Colección de Bacterias del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar)

Registro biológico Espécimen
Última versión publicado por Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar el jun 22, 2018 Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar
Fecha de publicación:
22 de junio de 2018
Licencia:
CC-BY-NC 4.0

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Descripción

El Museo de Historia Natural Marina de Colombia que hace parte del INVEMAR además de sus colecciones de especímenes y tejidos, cuenta con colecciones vivas, entre las cuales se encuentra la colección de Bacterias creada en el 2006 por la Doctora Martha Liliana Gómez García, quien en ese momento formaba parte del Programa de Investigación de Calidad Ambiental Marina del instituto; la colección fue originada a partir de un proyecto de investigación del cual se seleccionaron 122 cepas con capacidad biodegradadora de compuestos orgánicos persistentes, las cuales fueron aisladas de sedimentos colectados en áreas costeras del Caribe y el Pacífico colombiano, donde se tenía conocimiento de concentraciones significativas de hidrocarburos y plaguicidas organoclorados. Durante varios años la colección se mantuvo relativamente estable en cuanto al número original de cepas, con eventuales adiciones y algunas bajas; sin embargo, a partir del año 2015 que se registró un crecimiento significativo de la colección, debido al inicio de un nuevo ciclo de proyectos que incorporaron entre sus componentes de investigación la caracterización de microorganismos. Actualmente el cepario se encuentra conformado por 569 lotes de cepas marinas y costeras, los cuales se mantienen en condiciones de criopreservación a -80°C con glicerol como agente crioprotectante. El presente conjunto de datos incluye 423 registros biológicos de especímenes catalogados correspondientes a los fila Actinobacteria, Fimicutes y Proteobacteria, así como también contiene aislados bacterianos que se encuentran identificados hasta categoría de reino Bacteria. Del total de registros documentados 399 pertenecen al Caribe y 24 al Pacífico colombiano, y corresponden a muestras colectadas desde las zonas estuarinas hasta el margen continental alrededor de los 4500 m de profundidad.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 423 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

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¿Cómo referenciar?

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Montoya-Cadavid E (2018): Colección de Bacterias del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar). v2.0. Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras – INVEMAR. Dataset/Occurrence. http://doi.org/10.15472/nbpwtj

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento-NoComercial (CC-BY-NC 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: f149579d-5d5a-4555-8076-8193b55e7622.  Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras clave

Bacteria;Actinobacteria;Firmicutes;Proteobacteria;Caribe colombiano;Pacífico colombiano;Museo de Historia Natural Marina de Colombia;MHNMC; Occurrence; Specimen

Contactos

Erika Montoya-Cadavid
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Investigadora científica
INVEMAR
  • Calle 25 # 2-55, INVEMAR, Playa Salguero - Rodadero
Santa Marta
Magdalena
CO
Erika Montoya C.
  • Usuario

Cobertura geográfica

El conjunto incluye 399 registros provenientes del Caribe colombiano entre 12°4'51,30" latitud norte (N) - 5°37'46,60" longitud oeste (W) y 10°48'41,879" latitud Norte (N) - 74° 36' 24,955" longitud oeste (W), abarcando localidades del Caribe oceánico y el departamento del Magdalena, con profundidades entre los 30 cm y los 3328 m. Así mismo contiene 24 registros que referencian información obtenida en jurisdicción del departamento de Cauca en el Pacífico colombiano, entre los 02°56'58,6" latitud norte (N), 78°10'47,3" longitud oeste (W). Los datos comprenden bacterias obtenidas desde el área costera estuarina hasta profundidades de 4500 m en el margen continental.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-2,95, -78,18], Latitud Máxima Longitud Máxima [12,08, -75,63]

Cobertura taxonómica

En la presente base de datos se encuentran representados 26 especies pertenecientes a 24 géneros, 15 familias, 10 ordenes y 4 clases de los fila Actinobacteria, Firmicutes y Proteobacteria.

Filo Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria
Class Actinobacteria, Bacili, Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria
Orden Streptomycetales, Micrococcales, Actinomycetales, Bacillales, Rhodobacterales, Alteromonadales, Oceanospirillales, Pseudomonadales, Vibrionales, Xanthomonadales
Familia Streptomycetaceae, Micrococcaceae, Micromonosporaceae, Bacillaceae, Staphylococcaceae, Rhodobacteraceae, Alteromonadaceae, Idiomarinaceae, Pseudoalteromonadaceae, Halomonadaceae, Moraxellaceae, Pseudomonadaceae, Vibrionaceae, Xanthomonadaceae
Género Streptomyces, Micrococcus, Kocuria, Micromonospora, Bacillus, Exiguobacterium, Fictibacillus, Halobacillus, Oceanobacillus, Staphylococcus, Virgibacillus, Exiguobacterium, Staphylococcus, Ruegeria, Labrenzia, Alteromonas, Marinobacter, Idiomarina, Pseudoalteromonas, Chromohalobacter, Halomonas, Psychrobacter, Pseudomonas, vibrio, Stenotrophomonas

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2015-04-07 / 2017-10-07

Datos del proyecto

El Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa del Invemar tiene como misión incrementar el conocimiento sobre la biodiversidad marina y costera del país, mediante la investigación, la catalogación, curaduría,sistematización y publicación de los datos asociados a las colecciones que custodia, las cuales son patrimonio de la nación.

Título Museo de Historia Natural Marino de Colombia - Makuriwa (Invemar)
Fuentes de Financiación Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - INVEMAR

Personas asociadas al proyecto:

Julio Bohorquez Naranjo
  • Custodio De Los Datos
Erika Montoya-Cadavid
  • Curador
Marynés Quintero De La Hoz
  • Proveedor De Contenido
Marisol Santos Acevedo
  • Proveedor De Contenido
Catalina Arteaga Flórez
  • Curador

Datos de la colección

Nombre de la Colección Colección de bacterias del Museo de Historia Natural Marina de Colombia – Makuriwa (Invemar)
Identificador de la Colección INV ACT; INV BAC; INV FIR; INV PRT
Identificador de la Colección Parental MHNMC INV
Métodos de preservación de los ejemplares Otro
Unidades curatoriales Entre 423 y 423 Lotes de cepas ,  Entre 423 y 423 Registros biológicos

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos doi:10.15472/nbpwtj
http://ipt.biodiversidad.co/sibm/resource?r=colbacteriasmhnmc