Description
El Museo de Historia Natural Marina de Colombia que hace parte del INVEMAR además de sus colecciones de especímenes y tejidos, cuenta con colecciones vivas, entre las cuales se encuentra la colección de Bacterias creada en el 2006 por la Doctora Martha Liliana Gómez García, quien en ese momento formaba parte del Programa de Investigación de Calidad Ambiental Marina del instituto; la colección fue originada a partir de un proyecto de investigación del cual se seleccionaron 122 cepas con capacidad biodegradadora de compuestos orgánicos persistentes, las cuales fueron aisladas de sedimentos colectados en áreas costeras del Caribe y el Pacífico colombiano, donde se tenía conocimiento de concentraciones significativas de hidrocarburos y plaguicidas organoclorados. Durante varios años la colección se mantuvo relativamente estable en cuanto al número original de cepas, con eventuales adiciones y algunas bajas; sin embargo, a partir del año 2015 que se registró un crecimiento significativo de la colección, debido al inicio de un nuevo ciclo de proyectos que incorporaron entre sus componentes de investigación la caracterización de microorganismos. Actualmente el cepario se encuentra conformado por 569 lotes de cepas marinas y costeras, los cuales se mantienen en condiciones de criopreservación a -80°C con glicerol como agente crioprotectante. El presente conjunto de datos incluye 423 registros biológicos de especímenes catalogados correspondientes a los fila Actinobacteria, Fimicutes y Proteobacteria, así como también contiene aislados bacterianos que se encuentran identificados hasta categoría de reino Bacteria. Del total de registros documentados 399 pertenecen al Caribe y 24 al Pacífico colombiano, y corresponden a muestras colectadas desde las zonas estuarinas hasta el margen continental alrededor de los 4500 m de profundidad.
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 423 records.
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How to cite
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Montoya-Cadavid E (2018): Colección de Bacterias del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar). v2.0. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras – INVEMAR. Dataset/Occurrence. http://doi.org/10.15472/nbpwtj
Rights
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The publisher and rights holder of this work is Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: f149579d-5d5a-4555-8076-8193b55e7622. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
Bacteria;Actinobacteria;Firmicutes;Proteobacteria;Caribe colombiano;Pacífico colombiano;Museo de Historia Natural Marina de Colombia;MHNMC; Occurrence; Specimen
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Geographic Coverage
El conjunto incluye 399 registros provenientes del Caribe colombiano entre 12°4'51,30" latitud norte (N) - 5°37'46,60" longitud oeste (W) y 10°48'41,879" latitud Norte (N) - 74° 36' 24,955" longitud oeste (W), abarcando localidades del Caribe oceánico y el departamento del Magdalena, con profundidades entre los 30 cm y los 3328 m. Así mismo contiene 24 registros que referencian información obtenida en jurisdicción del departamento de Cauca en el Pacífico colombiano, entre los 02°56'58,6" latitud norte (N), 78°10'47,3" longitud oeste (W). Los datos comprenden bacterias obtenidas desde el área costera estuarina hasta profundidades de 4500 m en el margen continental.
| Bounding Coordinates | South West [-2.95, -78.18], North East [12.08, -75.63] |
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Taxonomic Coverage
En la presente base de datos se encuentran representados 26 especies pertenecientes a 24 géneros, 15 familias, 10 ordenes y 4 clases de los fila Actinobacteria, Firmicutes y Proteobacteria.
| Phylum | Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria |
|---|---|
| Class | Actinobacteria, Bacili, Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria |
| Order | Streptomycetales, Micrococcales, Actinomycetales, Bacillales, Rhodobacterales, Alteromonadales, Oceanospirillales, Pseudomonadales, Vibrionales, Xanthomonadales |
| Family | Streptomycetaceae, Micrococcaceae, Micromonosporaceae, Bacillaceae, Staphylococcaceae, Rhodobacteraceae, Alteromonadaceae, Idiomarinaceae, Pseudoalteromonadaceae, Halomonadaceae, Moraxellaceae, Pseudomonadaceae, Vibrionaceae, Xanthomonadaceae |
| Genus | Streptomyces, Micrococcus, Kocuria, Micromonospora, Bacillus, Exiguobacterium, Fictibacillus, Halobacillus, Oceanobacillus, Staphylococcus, Virgibacillus, Exiguobacterium, Staphylococcus, Ruegeria, Labrenzia, Alteromonas, Marinobacter, Idiomarina, Pseudoalteromonas, Chromohalobacter, Halomonas, Psychrobacter, Pseudomonas, vibrio, Stenotrophomonas |
Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2015-04-07 / 2017-10-07 |
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Project Data
El Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa del Invemar tiene como misión incrementar el conocimiento sobre la biodiversidad marina y costera del país, mediante la investigación, la catalogación, curaduría,sistematización y publicación de los datos asociados a las colecciones que custodia, las cuales son patrimonio de la nación.
| Title | Museo de Historia Natural Marino de Colombia - Makuriwa (Invemar) |
|---|---|
| Funding | Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - INVEMAR |
The personnel involved in the project:
Collection Data
| Collection Name | Colección de bacterias del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar) |
|---|---|
| Collection Identifier | INV ACT; INV BAC; INV FIR; INV PRT |
| Parent Collection Identifier | MHNMC INV |
| Specimen preservation methods | Other |
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| Curatorial Units | Between 423 and 423 Lotes de cepas , Between 423 and 423 Registros biológicos |
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Additional Metadata
| Alternative Identifiers | doi:10.15472/nbpwtj |
|---|---|
| http://ipt.biodiversidad.co/sibm/resource?r=colbacteriasmhnmc |