Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia

Lina Andrea Gutierrez Builes1, Juan Aicardo Segura Caro1

1 Universidad Pontificia Bolivariana, Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones, 050034, Medellin, Colombia

Corresponding author(s): Lina Andrea Gutierrez Builes (lina.gutierrezb@upb.edu.co)Juan Aicardo Segura Caro (juan.segurac@upb.edu.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia. v2.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/hen46i https://doi.org/10.15472/hen46i

Abstract

Este conjunto de datos corresponden a especímenes de garrapatas recolectadas en escenarios ganaderos del Magdalena Medio de Antioquia en el marco del componente entomologico asociado con el proyecto financiado por COLCIENCIAS Contrato 653-2013: "Prevalencia de enfermedades emergentes zoonóticas asociadas con síndrome febril: anaplasmosis, borreliosis, ehrlichiosis, rickettsiosis y coxiellosis en zonas ganaderas de Antioquia" 

Keywords: Ticks, Tick-Borne Diseases, cattle, zoonoses, Occurrence, Observation, PERMISO_COLECTA

General description

Purpose: Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana.
Additional information: Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.

Project details

Project title: Prevalencia de enfermedades emergentes zoonóticas asociadas con síndrome febril: anaplasmosis, borreliosis, ehrlichiosis, rickettsiosis y coxiellosis en zonas ganaderas de Antioquia
Personnel: Lina Andrea Gutierrez Builes, Juan Aicardo Segura Caro
Funding: Proyecto financiado por COLCIENCIAS: Código 121056934576 y contrato Nº 653- 2013. Investigación ejecutada por la Universidad Pontificia Bolivariana y coejecutada por la Universidad de Antioquia y COLANTA. Con el apoyo logístico de COREGAN, APAGRONAR, COOLETRIUNFO y del Consejo técnico departamental de zoonosis de la Dirección de factores de riesgo de la Secretaría Seccional de Salud y Protección Social de Antioquia.
Study area descriptions/descriptor: Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia.
Design description: En el componente entomológico de esta investigación se realizaron muestreos de garrapatas tanto en bovinos como en potreros en pastoreo activo. Los especímenes recolectados fueron identificados usando claves taxonómicas dicotomicas y ademas se realizó un análisis molecular complementario para confirmar dicha identificación hasta el nivel de género o especie, cuando fue posible. Para los aspectos de identificación molecular de las especies de garrapatas y la detección molecular de las bacterias de los géneros en estudio, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de especímenes de garrapatas individuales o en pooles. Posteriormente a cada procedimiento de extracción se cuantificó la concentración de ADN genómico obtenido usando el equipo Nanodrop® 2000c (Thermo Fisher Scientific, Waltham, USA) y se almacenó a -20ºC hasta el análisis molecular.

Data published through GBIF: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=prevalencia_zoonosis_radicado_cidi-upb_211b-02-14-65

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Los especímenes de garrapatas adultas recolectados en este proyecto (en bovinos) correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus, mientras que en el estado de nifas colectadas en potreros en pastoreo activo se identificaron a las especies Rhipicephalus microplus y Dermacentor nitens y en el estado de larvas también se identifico a la especie Amblyomma patinoi. 
Taxonomic ranks
Species: Rhipicephalus microplus, Dermacentor nitens, Amblyomma patinoi

Spatial coverage

General spatial coverage: Zonas de muestreo en el Magdalena Medio de Antioquia, Colombia
Coordinates: 5°47'49.2''N and 6°38'42''N Latitude; 74°47'24''W and 74°27'21.6''W Longitude 

Temporal coverage: August 3, 2015 - October 8, 2015

Natural collections description

Parent collection identifier: IAvH
Collection name: Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I)
Collection identifier: Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003
Specimen preservation method: Alcohol
Curatorial unit: Between 2951 and 2953 (Espécimen completo)

Methods

Method step description: La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte de la identificación de especies encontradas y de los indices de infestación detectados en la zonas de estudio y un segundo articulo contendrá la información asociada con la infección natural detectada para los géneros Anaplasma, Rickettsia, Babesia y Coxiella en las garrapatas colectadas en el Magdalena medio de Antioquia. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral.
Study extent description: 24 fincas ganaderas ubicadas en la región del Norte (municipios de Belmira, San Pdero de los Milagros y Entrerrios) y 24 ubicadas en la región del Magdalena medio (Puerto Berrio, Puerto triunfo y Puerto Nare) de Antioquia.
Sampling description: -Para el caso de las garrapatas recolectadas en los bovinos estas fueron obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola  y fueron almacenadas en etanol al 70% a temperatura ambiente y posteriormente se realizó la extracción del ADN genomico.

-Muestreo de formas no parasíticas de las garrapatas en los potreros en pastoreo activo: con el fin de recolectar formas no parasíticas de las garrapatas que pudieran estar presentes en praderas, en la zona norte la metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2 la cual se arrastró de manera horizontal en el potrero seleccionado para el análisis, se siguió un patrón de recorrido aleatorio hasta cubrir un área con una superficie de 1 m x 70 m, con la ejecución de cuatro recorridos lineales dirigidos en forma de cruz, uno de ida y otro de regreso, por trayecto, en un tiempo de 7 minutos por recorrido, para un total de 28 minutos. En la zona del Magdalena Medio antioqueño, el muestreo se realizó en dos potreros de cada finca que se encontraban en pastoreo activo. La metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2, para realizar el arrastre o Dragging en ocho transectos lineales de 90 metros, formando una malla para un recorrido total de 720 metros por potrero, inspeccionando la franela de forma frecuente, las garrapatas fueron retiradas con cepillo quitapelusa y depositadas en bolsas sellables con silica gel.
Quality control description: En las pruebas moleculares se utilizaron controles de ADN de identificación reconocida con el fin de realizar procesos de validación interna de cada prueba molecular usada. Ademas se efectuaron pruebas para verificar la posible interferencia de inhibidores de la amplificación que pudieran estar presentes en las muestras de ADN genomico extraídas a partir de los especímenes de garrapatas.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/archive.do?r=prevalencia_zoonosis_radicado_cidi-upb_211b-02-14-65
Publication date of data: 2020-02-20
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia
Character encoding: UTF-8
Format name: DWC-A
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_zoonosis_20200220

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2019-03-06
Hierarchy level: Dataset