Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)

Jorge Luis Fuentes Lorenzo1, Jhon Alexander Suescun Sepulveda1, Jorge Luis Fuentes1

1 Universidad Industrial de Santander, Cra 27, Calle 9na, Bucaramanga, Colombia

Corresponding author(s): Jorge Luis Fuentes Lorenzo (jfuentes@uis.edu.co)Jhon Alexander Suescun Sepulveda (jhonsuescun94@gmail.com)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Fuentes Lorenzo J L, Suescun Sepulveda J A (2021): Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA). v1.2. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/5nv2wo https://doi.org/10.15472/5nv2wo

Abstract

La colección de microorganismos del proyecto Santander Bio, tiene su origen de la actividad de recolección de diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.

Keywords: Occurrence, Microorganisms, Taxonomy, Geomicrobiology, Observation

General description

Purpose: Soportar la actividad académica en el área de Microbiología y potenciar la investigación de los programas de pregrado y posgrado de la Escuela de Biología en el área de Microbiología con énfasis en Taxonomía Microbiana, Geo-Microbiología, Microbiología Ambiental, Industrial y Biomédicas.

Project details

Project title: Santander Bio
Personnel: Jorge Luis Fuentes Lorenzo
Funding: Financiación externa 8864: Gobernación de Santander
Study area descriptions/descriptor: Departamento de Santander, Colombia

Data published through GBIF: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma_santanderbio

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: En total, el 43.5 % de los especímenes de la colección Santander Bio se encuentran identificados a nivel de género y el 56.57 % de los especímenes a nivel de reino.
Taxonomic ranks
Phylum: Actinobacteria, Firmicutes, Proteobacteria, Ascomycota, Basidiomycota, Bacteroidetes

Spatial coverage

General spatial coverage: Los aislados microbianos fueron obtenidos de obtenidos de diferentes cuerpos de agua dulce y sustratos asociados del Departamento de Santander.
Coordinates: 5°42'25.2''N and 8°8'42''N Latitude; 74°31'33.6''W and 72°28'22.8''W Longitude 

Temporal coverage: 2018 - 2019

Natural collections description

Parent collection identifier: UIS
Collection name: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS
Collection identifier: Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Specimen preservation method: Deep frozen
Specimen preservation method: Dried
Curatorial unit: Between 1 and 3 (Crioviales)

Methods

Method step description: 
- . 	Toma de muestras asépticamente, empleando material estéril para la toma de muestra, variando entre los instrumentos
- . 	Enriquecimiento de la muestra empleando distintos tipos de cultivo enriquecido en los que se incluyen: medio mínimo de sales, medio mínimo de sales con distintos suplementos (extracto de levadura, glucosa, glicerol, manitol), medio reforzado para clostridiales, BG11, caldo nutritivo, DSMZ, entre otros. El crecimiento en medio enriquecido se realiza por un periodo máximo de un mes, a la temperatura del sitio de aislamiento o a 37 °C.
- . 	Aislamiento de microorganismos empleando diluciones seriadas y siembra por extensión empleando asas de Drigalsky sobre medio sólido, de la misma composición del medio enriquecido, con el fin de obtener colonias aisladas con diferentes características tíntoriales y culturales.
- . 	Conservación a través de criopreservación empleando zeolita y glicerol al 30 % para bacterias y levaduras. Para los hongos filamentosos se realiza crecimiento sobre papel filtro hasta su esporulación, posterior a ello se deseca el papel filtro con el hongo y se criopreserva.
- . 	Identificación de los aislados secuenciando el gen 16S rRNA para las bacterias y el 18S rRNA para los hongos filamentosos y levaduriformes.
Study extent description: El área de muestreo es el departamento de Santander, Colombia e incluye diversas muestras (agua, sedimentos, biopelículas de estratos asociados) obtenidas en diferentes cuerpos de agua dulce, cavernas y termiteros del Departamento de Santander (Colombia).
Sampling description: El muestreo es realizado de forma aséptica, tomando una alícuota del hábitat a estudiar (lodo, agua, biofilm, termiteros), junto con sus variables fisicoquímicas (pH, temperatura, entre otras).
Quality control description: El procesamiento de la muestras se debe realizar antes de las 72 horas, manteniendo la muestra en refrigeración.

Ajuste de vocabularios controlados en:
Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos;
Elemento temporal: eventDate.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Santander Bio: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/archive.do?r=uis_cepario_lmma_santanderbio
Publication date of data: 2021-07-15
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (LMMA)
Character encoding: UTF-8
Format name: DWC-A
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_cepario_lmma

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2019-07-22
Hierarchy level: Dataset