Description
Estructura de la comunidad microbiana de manantiales termales del Departamento de Boyacá. Este estudio se realizó en 5 manantiales termales y un manantial salino de Boyacá. Las comunidades microbianas de los manantiales están conformadas principalmente por poblaciones termofílicas de organismos sulfato-reductores, tiosulfato-reductores no sulfato-reductores, organismos reductores de hierro férrico, organismos reductores de nitratos y principalmente organismos fermentativos.
Composición de la comunidad microbiana de manantiales termales del Departamento de Risaralda. Se concentró en el estudio de la diversidad microbiana de manantiales salinos y termales del departamento de Risaralda. Los estudios en esta segunda fase se orientaron hacia la clasificación taxonómica de microorganismos, utilizando como marcador molecular el gen 16S rRNA, con el fin de identificar los microorganismos presentes en manantiales salinos y termales.
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Comment citer
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Baena S, Diaz Cardenas C, López Ramirez G (2019): Estudio de la Diversidad de Microorganismos de Ambientes Termales y Salinos de la Región Andina Central de Colombia. v1.1. Pontificia Universidad Javeriana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/lefufh
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Mots-clé
Microorganismos; bacterias termofilicas; bacterias anaerobias; bacterias salinas; Occurrence; Observation; PERMISO_COLECTA
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Couverture géographique
Las colectas se realizaron en los departamentos de Boyacá y Risaralda.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [3,623, -75,981], Nord Est [5,791, -73,455] |
|---|
Couverture taxonomique
Comunidad microbiana de manantiales termales, comprende registros correspondientes a 53 especies de bacterias distribuidas en 14 familias del dominio Bacteria.
| Phylum | Firmicutes, Proteobacteria, Synergistetes |
|---|
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2009-10-01 / 2019-10-14 |
|---|
Données sur le projet
Los objetivos de este estudio fueron: 1.Establecer una colección microbiana de organismos termofilicos y halofilicos utilizando herramientas de taxonomía y filogenia molecular. 2. Describir la composición de las comunidades microbianas de los Dominios Archaea y Bacteria de manantiales salinos y manantiales termales de los departamentos de Boyacá y Risaralda y su relación con las condiciones fisicoquímicas de su ambiente. 3. Describir fenotípica y genotípicamente los microorganismos aislados de estos ambientes termales y salinos e identificar nuevas especies usando características quimio taxonómicas como análisis de ácidos grasos de pared celular, lípidos de membrana y génicas como contenido de guanina-citosina del DNA total y secuenciación del genoma con fines taxonómicos y filogenómicos.
| Titre | ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS DE AMBIENTES TERMALES Y SALINOS DE LA REGION ANDINA CENTRAL DE COLOMBIA |
|---|---|
| Identifiant | Contrato ARG 218 |
| Financement | Pontificia Universidad Javeriana, IFS y Colciencias |
| Description du domaine d'étude / de recherche | Este estudio se desarrolló en dos fases, una primera concentrada en cinco manantiales termales y un manantial salino del departamento de Boyacá, a 2.500 m.s.n.m. en el Departamento de Boyacá y una segunda fase de estudio que se concentró en el estudio de la diversidad microbiana de manantiales salinos y termales del departamento de Risaralda. Los estudios en esta segunda fase se orientaron hacia la clasificación taxonómica de microorganismos, utilizando como marcador molecular el gen 16S rRNA, con el fin de identificar los microorganismos presentes en manantiales salinos y termales. |
| Description du design | Este estudio se desarrolló en dos fases, una primera concentrada en cinco manantiales termales y un manantial salino del departamento de Boyacá, a 2.500 m.s.n.m. en el Departamento de Boyacá. y una segunda en el departamento de Risaralda, donde se seleccionaron cuatro manantiales, dos termales (Jaivana y Parador de Quimbaya y dos salinos (Manantial Salado de Consotá y Manantial La Cristalina). En cada manantial se ubicaron diferentes puntos de muestreo y se tomaron muestras a diferentes profundidades, según el manantial en estudio y se realizaron 3 muestreos durante dos años de estudio. |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
En cada manantial se ubicaron diferentes puntos de muestreo y se tomaron muestras a diferentes profundidades, según el manantial en estudio y se realizaron 3 muestreos durante dos años de estudio
| Etendue de l'étude | Este estudio se desarrolló en dos fases, una primera concentrada en cinco manantiales termales y un manantial salino del departamento de Boyacá, a 2.500 m.s.n.m. en el Departamento de Boyacá. Una segunda fase de estudio, que se concentró en el estudio de la diversidad microbiana de manantiales salinos y termales del departamento de Risaralda. |
|---|---|
| Contrôle qualité | En cada manantial se ubicaron diferentes puntos de muestreo y se tomaron muestras a diferentes profundidades, según el manantial en estudio y se realizaron 3 muestreos durante dos años de estudio |
Description des étapes de la méthode:
- Para el aislamiento e identificación fenotípica y genotípica de los microorganismos dominantes de los manantiales se tomaron muestras puntuales entre 200 y 500 ml de agua y sedimento en frascos estériles a profundidades entre 30 y 100 cm según las características de cada manantial. Posteriormente (menos de 24 horas) se realizaron las siembras en diferentes series de cultivo, siguiendo protocolos descritos previamente. Las muestras fueron procesadas en el laboratorio de la Unidad de Saneamiento y Biotecnología Ambiental (USBA) de la Universidad Javeriana. Para el aislamiento de los microorganismos se realizaron 31 series de cultivo en condiciones anaerobias y 24 series de cultivo en condiciones aerobias. Las diferentes series de cultivo se definieron con base en las características de cada manantial y con base en el tipo de microorganismo que se deseaba aislar. Se tuvo en cuenta la fuente de carbono (donador de electrones en la mayoría de los casos) y la presencia o ausencia de aceptor de electrones, y se incubaron también según las características de cada manantial. A partir de las diferentes series de cultivo se realizaron los aislamientos microbianos en medio sólido con agar noble al 2% (p/v) usando la técnica del tubo rodado. La purificación de los microorganismos se logró con el uso repetido de esta técnica hasta obtener cultivos axénicos. La pureza de los cultivos fue verificada por observación al microscopio y repicaje en medio enriquecido con extracto de levadura (2g/l) y glucosa (20 mM).
Données de collection
| Nom de la collection | Colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana |
|---|---|
| Identifiant de collection | Registro nacional de colecciones: 148 |
| Identifiant de la collection parente | CMPUJ |
Citations bibliographiques
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- Rubiano-Labrador, Carolina, Bland Céline, Miotello Guylaine, Armengaud Jean, Baena Sandra. 2015. Salt stress induced changes in the exoproteome of the halotolerant bacterium Tistlia consotensis deciphered by proteogenomics. PLoS ONE 10(8): e0135065. doi:10.1371/journal.pone.0135065
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- Baena. S., N. Perdomo, C. Carvajal; B.K.C. Patel. 2011. Desulfosoma caldarium gen. nov. sp. nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium from an Andean terrestrial hot spring. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61: 732–736 DOI 10.1099/ijs.0.020586-0
- Thevenieau, F.; M-L Fardeau; B. Ollivier; C. Joulian; S. Baena. 2007. Desulfomicrobium thermophilum sp. nov., a novel thermophilic sulphate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Colombia. Extremophiles. (2): 295-303. DOI 10.1007/s00792-006-0039-9
Métadonnées additionnelles
| Objet | Repositorio de la diversidad microbiana de ambientes termales y salinos de Colombia |
|---|---|
| Description de la fréquence de mise à jour | El mantenimiento que hace la coleccion de microorganismos |
| Identifiants alternatifs | 10.15472/lefufh |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=carg_sandrab_puj | |
| 837b26a5-1837-4ad8-9e5a-ce72ac8b000b | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=carg_sandrab_puj |