Caracterización bacteriana del Distrito Nacional de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera, Pacífico colombiano - Proyecto Colombia BIO

Última versión Publicado por Universidad del Sinú Cartagena en Jun 12, 2020 Universidad del Sinú Cartagena

La propuesta de investigación de la Universidad del Sinú se enfocó, originalmente, a la evaluación de la contaminación microbiológica en agua y sedimentos para correlacionar con los contenidos observados en tejidos vivos de la especie de Piangua Anadara tuberculosa; sin embargo, una vez en campo el proyecto adquirió una dimensión mayor, ya que se tuvo la posibilidad de incluir la especie Anadara similis en los muestreos biológicos y a la posibilidad de realizar algunos análisis de laboratorio adicionales. En este contexto, se efectuó un relacionamiento con el personal de DIMAR a fin de complementar la información de contaminación en estas especies, para lo cual la Universidad del Sinú realizó la recolección y separación de muestras de Piangua, para adelantar el registro de hidrocarburos en estos organismos en los laboratorios del CIOH Pacífico.

Durante la fase de campo se logró obtener muestras de Piangua, agua y sedimentos en cuatro (4) localidades, a saber: Candelilla de la Mar, Teherán, Colombia Grande y Tumaco, donde también se registraron los valores de algunas variables fisicoquímicas en el agua superficial. El procesamiento del material biológico se llevó a cabo en el laboratorio montado en el buque “7 de agosto” de la Armada Nacional de Colombia. Las muestras de Piangua, agua y sedimento se almacenaron en congelación en el buque hasta su traslado por vía aérea al laboratorio de microbiología de la Universidad del Sinú – Seccional Cartagena.

En total se obtuvo información de 99 registros biológicos.

Registros

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Universidad del Sinú. (2019). Caracterización bacteriana del Distrito Nacional de Manejo Integrado Cabo Manglares Bajo Mira y Frontera, Pacífico colombiano - Proyecto Colombia BIO. Versión 1.0. 99 registros, aportados por: Zarza E, López L, C. Conjunto de datos/Registros biológicos.

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Palabras Clave

Occurrence; Specimen; Caracterización; aislados bacterianos; agua; sedimento; tejidos blandos; Piangua; Anadara tuberculosa; Anadara similis); gradiente ambiental; Tumaco; Candelilla de la Mar; bioindicador; biorremediación; patógeno; PACÍFICO; COLOMBIA_BIO; SIB_MARINO; SEAFLOWER

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Lersy López
Universidad del Sinú Avenida el Bosque, Transversal 54 No. 30 729 Cartagena de Indias Bolivar CO 57 (5) 681-0801
https://www.unisinucartagena.edu.co/
Esteban Zarza
Investigador
Universidad del Sinú Avenida el Bosque, Transversal 54 No. 30 729 Cartagena de Indias Bolivar CO 57 (5) 681-0801
https://www.unisinucartagena.edu.co/

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Sabrina Monsalve
Coordinadora Plan Nacional de Expediciones Científicas Pacífico
Comisión Colombiana del Océano Avenida Ciudad de Cali N° 51-66 Oficina 306, Edificio WBC Bogotá, D.C. Bogotá, D.C. CO (+57) (1) 555 6122 Ext. 1003
http://www.cco.gov.co

¿Quién documentó los metadatos?:

Lersy López
Investigadora
Universidad del Sinú Avenida el Bosque, Transversal 54 No. 30 729 Cartagena de Indias Bolivar CO 57 (5) 681-0801
https://www.unisinucartagena.edu.co/

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Autor
Esteban Zarza
Invetigador
Universidad del Sinú Avenida el Bosque, Transversal 54 No. 30 729 Cartagena de Indias Bolivar CO 57 (5) 681-0801
https://www.unisinucartagena.edu.co/
Autor
Lersy López
Invetigadora
Universidad del Sinú Avenida el Bosque, Transversal 54 No. 30 729 Cartagena de Indias Bolivar CO 57 (5) 681-0801
https://www.unisinucartagena.edu.co/

Cobertura Geográfica

El proyecto se llevó a cabo en el Departamento de Nariño en el sector meridional del Pacífico colombiano, entre la bahía de Tumaco y la localidad de Candelilla de la Mar en cercanías de la línea limítrofe con el Ecuador

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [1.497, -79.022], Latitud Máxima Longitud Máxima [1.833, -78.738]

Cobertura Taxonómica

Caracterización de 99 registros biológicos correspondientes a 6 familias de bacterias.

Familia  Bacillaceae,  Yersiniaceae,  Staphylococcaceae,  Enterobacteriaceae,  Pseudomonaceae,  Moraxellaceae

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2018-11-25 / 2018-12-04

Datos del Proyecto

No hay descripción disponible

Título Caracterización de biodiversidad para el fortalecimiento de colecciones científicas y la generación de información genética de la biodiversidad colombiana, en el marco del programa Colombia BIO
Fuentes de Financiación Colombia BIO. Convenio especial de cooperación. Aunar esfuerzos para caracterizar la biodiversidad en áreas de interés científico y con baja información biológica, para el fortalecimiento de las colecciones científicas y la generación de información genética de la biodiversidad Colombiana, en el marco del programa Colombia BIO.

Personas asociadas al proyecto:

Punto de Contacto
Sabrina Monsalve

Métodos de Muestreo

Los aspectos metodológicos incluyen una breve ubicación del área de estudio, la descripción de procedimientos en la fase de campo, los avances en la fase de laboratorio que se llevó a cabo directamente en el buque, la información de posibilidad de implementación de análisis genéticos en las muestras recopiladas y, finalmente, las variaciones que se generaron en los procedimientos en la fase de campo del proyecto con relación a la propuesta metodológica inicial.

Área de Estudio El proyecto se llevó a cabo en el Departamento de Nariño en el sector meridional del Pacífico colombiano, entre la ensenada de Tumaco y la localidad de Candelilla de la Mar en cercanías de la línea limítrofe con el Ecuador.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. El proyecto de la Universidad del Sinú se llevó a cabo con la participación de las comunidades de Candelilla de la Mar, Teherán, Colombia Grande y del Barrio el Morrito, Sector Chapas; estas comunidades participaron activamente en la recolección de muestras biológicas de la Piangua (Anadara sp.), actividad que se desarrolló en sectores donde tradicionalmente llevan a cabo la extracción de este recurso para su consumo y comercialización. En el caso de las comunidades de Candelilla de la Mar y de Teherán, estos sectores se encontraban bastante alejados del poblado, razón por la cual fue necesario el traslado en embarcaciones hacia los respectivos sitios de muestreo.
  2. En cada localidad de muestreo se realizó una recolección de al menos 30 ejemplares de Piangua hembra (Anadara tuberculosa) y 30 de Piangua macho (Anadara similis); las cantidades de individuos en la muestra de cada especie variaron según la disponibilidad de tiempo, personal y del recurso en cada localidad, pero por lo general siempre fueron en cantidad suficiente tanto para los muestreos de microbiología de la Universidad del Sinú, como de hidrocarburos dentro del trabajo conjunto con el CIOH Pacífico. Este muestreo fue insuficiente en el caso de A. similis en la localidad de Colombia Grande, donde se alcanzó el peso requerido de muestra para el análisis microbiológico, pero fueron pocos ejemplares para el estudio morfométrico, y en Tumaco donde no se encontró disponibilidad suficiente de esta especie por lo que no fue incluida.
  3. La recolección se realizó de manera manual con ayuda de “piangüeros” expertos de las comunidades, quienes eran contactados previamente con ayuda del personal del Consejo Comunitario Bajo Mira y Frontera que hicieron parte de la expedición. El transporte se efectuó en embarcaciones de la Infantería de Marina, DIMAR o de los nativos de la región, salvo en el caso de Tumaco donde se accedió al sitio por vía terrestre. La toma de muestras de Piangua se realizó durante la marea baja entre las raíces de árboles de mangle, en áreas dominadas por especies del género Rhizophora (mangle rojo), donde también se tomaron muestras (cinco réplicas) de sedimento por localidad (figura 3); en cada sesión de muestreo se recopilaron muestras de agua (cinco réplicas) en ubicaciones cercanas a aquellas en las cuales se obtuvieron las Pianguas y se registraron los respectivos valores de salinidad, temperatura, oxígeno disuelto (mg./l) y pH por medio de una sonda multiparamétrica marca Thermo Scientific STARA 3260. Las muestras de sedimento se guardaron en bolsas Ziploc medianas y las de agua en tubos Falcon graduados de 100 ml., y se dispusieron directamente en una cava isotérmica con hielo para su transporte al buque. Las muestras de Piangua se trasladaron en vivo para la extracción del tejido vivo en el laboratorio.
  4. La identificación taxonómica y diferenciación de las dos especies de Piangua se realizó siguiendo las pautas brindadas por Fischer et al. (1995). En el laboratorio del buque se procedió al registro de variables morfométricas de la Piangua diferenciando entre las dos especies presentes en la zona. Las medidas registradas comprendieron la longitud de las valvas, su ancho y altura, las cuales se tomaron con ayuda de un vernier metálico con precisión de 0,01 mm. Las medidas de longitud y ancho de las valvas se registraron siguiendo las pautas brindadas por Cano (2011), mientras que la altura se tomó a partir del punto medio del umbo hasta el límite inferior de las valvas, siguiendo la línea de las costillas radiales centrales del umbo.
  5. Posteriormente, se procedió a lavar las conchas de las Pianguas con abundante agua dulce para retirar los restos de sedimento y otras partículas que pudieran contaminar las muestras. Seguidamente, se procedió a abrir las conchas con ayuda de un cuchillo de cocina convencional y a retirar el tejido vivo por medio de un bisturí, el cual fue depositado en bolsas Ziploc debidamente rotuladas. Este procedimiento se realizó utilizando guantes de disección y tapabocas para evitar la contaminación de las muestras.
  6. Una vez extraídas las muestras de tejidos blandos de la Piangua, cada bolsa rotulada por estación de muestreo se guardó en una bolsa Ziploc grande junto con las respectivas muestras de agua y sedimentos, para ser almacenada en un congelador acondicionado en el buque para tal fin. Al finalizar la fase de campo a bordo del buque, se procedió a empacar las muestras congeladas en una cava isotérmica con bloques de gel refrigerante que fueron facilitados a los investigadores por el personal del laboratorio del CIOH Pacífico, para poder realizar el transporte en avión hasta el laboratorio de microbiología de la Universidad del Sinú – Seccional Cartagena.

Referencias Bibliográficas

  1. Cano, J. L. 2011. Caracterización morfométrica de Anadara tuberculosa y A. similis en la costa pacífica colombiana. Trabajo de grado para optar al título de bióloga. Universidad del Valle, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Programa Académico de Biología. Santiago de Cali, Colombia. 99 p.
  2. Fischer, W., F. Krupp, W. Schneider, C. Sommer, K. E. Carpenter and V. H. Niem. 1995. Guía FAO para la identificación de especies para los fines de la pesca. Pacífico centro-oriental. Volumen I: Plantas e invertebrados. 1-646 p.

Metadatos Adicionales

Propósito Caracterizar y cuantificar aislados bacterianos presentes en agua, sedimento y tejidos blandos de la Piangua (Anadara tuberculosa y Anadara similis), siguiendo un gradiente ambiental entre la población de Tumaco hasta la localidad de Candelilla de la Mar, y establecer su potencial como bioindicador, su capacidad de biorremediación o su condición patógena para humanos.
Identificadores Alternativos 10.15472/zyxstw
92b72b47-2793-444d-ac7e-1a092cb7510e
https://ipt.biodiversidad.co/sibm/resource?r=unisinu_bacterias_pacifico_2018