OCCURRENCE

Herbario Amazónico Colombiano

最新バージョン Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI によって公開 2023/09/28 Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI
Colección biológica del Herbario Amazónico Colombiano COAH, perteneciente al Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI y que se encuentra registrado ante el Registro Nacional de Colecciones desde el 28 de marzo de 2001. Los registros han sido colectados desde el año 1856 hasta el año 2021, abarcando toda la región amazónica, cubriendo 5 países en total con un 99% de los registros en Colombia.... 以上

説明

Colección biológica del Herbario Amazónico Colombiano COAH, perteneciente al Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI y que se encuentra registrado ante el Registro Nacional de Colecciones desde el 28 de marzo de 2001. Los registros han sido colectados desde el año 1856 hasta el año 2021, abarcando toda la región amazónica, cubriendo 5 países en total con un 99% de los registros en Colombia.

Este recurso cuenta a la fecha con 112.415 registros de plantas, pertenecientes a 246 familias, abarcando plantas vasculares y no vasculares. Un 89% se encuentra clasificado a nivel de especie, 9% a nivel de género y 2% a nivel de familia. Se incluyen 244 secuencias de ADN asociadas a 244 registros.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、112,405 レコードが含まれています。

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 112,405 レコード Spanish で (10 MB) - 更新頻度: unknown
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (63 kB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (26 kB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Cárdenas D, Sua S, Castaño Arboleda N (2023): Herbario Amazónico Colombiano. v9.14. Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/l7odt1

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 9b73f44e-bbe1-4fd1-a7a9-c96c38dcf884が割り当てられています。   Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているInstituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Herbario Amazónico Colombiano; COAH; Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI; Instituto SINCHI; Herbario; Colección biológica; Colección botánica; Amazonas; Cuenca amazónica; Amazonía colombiana; Occurrence; Specimen

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

連絡先

リソースを作成した人:

Dairon Cárdenas
Curador – Director Herbario Amazónico Colombiano – COAH
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
+57 14442060
http://www.sinchi.org.co/
Sonia Sua
Investigadora
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
+57 14442060
http://www.sinchi.org.co/
Nicolás Castaño Arboleda
Investigador
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
http://www.sinchi.org.co/

リソースに関する質問に答えることができる人:

Dairon Cárdenas
Curador – Director Herbario Amazónico Colombiano – COAH
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
+57 14442060
http://www.sinchi.org.co/

メタデータを記載した人:

Sonia Sua
Investigadora
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá D.C.
Bogotá D.C.
CO
+57 14442060
http://www.sinchi.org.co/

他に、リソースに関連付けられていた人:

CustodianSteward(保管者)
Luz Marina Mantilla Cárdenas
Directora General
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas Sinchi
Calle 20 # 5 - 44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
+57 14442060
http://www.sinchi.org.co/
データ処理者
Nerieth Goretti Leuro Robles
Contratista
SiB Colombia
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO

地理的範囲

Datos de colección de la cuenca amazónica en 5 países: Colombia (111.674), Perú (373), Brasil (229), Ecuador (86) y Venezuela (53).

座標(緯度経度) 南 西 [-10.35, -76.79], 北 東 [5.3, -57.5]

生物分類学的範囲

La colección Herbario Amazónico Colombiano se encuentra organizada filogenéticamente bajo el sistema de Cronquist, A. 1981, esta colección cuenta con cerca de 120.000 ejemplares de plantas vasculares y 7.500 de plantas no vasculares catalogados. De la totalidad de plantas vasculares, el 99% cuenta con determinación taxonómica hasta el nivel de familia, el 98% hasta género y el 84% hasta especie. Mientras que del total de plantas no vasculares, el 90% cuentan con determinación a familia, el 85% determinación hasta género y el 62% determinación hasta especie.

Family  Acanthaceae,  Actinidiaceae,  Agavaceae,  Alismataceae,  Amaranthaceae,  Anacardiaceae,  Anemiaceae,  Anisophylleaceae,  Annonaceae,  Apiaceae,  Apocynaceae,  Aquifoliaceae,  Araceae,  Araliaceae,  Arecaceae,  Aristolochiaceae,  Asclepiadaceae,  Aspleniaceae,  Asteraceae,  Balanophoraceae,  Balsaminaceae,  Begoniaceae,  Bignoniaceae,  Bixaceae,  Blechnaceae,  Bombacaceae,  Boraginaceae,  Brassicaceae,  Bromeliaceae,  Brunelliaceae,  Burmanniaceae,  Burseraceae,  Cabombaceae,  Cactaceae,  Caesalpiniaceae,  Campanulaceae,  Cannabinaceae,  Cannaceae,  Capparaceae,  Caprifoliaceae,  Caricaceae,  Caryocaraceae,  Caryophyllaceae,  Cecropiaceae,  Celastraceae,  Chenopodiaceae,  Chloranthaceae,  Chrysobalanaceae,  Clethraceae,  Clusiaceae,  Cochlospermaceae,  Combretaceae,  Commelinaceae,  Connaraceae,  Convolvulaceae,  Costaceae,  Crassulaceae,  Cucurbitaceae,  Cupressaceae,  Cyatheaceae,  Cycadaceae,  Cyclanthaceae,  Cyperaceae,  Cyrillaceae,  Davalliaceae,  Dennstaedtiaceae,  Dichapetalaceae,  Dicksoniaceae,  Dilleniaceae,  Dioscoreaceae,  Dipterocarpaceae,  Droseraceae,  Dryopteridaceae,  Ebenaceae,  Elaeocarpaceae,  Equisetaceae,  Ericaceae,  Eriocaulaceae,  Erythroxylaceae,  Euphorbiaceae,  Fabaceae,  Flacourtiaceae,  Gentianaceae,  Geraniaceae,  Gesneriaceae,  Gleicheniaceae,  Gnetaceae,  Haemodoraceae,  Heliconiaceae,  Hernandiaceae,  Hippocastanaceae,  Hippocrateaceae,  Hugoniaceae,  Humiriaceae,  Hydrangeaceae,  Hydrocharitaceae,  Hydrophyllaceae,  Hymenophyllaceae,  Icacinaceae,  Iridaceae,  Ixonanthaceae,  Lacistemataceae,  Lamiaceae,  Lauraceae,  Lecythidaceae,  Lentibulariaceae,  Lepidobotryaceae,  Liliaceae,  Limnocharitaceae,  Lindsaeaceae,  Lissocarpaceae,  Loasaceae,  Loganiaceae,  Lomariopsidaceae,  Loranthaceae,  Lycopodiaceae,  Lygodiaceae,  Lythraceae,  Magnoliaceae,  Malpighiaceae,  Malvaceae,  Marantaceae,  Marattiaceae,  Marcgraviaceae,  Marsileaceae,  Mayacaceae,  Melastomataceae,  Meliaceae,  Mendonciaceae,  Menispermaceae,  Menyanthaceae,  Metaxyaceae,  Metteniusaceae,  Mimosaceae,  Monimiaceae,  Moraceae,  Musaceae,  Myricaceae,  Myristicaceae,  Myrsinaceae,  Myrtaceae,  Nyctaginaceae,  Nymphaeaceae,  Ochnaceae,  Olacaceae,  Oleaceae,  Oleandraceae,  Onagraceae,  Opiliaceae,  Orchidaceae,  Oxalidaceae,  Papaveraceae,  Passifloraceae,  Pedaliaceae,  Phytolaccaceae,  Piperaceae,  Plantaginaceae,  Poaceae,  Podocarpaceae,  Podostemaceae,  Polemoniaceae,  Polygalaceae,  Polygonaceae,  Polypodiaceae,  Pontederiaceae,  Portulacaceae,  Primulaceae,  Proteaceae,  Pteridaceae,  Quiinaceae,  Ranunculaceae,  Rapateaceae,  Rhamnaceae,  Rhizophoraceae,  Rosaceae,  Rubiaceae,  Rutaceae,  Sabiaceae,  Salicaceae,  Salviniaceae,  Sapindaceae,  Sapotaceae,  Schizaeaceae,  Scrophulariaceae,  Selaginellaceae,  Simaroubaceae,  Smilacaceae,  Solanaceae,  Sphenocleaceae,  Staphyleaceae,  Sterculiaceae,  Strelitziaceae,  Styracaceae,  Symplocaceae,  Taccaceae,  Tectariaceae,  Tepuianthaceae,  Tetrameristaceae,  Theaceae,  Thelypteridaceae,  Theophrastaceae,  Thurniaceae,  Thymelaeaceae,  Tiliaceae,  Tovariaceae,  Trigoniaceae,  Triuridaceae,  Turneraceae,  Ulmaceae,  Urticaceae,  Velloziaceae,  Verbenaceae,  Violaceae,  Viscaceae,  Vitaceae,  Vochysiaceae,  Woodsiaceae,  Xyridaceae,  Zamiaceae,  Zingiberaceae,  Zygophyllaceae

時間的範囲

開始日 / 終了日 1856-02-11 / 2021-10-17

収集方法

No hay una metodología de muestreo dado que se trata de inventarios especialmente en áreas en donde hay vacíos de información.

Study Extent Cuenca Amazónica Colombiana, aunque también se tiene información de la cuenca completa.
Quality Control Hay un proceso desde la colecta en campo hasta la publicación de los datos y cada uno tiene un control de calidad. En el proceso de estructuración y validación de los datos, se realizó el control de la calidad de la información proporcionada por COAH. A continuación, se enumeran los procesos asociados a esta actividad: 1. Revisión de la información documentada asociada a los datos biológicos; 2. Estructuración de los datos en el estándar Darwin Core (DwC) según elementos, definiciones y vocabularios controlados; 3. Unificar el conjunto de datos ya publicado con los nuevos registros suministrados; 4. Validación y limpieza de la información consignada en el DwC, 4.1. Corrección de errores de tipeo, para esta tarea se usó OpenRefine, adicionalmente se identificaron datos erróneos como sinonimias, con el uso de la API de GBIF para validación taxonómica https://github.com/SIB-Colombia/data-quality-open-refine/blob/master/ValTaxonomicAPIGBIF_ValTaxonomicaAPIGBIF.txt, complementado con la información encontrada en tropicos https://www.tropicos.org/home y el catalogo de plantas y líquenes de Colombia https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=catalogo_plantas_liquenes 4.2. Se realizó la conversión de las fechas, acorde a lo exigido en el estándar, 4.3. Se llevó a cabo la visualización de las coordenadas para su validación utilizando el proyecto de QGIS https://sib-colombia.github.io/Formacion/LAB/lab02/lab_valCoord.html del SiB Colombia y http://iobis.github.io/plotter/; 5. Finalmente, la base datos DwC se validó haciendo uso del Validador de datos - GBIF.

Method step description:

  1. Esta metodología esta de acuerdo con el Proceso de Colecciones definido para la Gestión de Calidad. COLECTA Y PROCESAMIENTO DE EJEMPLARES BOTANICOS: La colección de las muestras botánicas se realiza en campo. Las cuales se prensan y numeran y a su vez en el cuaderno de campo se realiza la descripción de cada ejemplar con el número de colección, las muestras son alcoholizadas y enviadas como embalaje al Herbario Amazónico Colombiano COAH en Bogotá. Una vez en Bogotá, el material se coloca en el horno especializado para su deshidratación, a 80°C durante 12 horas, las muestras se separan con láminas de aluminio y cartón. Paralelamente, los datos de campo del cuaderno se digitan en un formato de fichas técnicas, éstas fichas una vez impresas se ingresan en cada una de las muestras botánicas ya secas. Con este paso se realiza una corroboración de ejemplares disecados frente al cuaderno de campo y sus datos.
  2. IDENTIFICACIÓN DEL MATERIAL Y SELECCIÓN PARA MONTAJE: Las colecciones botánicas secas se determinan taxonómicamente mediante comparación con la colección general del Herbario y con la ayuda de claves taxonómicas especializadas. Posteriormente se selecciona el material que va a ser montado, el cual se almacena en el taller de montaje.
  3. MONTAJE, SELLADO Y NUMERACIÓN DE EJEMPLARES BOTÁNICOS: Los ejemplares botánicos identificados taxonómicamente que están en buen estado y tienen alguna estructura fértil (flor o fruto) son montados en cartulina (cosidos y pegados), a cada ejemplar montado se le asigna un número de herbario consecutivo. Se almacenan en el taller para ser enviados a digitación.
  4. INGRESO A LA BASE DE DATOS: La información de cada ejemplar montado (ficha técnica y número de herbario único) se verifica e ingresa a la base datos conforme a "Serie de estándares para la gestión de información sobre biodiversidad en Colombia" (Suárez 2007). Se ingresa al congelador y son refrigerados por 24 horas, luego se almacena el sarcófago para clasificarlo e incorporado a la colección.
  5. INGRESO A LA COLECCIÓN: Una vez la información del ejemplar ha ingresado a la base de datos, cada ejemplar es incluido en la colección física del Herbario en la carpeta de acuerdo con el taxón correspondiente.
  6. FOTOGRAFIAS DE LA ESPECIE: Se selecciona un ejemplar representativo de la especie del cual se toma una fotografía digital, la cual se edita con las características definidas (600 x 800 pixeles) y posteriormente se copia al servidor en la carpeta correspondiente.
  7. PUBLICACION DE EJEMPLARES EN EL HERBARIO VIRTUAL: La información que ingresa a la base de datos se actualiza en el servidor web (Herbario Virtual) y se verifica, de acuerdo con el manual de usuario de la aplicación Herbario Virtual, cada seis meses se actualiza la información en el IPT SINCHI.

コレクションデータ

コレクション名 Herbario Amazónico Colombiano
コレクション識別子 https://www.gbif.org/grscicoll/collection/39da9440-3953-4ef8-97d4-a25c3524bfa6
Parent Collection Identifier COAH
コレクション名 Herbario Amazónico Colombiano
コレクション識別子 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 1
Parent Collection Identifier COAH
標本保存方法 Dried and pressed
Curatorialユニット 範囲 1 ~ 112,415 Pliego

追加のメタデータ

Estos ejemplares están depositados en el Herbario Amazónico Colombiano COAH. La actualización, estructuración y validación de los registros, se realizó con el apoyo de la Agencia Nacional de Hidrocarburos – ANH, en el Convenio Marco Interadministrativo No. 20-099 donde se suscribe el Convenio Interadministrativo No. 20-115, cuyo objeto es “Aunar esfuerzos técnicos, financieros, jurídicos y administrativos para consolidar información de medio Biótico, que permita la construcción de una línea base regional para el departamento del Putumayo que facilite los procesos de planeación para los sectores productivos y la empresa privada, como herramientas estratégicas para la toma de decisiones por parte de la Autoridad Ambiental”. Agradecemos a la ANH y al SiB Colombia por facilitar la publicación de estos datos asegurando que estén disponibles de manera libre y gratuita para las personas de la región y para el público interesado en familiarizarse con la gran diversidad y riqueza natural que alberga esta zona de la Amazonia colombiana.

代替識別子 9b73f44e-bbe1-4fd1-a7a9-c96c38dcf884
https://ipt.biodiversidad.co/sinchi/resource?r=coah_sinchi