Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV)

John Alexander Salazar Hernandez1, Germán Bolívar2, Erika Montoya-Cadavid3, Edgardo Londoño-Cruz1, Andres Felipe Carmona Guerra4, María Fernanda Cardona-Gutiérrez1

1 Universidad del Valle, Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez), 76001, Santiago de Cali, Colombia; 2 Universidad del Valle, Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 2824, Sección Biología Marina (Sede Meléndez), 76001, Santiago de Cali, Colombia; 3 Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives de Andreis” INVEMAR, Calle 25 No. 2-55, Playa Salguero, Santa Marta D.T.C.H., 470006, Santa Marta, Colombia; 4 Universidad del Valle, Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez), 76001, Santiago de Cali, Colombia

Corresponding author(s): John Alexander Salazar Hernandez (salazar.john@correounivalle.edu.co)Germán Bolívar (german.bolivar@correounivalle.edu.co)Erika Montoya-Cadavid (erika.montoya@invemar.org.co)Edgardo Londoño-Cruz (edgardo.londono@correounivalle.edu.co)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Salazar Hernandez J A, Bolívar G, Montoya-Cadavid E, Londoño-Cruz E (2023): Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV). v6.3. Universidad del Valle. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/f2kcwu https://doi.org/10.15472/f2kcwu

Abstract

Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Posee 284 registros de poliquetos, correspondientes a 43 especies, las cuales se encuentran repartidas en 6 ordenes (Amphinomida, Eunicida, Phyllodocida, Sabellida, Spionida y Terebellida). Los registros provienen en su totalidad, de la región del Pacífico colombiano. Estos registros datan desde el año 1989 hasta el año 2019, en donde el Biólogo Germán Bolívar fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar esta colección. Esta colección de referencia se estableció formalmente ante el instituto Alexander Von Humboldt en el año 2002.

Keywords: Occurrence, Specimen, Annelida, Polychaeta, Poliquetos, Gusanos marinos, Pacífico colombiano, Universidad del Valle

Project details

Project title: Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV)
Personnel: Edgardo Londoño, Erika Montoya-Cadavid, John Salazar Hernandez
Funding: La Colección de Referencia de Biología Marina hace parte de la Vicerrectoría de Investigación de la Universidad del Valle, dependencia que provee los recursos de funcionamiento básicos, complementados con los recursos generados por proyectos a cargo de los docentes encargados de cada colección. 

En el año 2013, mediante el Convenio de Cooperación No. 13-13-014-242 entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad del Valle, se realizó la estandarización y georreferenciación de las localidades asociadas a los registros disponibles hasta ese momento, y se publicaron en el entonces funcional IPT-Valle del Cauca. 

Recursos adicionales para la documentación, digitalización y publicación de los datos de la colección fueron provistos entre el 2021-07-01 y 2023-06-30 por el Proyecto BID-CA2020-055-NAC "Increasing the accessibility of marine information from Colombians Natural History Collections by mobilizing data, strengthening infrastructure, and training" financiado por la unión Europea a través del Programa BID Caribe (Biodiversity Information for Development Programme) y GBIF (The Global Biodiversity Information Facility). El proyecto fue realizado bajo la coordinación del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras "José Benito Vives de Andréis" - INVEMAR en conjunto con la Universidad del Magdalena; Universidad de Antioquia; Universidad del Valle; Universidad Tecnológica del Chocó; Universidad el Bosque; la Red Nacional de Museos de Ciencia, Historia Natural y Colecciones Biológicas; el SiB Colombia; SiBM-OBIS Colombia y GBIF.

Los poliquetos de la colección y sus datos asociados fueron fortalecidos y actualizados durante el desarrollo de dicho proyecto, siendo el actual recurso uno de los productos asociado al entregable "Invertebrados de las colecciones marinas de la Universidad del Valle"
Study area descriptions/descriptor: Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca y Nariño, entre 0 y 35 m de profundidad.
Design description: Desarrollo de actividades curatoriales y control de calidad de información siguiendo cuatro criterios de trabajo:
1. Criterios curatoriales: verificación física de lotes (existencia, preservación, etiquetas); verificación de datos de los registros biológicos asociados (concordancia de datos de etiqueta e información disponible, complementación de datos). 
2. Criterios taxonómicos: validación de nombres científicos hasta el nivel más bajo de identificación del lote. Corroboración del taxón con especialista. Validación de autoridad taxonómica con base en WoRMS - World Register of Marine Species (https://www.marinespecies.org/). 
3. Criterio espacial: Validación de la georrefenciación del punto de recolecta del espécimen representado en coordenadas decimales; especificación de la profundidad de obtención en metros; y validación de correspondencia de la localidad indicada. Herramientas: Conversor de coordenadas Canadensys (https://data.canadensys.net/tools/coordinates); Google Earth Pro 2022, versión 7.3.6.9345; Marine Regions Gazetteer 2022 (https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search); Geovisor ANH - Agencia Nacional de hidrocarburos v.3.1 (https://geovisor.anh.gov.co/tierras/).
4. Criterios de documentación: estandarización de datos acorde a Darwin Core considerando el uso de vocabularios controlados y la documentación de los Términos de obligatorio diligenciamiento acorde a los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros (Nodo OBiS Colombia y SiB Colombia), y los requeridos de forma general por los sistemas globales de OBiS y GBIF.

Data published through GBIF: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=poliquetos_univalle

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Los 284 registros de cnidarios de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 1 clase, 6 órdenes, 33 familias, 46 géneros, 1 subgénero, 43 especies y 1 subespecie.
Taxonomic ranks
Class: Polychaeta
Order: Amphinomida, Eunicida, Phyllodocida, Sabellida, Spionida, Terebellida
Family: Sabellariidae, Polynoidae, Cirratulidae, Lumbrineridae, Glyceridae, Orbiniidae, Magelonidae, Nephtyidae, Syllidae, Ampharetidae, Serpulidae, Spionidae, Trichobranchidae, Sabellidae, Opheliidae, Maldanidae, Sternaspidae, Capitellidae, Terebellidae, Oweniidae, Pectinariidae, Flabelligeridae, Phyllodocidae, Dorvilleidae, Amphinomidae, Hesionidae, Chaetopteridae, Melinnidae, Chrysopetalidae, Nereididae, Euphrosinidae, Eunicidae, Iphionidae
Common names: Gusanos marinos, Gusanos bamboo, Gusanos espagueti, Gusanos de fuego

Spatial coverage

General spatial coverage: Este conjunto de datos posee información de los poliquetos del Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca y Nariño. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta los 35 metros (mas profundo).
Coordinates: 1°26'60''N and 7°11'16.8''N Latitude; 80°4'4.8''W and 76°55'33.6''W Longitude 

Temporal coverage: October 10, 1989 - September 11, 2019

Natural collections description

Collection name: CRBMUV
Collection identifier: https://www.gbif.org/es/grscicoll/collection/1e59e004-e383-477b-9fb3-2d8630ed25cc
Specimen preservation method: Alcohol
Curatorial unit: Between 1 and 284 (Lotes)
Curatorial unit: Between 1 and 284 (Registros Biologicos)

Methods

Method step description: 
- . 	Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
- . 	Asignación de nuevos números de catálogo a cada nuevo registro
- . 	Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0 considerando las recomendaciones para datos marinos del SiBM y OBiS Colombia.
- . 	Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
- . 	Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros
- . 	Curaduría física: Para los nuevos registros, se realizó la identificación de los organismos hasta el nivel taxonómico más bajo posible (tarea realizada por el tesista John Alexander Salazar Hernández y la bióloga María Fernanda Cardona-Gutiérrez). Posteriormente, se realizaron etiquetas físicas nuevas con su respectivo número de catálogo (siguiendo el estándar de la Universidad del Valle), incluyendo la información correspondiente de cada nuevo lote. Finalmente, se ubicaron los lotes dentro de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV), organizándolos taxonómicamente por familia.
- . 	Curaduría física: Para los registros antiguos, se corroboró el estado del alcohol, del recipiente y de las etiquetas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos se encontraran deteriorados o que no estuvieran presentes en el contenedor, se daban de baja o se reportaban como extraviados respectivamente en la base de datos (CRBMUV).
Study extent description: Pacífico colombiano
Sampling description: Los especímenes de poliquetos son colectados manualmente usando tamiz. Luego se les realiza un tratamiento con agua dulce para relajar a los organismos (en caso de ser necesario), donde posteriormente son fijados en alcohol al 70% y son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% y de etiquetas a los lotes que lo requirieron y se les asignó un número de catálogo único a cada uno de los 106 nuevos registros que se ingresaron a la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV).
Quality control description: Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMUV)
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/archive.do?r=poliquetos_univalle
Publication date of data: 2023-08-26
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2023-05-23
Hierarchy level: Dataset

References
Cantera, J. & Londoño-Cruz, E. (Eds.). 2011. Colombia Pacífico: Una visión sobre su biodiversidad marina. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 420 p. ISBN: 978-958-670-954-5
Fauchald, K. 1977. The Polychaete worms: Definitions and keys to the orders, families and genera. Natural History Museum of Los Angeles County and The Allan Hancock Foundation University of Southern California. Science Series 28. 188 p.
Universidad del Valle (2014 -). Poliquetos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle, 208 registros, aportados por Lizcano-Sandoval, L.D. (Creador del recurso), Bolívar, G. (Curador de la colección, Contacto del recurso) & Carmona, A. (Proveedor de los metadatos, Contacto del recurso), En línea, http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=poliquetos_univalle, versión 1 (actualizado el 13/04/2021).
De León González, Jesús Angel y Bastida Zavala, José Rolando y Carrera Parra, Luis Fernando y García Garza, María Elena y Sergio Ignacio, Salazar Vallejo y Solís Weiss, Vivianne y Tovar Hernández, María Ana (2021) Anélidos marinos de México y América tropical. Universidad Autónoma de Nuevo León, Monterrey, Nuevo León, pp. 1-1054. ISBN: 9786072715585
WoRMS (2023). Polychaeta. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=883 on 2023-04-12
Cantera, J. (ed). 2011. Estadíos de vida vulnerable de organismos marinos de Bahía Málaga: Guía para su identificación. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 144 p.