Caracterización de la población de bacteriófagos asociados a los principales phyla bacterianos, residentes en la superficie epidérmica de Bolitoglossa nicefori (Caudata: Plethodontidae) de la Cordillera Oriental de Colombia

Carlos Andrés Hernández Jaimes1, Oscar Yesid Hernández Lagos1, Jorge Hernández Torres2, Jorge Hernández Torres3

1 Grupo de Investigación en Biotecnología Industrial y Biología Molecular, Km 2 vía Refugio, Parque Tecnológico Guatiguará, Piedecuesta, Colombia; 2 Escuela de Biología, Universidad Industrial de Santander, Carrera 27 Calle 9, Bucaramanga, Colombia; 3 Escuela de Biología, Universidad Industrial de Santander, Cra 27, Calle 9, Bucaramanga, Colombia

Corresponding author(s): Carlos Andrés Hernández Jaimes (c.andreshj@gmail.com)Oscar Yesid Hernández Lagos (megoskr@gmail.com)Jorge Hernández Torres (hernanj@correo.uis.edu.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Hernández Jaimes C A, Hernández Lagos O Y, Hernández Torres J (2019): Caracterización de la población de bacteriófagos asociados a los principales phyla bacterianos, residentes en la superficie epidérmica de Bolitoglossa nicefori (Caudata: Plethodontidae) de la Cordillera Oriental de Colombia. v1.1. Universidad Industrial de Santander. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/1ngb3e https://doi.org/10.15472/1ngb3e

Abstract

El presente recurso corresponde a los registros biológicos derivados del proyecto de investigación UIS No. 5763 titulado: "Caracterización de la población de bacteriófagos asociados a los principales phyla bacterianos, residentes en la superficie epidérmica de Bolitoglossa nicefori (Caudata: Plethodontidae) de la Cordillera Oriental de Colombia." El material colectado está amparado bajo la licencia IDB0398 - Resolución N° 0047 del 22 de enero de 2015, Resolución N° 0260 del 11 de marzo de 2016 y Resolución N° 01362 del 21 de agosto de 2018.

Keywords: Microbiota epidérmica, bacterias, microorganismos., Occurrence, Observation, PERMISO_COLECTA

Project details

Project title: Caracterización de la población de bacteriófagos asociados a los principales phyla bacterianos, residentes en la superficie epidérmica de Bolitoglossa nicefori (Caudata: Plethodontidae) de la Cordillera Oriental de Colombia.
Personnel: Jorge Hernández Torres, Carlos Andrés Hernández Jaimes, Oscar Yesid Hernández Lagos
Funding: Vicerrectoría de Investigación, Universidad Industrial de Santander (Proyecto 2318).
Study area descriptions/descriptor: Municipio de Tona, Departamento de Santander, Colombia.

Data published through GBIF: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=uis_bacterias_5763

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Todos los registros fueron identificados a nivel de género y algunos a nivel de especie.
Taxonomic ranks
Genus: Bacillus, Citrobacter, Serratia, Pseudomonas, Arthrobacter, Acinetobacter, Microbacterium, Exiguobacterium, Klebsiella, Achromobacter, Stenotrophomonas
Species: Chryseobacterium indologenes, Pseudomonas tolaasii, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas panacis, Pseudomonas putida

Spatial coverage

General spatial coverage: Municipio de Tona, Departamento de Santander, Colombia.
Coordinates: 7°6'22.84''N and 7°31'23.34''N Latitude; 73°6'40.56''W and 72°41'37.63''W Longitude 

Temporal coverage: March 1, 2017 - December 15, 2017

Natural collections description

Parent collection identifier: Cepario-LMMA-UIS
Collection name: Cepario del Laboratorio de Microbiología y Mutagénesis Ambiental de la UIS (Cepario-LMMA-UIS)
Collection identifier: Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 241
Specimen preservation method: Deep frozen

Methods

Method step description: 
- . 	Se realizaron muestreos en campo en busca de especímenes de B. nicefori en una localidad ubicada en el flanco occidental de la cordillera oriental en el municipio de Tona, Santander. Las jornadas de trabajo consistieron de recorridos nocturnos, procurando abarcar todos los microhabitats disponibles: hojarasca, troncos en descomposición, vegetación arbustiva, lechos de quebradas, entre otros.
- . 	Se tomaron fotografías y se georreferenciaron todos los ejemplares observados. Adicionalmente, en una bitácora se anotó la fecha, hora, altitud y numero de ejemplares observados, y se tomó registro de algunas variables ambientales como temperatura del sustrato, humedad relativa y temperatura ambiental.
- . 	Para la caracterización de la microbiota epidérmica se tomaron tres individuos elegidos al azar y se realizaron dos frotis por toda la superficie de la piel de cada individuo empleando hisopos estériles, uno de ellos sumergido inmediatamente en aproximadamente 5 ml de medio liquido de agar de soya tríptico y el otro en medio salino.
- . 	Posteriormente las muestras fueron transportadas al laboratorio en una cava con hielo, en el menor tiempo posible. Se Preservaron las cepas en medio de cultivo con 20% glicerol y se procedió a congelar las muestras en nitrógeno líquido y luego se almacenaron a -80 C.
Study extent description: Municipio de Tona, Departamento de Santander, Colombia.
Sampling description: Toma de muestras de bacterias mediante frotes epidérmicos de la piel de Bolitoglossa nicefori, empleando hisopos estériles.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Caracterización de la población de bacteriófagos asociados a los principales phyla bacterianos, residentes en la superficie epidérmica de Bolitoglossa nicefori (Caudata: Plethodontidae) de la Cordillera Oriental de Colombia
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/archive.do?r=uis_bacterias_5763
Publication date of data: 2019-11-14
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: 0047_bacteriofagos_20191114
Character encoding: UTF-8
Format name: csv
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=0047_bacteriofagos_20191114

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2019-11-13
Hierarchy level: Dataset