). Zootaxa 2151: 1-46
  8. Cairns, S. D. & Kitahara, M. V. 2012. An illustrated key to the genera and subgenera of the recent azooxanthellate Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa), with an attached glossary. ZooKeys 227: 1-47
  9. Reyes, J., Santodomingo, N. & Flórez, P. 2010. Corales Escleractinios de Colombia. Invemar Serie de Publicaciones Especiales, No. 14. Santa Marta, 246 p
  10. Verón, J. E. N. 2000. Corals of the world. Vol. 1-3. Australian Institute of Marine Sciences, Australia. 1381 p.

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos 9ae949d2-1319-45f0-8ff8-d67d5379ebe9
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=corales_univalle