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Base de Datos de Flora de la Cuenca del Río Orinoco en Colombia

Última versión Publicado por Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI en 21 de mayo de 2021 Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI
La Orinoquía colombiana ha sido percibida como una región relativamente homogénea. Sin embargo, la cuenca del río Orinoco abarca tanto las tierras planas conocidas como “llanos” como las zonas montañosas del piedemonte de la vertiente oriental de la Cordillera Oriental, lo que le da una amplia heterogeneidad ambiental única en el mundo. En este trabajo se presenta una base de datos con los registros biológicos de las plantas vasculares y no vasculares de la Orinoquía colombiana. Esta base de datos fue construida a partir de los registros biológicos de los herbarios COAH, COL y FMB; y complementada con la información disponible en el Catálogo de las Plantas y Líquenes de Colombia y en la plataforma GBIF. Se obtuvo un total de 26014 registros que corresponden a 4899 especies. Este artículo c... Más

Descripción

La Orinoquía colombiana ha sido percibida como una región relativamente homogénea. Sin embargo, la cuenca del río Orinoco abarca tanto las tierras planas conocidas como “llanos” como las zonas montañosas del piedemonte de la vertiente oriental de la Cordillera Oriental, lo que le da una amplia heterogeneidad ambiental única en el mundo. En este trabajo se presenta una base de datos con los registros biológicos de las plantas vasculares y no vasculares de la Orinoquía colombiana. Esta base de datos fue construida a partir de los registros biológicos de los herbarios COAH, COL y FMB; y complementada con la información disponible en el Catálogo de las Plantas y Líquenes de Colombia y en la plataforma GBIF. Se obtuvo un total de 26014 registros que corresponden a 4899 especies. Este artículo constituye el primer trabajo sobre la diversidad florística de la cuenca del río Orinoco en Colombia, documentado con registros depositados en herbarios, lo que lo convierte en una herramienta fundamental para establecer el grado de conocimiento de la flora en la región.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 26.014 registros.

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Sua T., S.M., M.F., Gonzalez., D. Cárdenas L. & H. Mendoza. (2017): Base de Datos de Flora de la Cuenca del Río Orinoco en Colombia. Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas Sinchi y Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Dataset/Occurrence. http://ipt.biodiversidad.co/sinchi/resource?r=flora_orinoco&v=2.7

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Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 5f78d639-26ec-473b-90c9-4efe59a0632d.  Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras clave

Occurrence; Observation; Colombia; Orinoquía; Diversidad florística; Flora; Plantas; Cuenca hidrográfica;

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Investigadora
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas Sinchi
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Curador Herbario FMB
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Claustro de San Agustín, Carrera 8 No. 15-08
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Cobertura geográfica

La cuenca del río Orinoco en Colombia se define en el presente trabajo como el área comprendida entre el río Arauca en el departamento de Arauca y río Meta en el departamento del Casanare, por el norte, hasta la divisoria de aguas del río Inírida, Atabapo y Guaviare al sur, y desde la divisoria de aguas de la vertiente oriental de la cordillera Oriental al occidente, hasta el río Orinoco al oriente (Romero et al. 2004). Abarca un gradiente altitudinal entre 50 m de altitud y 5.100 m de altitud. La precipitación en la cuenca presenta un régimen de distribución unimodal biestacional con dos épocas contrastantes: la época de lluvias entre abril y octubre y la época de sequía entre noviembre y mayo. Por otra parte, entre mayo y julio se presentan los valores máximos de humedad y se concentra el 50 y 80% de la precipitación anual (Minorta-Cely y Rangel-Ch., 2014).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [1,99, -74,82], Latitud Máxima Longitud Máxima [7,48, -66,73]

Cobertura taxonómica

La base de datos de plantas de la cuenca del río Orinoco en Colombia se compiló a partir de los registros biológicos disponibles en las colecciones del Herbario Amazónico Colombiano COAH (Sinchi, 2016), Herbario Nacional Colombiano COL (ICN, 2016) y el Herbario Federico Meden Bogotá FMB (IAvH, 2016) y finalmente se complementó con los registros del Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia (Bernal et al., 2016) y de la plataforma Global Biodiversity Information Facility (GBIF, 2016). Los datos fueron compilados teniendo como base la información sobre taxonomía (familia, género y especie), datos de colecta (nombre y número de colector), fuente del dato (sigla del herbario), determinación (nombre científico), determinador (nombre de quien determina el espécimen) y datos de referencia geográfica (coordenadas geográficas y departamento).

Familia  ACANTHACEAE,  ACHARIACEAE,  ACTINIDIACEAE,  ADOXACEAE,  ALISMATACEAE,  ALSTROEMERIACEAE,  AMARANTHACEAE,  AMARYLLIDACEAE,  ANACARDIACEAE,  ANEMIACEAE,  ANNONACEAE,  APIACEAE,  APOCYNACEAE,  AQUIFOLIACEAE,  ARACEAE,  ARALIACEAE,  ARECACEAE,  ARISTOLOCHIACEAE,  ASPLENIACEAE,  ASTERACEAE,  ATHELIACEAE,  ATHYRIACEAE,  BAEOMYCETACEAE,  BALANOPHORACEAE,  BALSAMINACEAE,  BARTRAMIACEAE,  BASELLACEAE,  BEGONIACEAE,  BERBERIDACEAE,  BIGNONIACEAE,  BIXACEAE,  BLECHNACEAE,  BONNETIACEAE,  BORAGINACEAE,  BRACHYTHECIACEAE,  BRASSICACEAE,  BROMELIACEAE,  BRUNELLIACEAE,  BRYACEAE,  BURMANNIACEAE,  BURSERACEAE,  CABOMBACEAE,  CACTACEAE,  CALOPHYLLACEAE,  CALYMPERACEAE,  CALYPOGEIACEAE,  CAMPANULACEAE,  CANNABACEAE,  CANNACEAE,  CAPPARACEAE,  CAPRIFOLIACEAE,  CARDIOPTERIDACEAE,  CARICACEAE,  CARYOCARACEAE,  CARYOPHYLLACEAE,  CELASTRACEAE,  CHLORANTHACEAE,  CHRYSOBALANACEAE,  CLADONIACEAE,  CLEOMACEAE,  CLETHRACEAE,  CLUSIACEAE,  COLLEMATACEAE,  COMBRETACEAE,  COMMELINACEAE,  CONNARACEAE,  CONVOLVULACEAE,  COSTACEAE,  CRASSULACEAE,  CUCURBITACEAE,  CUNONIACEAE,  CYATHEACEAE,  CYCLANTHACEAE,  CYPERACEAE,  CYRILLACEAE,  DALTONIACEAE,  DAVALLIACEAE,  DENNSTAEDTIACEAE,  DICHAPETALACEAE,  DICRANACEAE,  DILLENIACEAE,  DIOSCOREACEAE,  DROSERACEAE,  DRYOPTERIDACEAE,  EBENACEAE,  ELAEOCARPACEAE,  EQUISETACEAE,  ERICACEAE,  ERIOCAULACEAE,  ERYTHROPALACEAE,  ERYTHROXYLACEAE,  ESCALLONIACEAE,  EUPHORBIACEAE,  EUPHRONIACEAE,  FABACEAE,  FAGACEAE,  FISSIDENTACEAE,  GENTIANACEAE,  GERANIACEAE,  GESNERIACEAE,  GLEICHENIACEAE,  GNETACEAE,  GOUPIACEAE,  GRAPHIDACEAE,  GROSSULARIACEAE,  HAEMODORACEAE,  HALORAGACEAE,  HELICONIACEAE,  HELIOTROPIACEAE,  HERBERTACEAE,  HERNANDIACEAE,  HOOKERIACEAE,  HUMIRIACEAE,  HYDRANGEACEAE,  HYDROCHARITACEAE,  HYDROLEACEAE,  HYLOCOMIACEAE,  HYMENOPHYLLACEAE,  HYPERICACEAE,  HYPNACEAE,  HYPOXIDACEAE,  ICACINACEAE,  IRIDACEAE,  ISOETACEAE,  IXONANTHACEAE,  JUBULACEAE,  JUNCACEAE,  JUNGERMANNIACEAE,  LACISTEMATACEAE,  LAMIACEAE,  LAURACEAE,  LECYTHIDACEAE,  LEJEUNEACEAE,  LEMBOPHYLLACEAE,  LENTIBULARIACEAE,  LEUCOMIACEAE,  LINACEAE,  LINDERNIACEAE,  LINDSAEACEAE,  LOASACEAE,  LOBARIACEAE,  LOGANIACEAE,  LOMARIOPSIDACEAE,  LORANTHACEAE,  LYCOPODIACEAE,  LYGODIACEAE,  LYTHRACEAE,  MALPIGHIACEAE,  MALVACEAE,  MARANTACEAE,  MARATTIACEAE,  MARCGRAVIACEAE,  MARCHANTIACEAE,  MARSILEACEAE,  MAYACACEAE,  MELASTOMATACEAE,  MELIACEAE,  MENISPERMACEAE,  MENYANTHACEAE,  METAXYACEAE,  METEORIACEAE,  METTENIUSACEAE,  MOLLUGINACEAE,  MONIMIACEAE,  MORACEAE,  MUNTINGIACEAE,  MUSACEAE,  MYRICACEAE,  MYRISTICACEAE,  MYRTACEAE,  NECKERACEAE,  NYCTAGINACEAE,  NYMPHAEACEAE,  OCHNACEAE,  OCTOBLEPHARACEAE,  OLACACEAE,  OLEACEAE,  OLEANDRACEAE,  ONAGRACEAE,  OPILIACEAE,  ORCHIDACEAE,  OROBANCHACEAE,  ORTHOTRICHACEAE,  OXALIDACEAE,  PALLAVICINIACEAE,  PAPAVERACEAE,  PARMELIACEAE,  PASSIFLORACEAE,  PELTIGERACEAE,  PENTAPHYLACACEAE,  PHYLLANTHACEAE,  PHYLLOGONIACEAE,  PHYSCIACEAE,  PHYTOLACCACEAE,  PICRAMNIACEAE,  PICRODENDRACEAE,  PILOTRICHACEAE,  PINACEAE,  PIPERACEAE,  PLANTAGINACEAE,  PLUMBAGINACEAE,  POACEAE,  PODOCARPACEAE,  PODOSTEMACEAE,  POLEMONIACEAE,  POLYGALACEAE,  POLYGONACEAE,  POLYPODIACEAE,  POLYTRICHACEAE,  PONTEDERIACEAE,  PORTULACACEAE,  POTAMOGETONACEAE,  POTTIACEAE,  PRIMULACEAE,  PRIONODONTACEAE,  PROTEACEAE,  PTERIDACEAE,  PUTRANJIVACEAE,  RACOPILACEAE,  RANUNCULACEAE,  RAPATEACEAE,  RHACOCARPACEAE,  RHAMNACEAE,  RHIZOPHORACEAE,  ROSACEAE,  RUBIACEAE,  RUTACEAE,  SABIACEAE,  SACCOLOMATACEAE,  SALICACEAE,  SALVINIACEAE,  SANTALACEAE,  SAPINDACEAE,  SAPOTACEAE,  SCHIZAEACEAE,  SCHLEGELIACEAE,  SCROPHULARIACEAE,  SELAGINELLACEAE,  SEMATOPHYLLACEAE,  SIMAROUBACEAE,  SIPARUNACEAE,  SMILACACEAE,  SOLANACEAE,  SPHAEROPHORACEAE,  SPHAGNACEAE,  SPHENOCLEACEAE,  STAPHYLEACEAE,  STEMONURACEAE,  STEREOPHYLLACEAE,  STRELITZIACEAE,  STYRACACEAE,  SYMPLOCACEAE,  TALINACEAE,  TAPISCIACEAE,  TECTARIACEAE,  THEACEAE,  THELYPTERIDACEAE,  THUIDIACEAE,  THURNIACEAE,  THYMELAEACEAE,  TOVARIACEAE,  TRIGONIACEAE,  ULMACEAE,  URTICACEAE,  VELLOZIACEAE,  VERBENACEAE,  VIOLACEAE,  VITACEAE,  VOCHYSIACEAE,  XYRIDACEAE,  ZINGIBERACEAE
Forma  TETRAMERISTACEAE

Cobertura temporal

Fecha Inicial 2017-03-15

Datos del proyecto

La Orinoquía colombiana ha sido percibida como una región relativamente homogénea. Sin embargo, la cuenca del río Orinoco abarca tanto las tierras planas conocidas como “llanos” como las zonas montañosas del piedemonte de la vertiente oriental de la Cordillera Oriental, lo que le da una amplia heterogeneidad ambiental única en el mundo. En este trabajo se presenta una base de datos con los registros biológicos de las plantas vasculares y no vasculares de la Orinoquía colombiana. Esta base de datos fue construida a partir de los registros biológicos de los herbarios COAH, COL y FMB; y complementada con la información disponible en el Catálogo de las Plantas y Líquenes de Colombia y en la plataforma GBIF. Se obtuvo un total de 26014 registros que corresponden a 4899 especies. Este artículo constituye el primer trabajo sobre la diversidad florística de la cuenca del río Orinoco en Colombia, documentado con registros depositados en herbarios, lo que lo convierte en una herramienta fundamental para establecer el grado de conocimiento de la flora en la región.

Título Base de Datos Flora de la Cuenca del Río Orinoco en Colombia
Descripción del área de estudio La cuenca del río Orinoco en Colombia se define en el presente trabajo como el área comprendida entre el río Arauca en el departamento de Arauca y río Meta en el departamento del Casanare, por el norte, hasta la divisoria de aguas del río Inírida, Atabapo y Guaviare al sur, y desde la divisoria de aguas de la vertiente oriental de la cordillera Oriental al occidente, hasta el río Orinoco al oriente (Romero et al. 2004). Abarca un gradiente altitudinal entre 50 m de altitud y 5.100 m de altitud. La precipitación en la cuenca presenta un régimen de distribución unimodal biestacional con dos épocas contrastantes: la época de lluvias entre abril y octubre y la época de sequía entre noviembre y mayo. Por otra parte, entre mayo y julio se presentan los valores máximos de humedad y se concentra el 50 y 80% de la precipitación anual (Minorta-Cely y Rangel-Ch., 2014).
Descripción del diseño La base de datos de plantas de la cuenca del río Orinoco en Colombia se compiló a partir de los registros biológicos disponibles en las colecciones del Herbario Amazónico Colombiano COAH (Sinchi, 2016), Herbario Nacional Colombiano COL (ICN, 2016) y el Herbario Federico Meden Bogotá FMB (IAvH, 2016) y finalmente se complementó con los registros del Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia (Bernal et al., 2016) y de la plataforma Global Biodiversity Information Facility (GBIF, 2016). Los datos fueron compilados teniendo como base la información sobre taxonomía (familia, género y especie), datos de colecta (nombre y número de colector), fuente del dato (sigla del herbario), determinación (nombre científico), determinador (nombre de quien determina el espécimen) y datos de referencia geográfica (coordenadas geográficas y departamento). Una vez estructurada la información, se depuró la base de datos eliminando los registros duplicados (con igual colector y número de colección) y para los registros duplicados pero con doble determinación, se conservó el registro identificado por el especialista del grupo taxonómico en cuestión. Posteriormente se validaron todos los nombres científicos usando la herramienta Taxonomic Name Resolution Service v4.0 (Boyle et al., 2013); los registros con problemas taxonómicos fueron revisados uno a uno y se seleccionaron como nombres válidos aquellos aceptados en el Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia (Bernal et al., 2016).

Personas asociadas al proyecto:

Autor
Dairon Cárdenas López
Autor
Humberto Mendoza
Autor
Maria Fernanda González Giraldo
Autor
Sonia Mireya Sua Tunjano

Métodos de muestreo

La base de datos de plantas de la cuenca del río Orinoco en Colombia se compiló a partir de los registros biológicos disponibles en las colecciones del Herbario Amazónico Colombiano COAH (Sinchi, 2016), Herbario Nacional Colombiano COL (ICN, 2016) y el Herbario Federico Meden Bogotá FMB (IAvH, 2016) y finalmente se complementó con los registros del Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia (Bernal et al., 2016) y de la plataforma Global Biodiversity Information Facility (GBIF, 2016).

Área de Estudio La cuenca del río Orinoco en Colombia se define en el presente trabajo como el área comprendida entre el río Arauca en el departamento de Arauca y río Meta en el departamento del Casanare, por el norte, hasta la divisoria de aguas del río Inírida, Atabapo y Guaviare al sur, y desde la divisoria de aguas de la vertiente oriental de la cordillera Oriental al occidente, hasta el río Orinoco al oriente (Romero et al. 2004). Abarca un gradiente altitudinal entre 50 m de altitud y 5.100 m de altitud.
Control de Calidad Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos de registros: basisOfRecord y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; Elemento geográfico: county.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Los datos fueron compilados teniendo como base la información sobre taxonomía (familia, género y especie), datos de colecta (nombre y número de colector), fuente del dato (sigla del herbario), determinación (nombre científico), determinador (nombre de quien determina el espécimen) y datos de referencia geográfica (coordenadas geográficas y departamento). Una vez estructurada la información, se depuró la base de datos eliminando los registros duplicados (con igual colector y número de colección) y para los registros duplicados pero con doble determinación, se conservó el registro identificado por el especialista del grupo taxonómico en cuestión. Posteriormente se validaron todos los nombres científicos usando la herramienta Taxonomic Name Resolution Service v4.0 (Boyle et al., 2013); los registros con problemas taxonómicos fueron revisados uno a uno y se seleccionaron como nombres válidos aquellos aceptados en el Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia (Bernal et al., 2016).

Datos de la colección

Nombre de la Colección Herbario Amazónico Colombiano
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 1
Identificador de la Colección Parental COAH
Métodos de preservación de los ejemplares Secado y prensado
Unidades curatoriales Entre 1 y 26.014 pliegos

Referencias bibliográficas

  1. Bernal, R., Gradstein, S. R. & Celis, M. (eds.). 2016. Catálogo de Líquenes y Plantas Vasculares de Colombia. Bogotá: Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia. Consultado 15 ene. 2017. Disponible en http://catalogoplantasdecolombia.unal.edu.co/es/ http://catalogoplantasdecolombia.unal.edu.co/es/
  2. Boyle, B. et al. 2013. The taxonomic name resolution service: an online tool for automated standardization of plant names. BMC Bioinformatics 14:16. doi:10.1186/1471-2105-14-16 Consultado 15 ene. 2017. Disponible en http://tnrs.iplantcollaborative.org http://tnrs.iplantcollaborative.org
  3. Global Biodiversity Infomation Facility (GBIF). 2016. Especimenes botánicos de las colecciones: Botany (doi:10.15468/pyjtoc), CAS (doi:10.15468/7gudyo), CBG (doi:10.15468/rhzrxw), Coleção Botânica, Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA) (doi:10.15468/5ictpz), CONN (doi:10.15468/w35jmd), HEV (doi:10.15468/hopy6i), HPUJ (doi:10.15468/zxyh2y), HUA (doi:10.15468/ndwmnk), HUCO (doi:10.15468/ytds5n), HUIS (doi:10.15468/l8jiim), ICESI (doi:10.15468/macjoc), JBRJ herbarium–RB (doi:10.15468/7ep9i2), MA (doi:10.15468/aj41tg), MBM (doi:10.15468/g6ppmt), MO (doi:10.15468/hja69f), NY (doi:10.15468/6e8nje), BOT (doi:10.5519/0002965), PSO (doi:10.15468/w0o7vt), SP-Instituto de Botânica-IBT (doi:10.15468/axlcjr), Tropicos (doi:10.15468/hja69f) y US (doi:10.15468/dipjcr), VascularPlants (doi:10.15468/yo3mmu). Descargado de http://www.gbif.org/occurrence el día 03 marzo de 2016.
  4. Giraldo-Cañas, D. 2008. Revisión del género Axonopus (poaceae: paniceae): primer registro del género en europa y novedades taxonómicas. Caldasia 30 (2): 301-314.
  5. Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI, 2016. Herbario Amazónico Colombiano-COAH. Datos de registros de la colección. doi:10.15472/l7odt1
  6. Instituto de Ciencias Naturales, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia (ICN). 2016. Colecciones en línea – Herbario COL. Consultado 15 mar. 2016. Disponible en http://www.biovirtual.unal.edu.co/ICN/?controlador=Forms&accion=quickFormScientific&group=1&searchType=scientific doi:10.15468/qwcndz
  7. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IavH). 2016. Colección Herbario Federico Medem Bogotá - FMB. 107293 registros, aportados por: Medina-Uribe, C. (Contacto del recurso), Borja-Acosta, K. (Creador del recurso, Proveedor de los metadatos). Versión 31.0. http://doi:10.15472/j8284t doi:10.15472/j8284t
  8. Minorta-Cely, V. & Rangel-Ch., O. 2014. La Riqueza y la Diversidad de las plantas con flores de la Orinoquia Colombiana. 237-418 pp. En: Rangel-Ch JO. 2014. Colombia Diversidad Biótica XIV. La región de la Orinoquia de Colombia. Universidad Nacional de Colombia, sede Bogotá, Facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales. Bogotá. 895 pp.
  9. Rincón-E AJ, JO Rangel-Ch, J Aguirre-C. 2014. Musgos, líquenes, helechos y afines de la Orinoquia Colombiana. 419-445 pp. En: Rangel-Ch JO. 2014. Colombia Diversidad Biótica XIV. La región de la Orinoquia de Colombia. Universidad Nacional de Colombia, sede Bogotá, Facultad de Ciencias, Instituto de Ciencias Naturales. Bogotá. 895 pp.
  10. Romero M, G Galindo, J Otero, D Armenteras. 2004. Ecosistemas de la cuenca del Orinoco colombiano. Instituto Alexander von Humboldt, Bogotá. 189 pp.
  11. Cárdenas, D., Mendoza, H., González, M.F., Sua, S.M.. 2016. Flora de la Cuenca del río Orinoco en Colombia: Grado de Conocimiento, Uso y Conservación. Revista Colombia Amazónica. Nueva Época No. 9. Diciembre de 2016. Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI. Bogotá. pp 93-146.

Metadatos adicionales

Propósito La información aquí presentada constituye la compilación más actualizada acerca de la flora de la cuenca del río Orinoco en Colombia. La base de datos generada está homologada taxonómicamente con el Catálogo de Plantas y Líquenes de Colombia.
Identificadores alternativos doi:10.15472/2dbndj
5f78d639-26ec-473b-90c9-4efe59a0632d
https://ipt.biodiversidad.co/sinchi/resource?r=flora_orinoco