Description
Presentamos la información relacionada con los eventos de muestreo acústico pasivo depositados en la Colección de Sonidos Ambientales (IAvH-CSA) del Instituto Humboldt, durante los años 2018-2019. Los eventos de muestreo acústico se generaron en el marco de los proyectos Colombia BIO, Santander BIO, Boyacá BIO, Lizama, Riqueza Natural y ocasionales recolectados durante este período de tiempo. En total se integran 44704 eventos de muestreo que corresponden a 1 minuto de grabación automática tomada a una tasa de muestreo de 44.1 kHz y 16 bits de resolución. El esquema de grabación corresponde a 1 minuto de sonidos ambientales cada 5, 10 o 30 minutos durante todo el día, con una duración de 1 a 20 días de muestreo en 79 sitios a lo largo de Colombia. La cobertura geográfica incluye los departamentos de Bolívar, Boyacá, Caquetá, Cundinamarca, Meta, Santander y Sucre. Esta información se colecta en el marco de la metodología de monitoreo con sensores pasivos establecida por el Instituto Humboldt.
Data Records
The data in this sampling event resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 44,704 records.
2 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.
- Event (core)
- Identifier
- Multimedia
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2020). Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia. 44704 eventos. https://doi.org/10.15472/ocpi3r
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: e98d3337-f7d7-454a-abae-c82d2d6010a9. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
parques nacionales naturales; reservas regionales; monitoreo acústico pasivo; evento de muestreo
External data
The resource data is also available in other formats
| Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia | http://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa utf-8 txt na |
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Contacts
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Geographic Coverage
Los registros reportados en este manuscrito fueron obtenidos en diferentes ecosistemas de 79 sitios a lo largo de Colombia (Figura 1). En un contexto generalizado, los muestreos se llevaron a cabo en los páramos de Sumapaz, El Valle y Ocetá, en bosque seco de los Montes de María y el cañón medio del Río Chicamocha, las zonas de amortiguación de los Parques Nacionales Naturales Serranía de los Yariguíes y Chingaza (Linares et al., 2020), en la Reserva Natural Los Yátaros, el territorio Muinane del río Yarí y la quebrada Lizama. Esto quiere decir que incluimos datos provenientes de los municipios de San Jacinto y San Juan Nepomuceno en Bolívar, así como Chalán y Colosó en Sucre. También de los municipios de Barrancabermeja, Bolívar, Cimitarra, El Carmen de Chucurí, San Vicente de Chucurí y Santa Bárbara en Santander. Además de los municipios de Arcabuco, Cómbita, Gachantivá, Monguí y Socha en Boyacá. Finalmente, de los municipios de San Juanito en Meta, Cabrera en Cundinamarca y Solano en Caquetá (ingresando por Puerto Santander, Amazonas).
| Bounding Coordinates | South West [-0.56, -75.36], North East [10.029, -72.256] |
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Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2018-02-18 / 2019-12-21 |
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Project Data
No Description available
| Title | Colecciones Biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
|---|---|
| Funding | La financiación provino de los proyectos Boyacá Bio, Santander Bio, Colombia Bio, Riqueza Natural y Ecopetrol-Lizama, así como otros proyectos interinstitucionales desarrollados por los autores. |
| Study Area Description | Comprende varios departamentos de Colombia de acuerdo con la jurisdicción de cada proyecto. |
| Design Description | Fueron obtenidos ejemplares digitales de sonido de 1 minuto de duración, colectados de manera automática por sensores acústicos generados por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018), en intervalos de 5, 10 o 30 minutos de pausa o no grabación. Los audios fueron depositados en las colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, dentro de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA. |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
Para este muestreo acústico pasivo usamos grabadoras automáticas ensambladas por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc, que consisten en un celular Motorola MotoG dentro de un estuche de protección y con un micrófono externo acoplado (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018). Las grabadoras tenían instalada la aplicación Arbimon Touch para Android, que permite escoger diferentes esquemas de grabación. Dependiendo de cada proyecto, escogimos entre tres esquemas de grabación de 1 minuto de audio variando el espaciado entre descansos de 5, 10 o 30 minutos. Cada punto de muestreo se seleccionaba según criterio del investigador en campo, intentando siempre incluir por lo menos de 50 a 100 m de la misma cobertura para captar la huella acústica del hábitat escogido y asumiendo independencia a cada punto. Este tipo de grabadoras, aunque depende de las barreras que el medio le ponga al sonido, pueden captar una semiesfera de ~50 m a la redonda (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Las grabadoras duraron en el campo por períodos de 1 hasta 20 días.
| Study Extent | El muestreo ocurrió en 79 sitios que abarcan diferentes condiciones ambientales en Colombia. Sin embargo, muchos de los muestreos no fueron simultáneos, pues la instalación de las grabadoras podría considerarse oportunista y dependiente de las salidas al campo y las preguntas de investigación de cada proyecto. A lo largo de 2018 y 2019, fueron instaladas grabadoras con diferentes esquemas de grabación. En algunos sitios las grabadoras alcanzaron a obtener la totalidad esperada por día a partir de los esquemas propuestos (Figura 2a). La selección del esquema de grabación (1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos) estuvo a cargo del investigador en cada salida, pero al parecer puede verse una tendencia en el muestreo de esquemas muy intensos (1 minuto cada 5 minutos) en ecosistemas altoandinos y un poco más espaciada (1 minuto cada 30 minutos) en zonas bajas. |
|---|---|
| Quality Control | Verificamos el funcionamiento de cada grabadora en campo, revisando que la hora y fecha correspondiera al momento de muestreo, así como que tuviera capacidad de batería y memoria. A cada punto de muestreo le asignamos un nombre para poder rastrear cada evento de recolecta de datos. Tres sitios donde la grabadora no fue correctamente instalada (falla en fecha y hora) fueron descartados dentro del proceso de control de calidad. La matriz final obtenida fue verificada por el personal de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D) del Instituto Humboldt. |
Method step description:
- 1. Programación de las grabadoras: siguiendo el protocolo propuesto por Sieve Analytics Inc, desde la aplicación ARBIMON Touch directamente en el celular. Fue confirmado que la batería, fecha y hora del dispositivo correspondieran al evento de muestreo en campo. 2. Asignación del esquema de muestreo: se seleccionó grabar 1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos. 3. Instalación de las grabadoras en el lugar destinado para grabar, por una duración de 1 a 20 días. 4. Registro de las coordenadas geográficas y elevación del punto de muestreo utilizando un GPS. 5. Desinstalación de las grabadoras y descarga de los archivos en un computador 6. Almacenamiento en la colección siguiendo los estándares definidos.
Collection Data
| Collection Name | Colección de Sonidos Ambientales del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt |
|---|---|
| Collection Identifier | IAvH-CSA |
| Parent Collection Identifier | No aplica |
| Specimen preservation methods | Other |
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| Curatorial Units | Between 1 and 40,704 grabaciones WAV y FLAC |
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Additional Metadata
| Purpose | Cada lugar en el planeta tiene una huella acústica particular (Krause, 1987). Sin embargo, muchos lugares en el mundo aún no cuentan con información acústica registrada que permita caracterizar su huella. Similar a otros componentes de la biodiversidad, la colecta de sonidos puede abordarse desde una perspectiva activa y direccional (Parker, 1991), o puede ser integrado en muestreos pasivos con sensores acústicos automatizados que no incluyen interferencia por el observador (Aide et al., 2013; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). El muestreo pasivo con sensores acústicos permite obtener datos de señales acústicas de manera efectiva, lo cual es una gran oportunidad para estudiar la biodiversidad tropical (Deichmann et al., 2018; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). Un posible enfoque de esta herramienta es medir la huella acústica a partir del análisis de paisajes sonoros, los cuales pueden variar a través de gradientes de elevación (Campos-Cerqueira & Aide, 2017), en respuesta al disturbio (Deichmann et al., 2017) o por tipos de cobertura (Furumo & Aide, 2019). Adicionalmente, los datos obtenidos por muestreo pasivo con sensores acústicos permiten abordar preguntas direccionadas a la actividad acústica de especies en particular (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Entre 2018 y 2019, algunos proyectos del Instituto Humboldt incluyeron eventos de muestreo acústico pasivo para complementar muestreos de biodiversidad. Para esto, algunas veces fueron invitados investigadores de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA, o fue solicitado apoyo a esta colección para poder tener muestras de este tipo dentro de los proyectos particulares. El objetivo de los muestreos fue compilar muestras acústicas de mínimo un día en diferentes lugares de Colombia que incluyen los Andes (Boyacá, Cundinamarca, Meta y Santander), la Amazonia (Caquetá) y el Caribe (Sucre y Bolívar), que contribuyeran al futuro crecimiento de la colección y al enriquecimiento del conocimiento ecoacústico del país. |
|---|---|
| Alternative Identifiers | 10.15472/ocpi3r |
| e98d3337-f7d7-454a-abae-c82d2d6010a9 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource?r=sonidos_iavh-csa |