Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia

Última versión Publicado por Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt en Jun 19, 2020 Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt

Presentamos la información relacionada con los eventos de muestreo acústico pasivo depositados en la Colección de Sonidos Ambientales (IAvH-CSA) del Instituto Humboldt, durante los años 2018-2019. Los eventos de muestreo acústico se generaron en el marco de los proyectos Colombia BIO, Santander BIO, Boyacá BIO, Lizama, Riqueza Natural y ocasionales recolectados durante este período de tiempo. En total se integran 44704 eventos de muestreo que corresponden a 1 minuto de grabación automática tomada a una tasa de muestreo de 44.1 kHz y 16 bits de resolución. El esquema de grabación corresponde a 1 minuto de sonidos ambientales cada 5, 10 o 30 minutos durante todo el día, con una duración de 1 a 20 días de muestreo en 79 sitios a lo largo de Colombia. La cobertura geográfica incluye los departamentos de Bolívar, Boyacá, Caquetá, Cundinamarca, Meta, Santander y Sucre. Esta información se colecta en el marco de la metodología de monitoreo con sensores pasivos establecida por el Instituto Humboldt.

Registros

Los datos en este evento de muestreo recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 44,704 registros. también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Event (core)
    44704
  • Identifier
    44704
  • Multimedia 
    44704

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 44,704 registros en Español (1 MB) - Frecuencia de actualización: desconocido
Metadatos como un archivo EML descargar en Español (23 KB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Español (18 KB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2020). Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombia. 44704 eventos. https://doi.org/10.15472/ocpi3r

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: e98d3337-f7d7-454a-abae-c82d2d6010a9.  Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

parques nacionales naturales; reservas regionales; monitoreo acústico pasivo; evento de muestreo

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Muestreo pasivo con sensores acústicos de la Colección de Sonidos Ambientales del Instituto Humboldt (IAvH-CSA) realizado entre el 2018 y 2019 en Colombiahttp://i2d.humboldt.org.co/ceiba/resource.do?r=sonidos_iavh-csa utf-8 txt na

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Daniela Murillo Bedoya
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
http://www.humboldt.org.co

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Orlando Acevedo-Charry
Curador Colección de Sonidos Ambientales
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
http://www.humboldt.org.co

¿Quién documentó los metadatos?:

Daniela Murillo-Bedoya
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
http://www.humboldt.org.co

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Custodio de los Datos
Infraestructura Institucional de Datos
IInstituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Avenida Paseo Bolívar # 16-20 Bogotá, D.C. Bogotá, D.C. CO 3202767
http://www.humboldt.org.co
Curador
Orlando Acevedo-Charry
Curador Colección de Sonidos Ambientales
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
Autor
Daniela Murillo-Bedoya
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
Proveedor de Contenido
Alexandra Buitrago-Cardona
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
Proveedor de Contenido
Claudia A. Medina-Uribe
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
Proveedor de Contenido
Ana-María Ospina-Larrea
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Carrera 8 # 15-08 Villa de Leyva Boyacá CO 3202767
Proveedor de Contenido
Zuania Colon-Pineiro
Investigadora independiente
Reserva Natural Los Yátaros Cll 7 # 10-53 Villa de Leyva Boyacá CO
Proveedor de Contenido
Jose-Manuel Ochoa-Quintero
Subdirector de Investigaciones
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Avenida Paseo Bolívar # 16-20 Bogotá, D.C. Bogotá, D.C. CO 3202767
Proveedor de Contenido
Bibiana Gómez-Valencia
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Avenida Paseo Bolívar # 16-20 Bogotá, D.C. Bogotá, D.C. CO 3202767
Proveedor de Contenido
Yenifer Herrera-Varón
Investigadora
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Avenida Paseo Bolívar # 16-20 Bogotá, D.C. Bogotá, D.C. CO 3202767

Cobertura Geográfica

Los registros reportados en este manuscrito fueron obtenidos en diferentes ecosistemas de 79 sitios a lo largo de Colombia (Figura 1). En un contexto generalizado, los muestreos se llevaron a cabo en los páramos de Sumapaz, El Valle y Ocetá, en bosque seco de los Montes de María y el cañón medio del Río Chicamocha, las zonas de amortiguación de los Parques Nacionales Naturales Serranía de los Yariguíes y Chingaza (Linares et al., 2020), en la Reserva Natural Los Yátaros, el territorio Muinane del río Yarí y la quebrada Lizama. Esto quiere decir que incluimos datos provenientes de los municipios de San Jacinto y San Juan Nepomuceno en Bolívar, así como Chalán y Colosó en Sucre. También de los municipios de Barrancabermeja, Bolívar, Cimitarra, El Carmen de Chucurí, San Vicente de Chucurí y Santa Bárbara en Santander. Además de los municipios de Arcabuco, Cómbita, Gachantivá, Monguí y Socha en Boyacá. Finalmente, de los municipios de San Juanito en Meta, Cabrera en Cundinamarca y Solano en Caquetá (ingresando por Puerto Santander, Amazonas).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-0.56, -75.36], Latitud Máxima Longitud Máxima [10.029, -72.256]

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2018-02-18 / 2019-12-21

Datos del Proyecto

No hay descripción disponible

Título Colecciones Biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Fuentes de Financiación La financiación provino de los proyectos Boyacá Bio, Santander Bio, Colombia Bio, Riqueza Natural y Ecopetrol-Lizama, así como otros proyectos interinstitucionales desarrollados por los autores.
Descripción del Área de Estudio Comprende varios departamentos de Colombia de acuerdo con la jurisdicción de cada proyecto.
Descripción del Diseño Fueron obtenidos ejemplares digitales de sonido de 1 minuto de duración, colectados de manera automática por sensores acústicos generados por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018), en intervalos de 5, 10 o 30 minutos de pausa o no grabación. Los audios fueron depositados en las colecciones biológicas del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, dentro de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA.

Personas asociadas al proyecto:

Curador
Orlando Acevedo-Charry

Métodos de Muestreo

Para este muestreo acústico pasivo usamos grabadoras automáticas ensambladas por el proyecto ARBIMON de Sieve Analytics Inc, que consisten en un celular Motorola MotoG dentro de un estuche de protección y con un micrófono externo acoplado (Deichmann et al., 2017, Herrera-Montes, 2018). Las grabadoras tenían instalada la aplicación Arbimon Touch para Android, que permite escoger diferentes esquemas de grabación. Dependiendo de cada proyecto, escogimos entre tres esquemas de grabación de 1 minuto de audio variando el espaciado entre descansos de 5, 10 o 30 minutos. Cada punto de muestreo se seleccionaba según criterio del investigador en campo, intentando siempre incluir por lo menos de 50 a 100 m de la misma cobertura para captar la huella acústica del hábitat escogido y asumiendo independencia a cada punto. Este tipo de grabadoras, aunque depende de las barreras que el medio le ponga al sonido, pueden captar una semiesfera de ~50 m a la redonda (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Las grabadoras duraron en el campo por períodos de 1 hasta 20 días.

Área de Estudio El muestreo ocurrió en 79 sitios que abarcan diferentes condiciones ambientales en Colombia. Sin embargo, muchos de los muestreos no fueron simultáneos, pues la instalación de las grabadoras podría considerarse oportunista y dependiente de las salidas al campo y las preguntas de investigación de cada proyecto. A lo largo de 2018 y 2019, fueron instaladas grabadoras con diferentes esquemas de grabación. En algunos sitios las grabadoras alcanzaron a obtener la totalidad esperada por día a partir de los esquemas propuestos (Figura 2a). La selección del esquema de grabación (1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos) estuvo a cargo del investigador en cada salida, pero al parecer puede verse una tendencia en el muestreo de esquemas muy intensos (1 minuto cada 5 minutos) en ecosistemas altoandinos y un poco más espaciada (1 minuto cada 30 minutos) en zonas bajas.
Control de Calidad Verificamos el funcionamiento de cada grabadora en campo, revisando que la hora y fecha correspondiera al momento de muestreo, así como que tuviera capacidad de batería y memoria. A cada punto de muestreo le asignamos un nombre para poder rastrear cada evento de recolecta de datos. Tres sitios donde la grabadora no fue correctamente instalada (falla en fecha y hora) fueron descartados dentro del proceso de control de calidad. La matriz final obtenida fue verificada por el personal de la Infraestructura Institucional de Datos (I2D) del Instituto Humboldt.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. 1. Programación de las grabadoras: siguiendo el protocolo propuesto por Sieve Analytics Inc, desde la aplicación ARBIMON Touch directamente en el celular. Fue confirmado que la batería, fecha y hora del dispositivo correspondieran al evento de muestreo en campo. 2. Asignación del esquema de muestreo: se seleccionó grabar 1 minuto cada 5, 10 o 30 minutos. 3. Instalación de las grabadoras en el lugar destinado para grabar, por una duración de 1 a 20 días. 4. Registro de las coordenadas geográficas y elevación del punto de muestreo utilizando un GPS. 5. Desinstalación de las grabadoras y descarga de los archivos en un computador 6. Almacenamiento en la colección siguiendo los estándares definidos.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Colección de Sonidos Ambientales del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Identificador de la Colección IAvH-CSA
Identificador de la Colección Parental No aplica
Métodos de preservación de los ejemplares Otro
Unidades Curatoriales Entre 1 y 40,704 grabaciones WAV y FLAC

Metadatos Adicionales

Propósito Cada lugar en el planeta tiene una huella acústica particular (Krause, 1987). Sin embargo, muchos lugares en el mundo aún no cuentan con información acústica registrada que permita caracterizar su huella. Similar a otros componentes de la biodiversidad, la colecta de sonidos puede abordarse desde una perspectiva activa y direccional (Parker, 1991), o puede ser integrado en muestreos pasivos con sensores acústicos automatizados que no incluyen interferencia por el observador (Aide et al., 2013; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). El muestreo pasivo con sensores acústicos permite obtener datos de señales acústicas de manera efectiva, lo cual es una gran oportunidad para estudiar la biodiversidad tropical (Deichmann et al., 2018; Rodríguez-Buriticá et al., 2019). Un posible enfoque de esta herramienta es medir la huella acústica a partir del análisis de paisajes sonoros, los cuales pueden variar a través de gradientes de elevación (Campos-Cerqueira & Aide, 2017), en respuesta al disturbio (Deichmann et al., 2017) o por tipos de cobertura (Furumo & Aide, 2019). Adicionalmente, los datos obtenidos por muestreo pasivo con sensores acústicos permiten abordar preguntas direccionadas a la actividad acústica de especies en particular (Campos-Cerqueira & Aide, 2016). Entre 2018 y 2019, algunos proyectos del Instituto Humboldt incluyeron eventos de muestreo acústico pasivo para complementar muestreos de biodiversidad. Para esto, algunas veces fueron invitados investigadores de la Colección de Sonidos Ambientales IAvH-CSA, o fue solicitado apoyo a esta colección para poder tener muestras de este tipo dentro de los proyectos particulares. El objetivo de los muestreos fue compilar muestras acústicas de mínimo un día en diferentes lugares de Colombia que incluyen los Andes (Boyacá, Cundinamarca, Meta y Santander), la Amazonia (Caquetá) y el Caribe (Sucre y Bolívar), que contribuyeran al futuro crecimiento de la colección y al enriquecimiento del conocimiento ecoacústico del país.
Identificadores Alternativos 10.15472/ocpi3r
e98d3337-f7d7-454a-abae-c82d2d6010a9
https://ipt.biodiversidad.co/iavh/resource?r=sonidos_iavh-csa