Estudio de la estructura genética espacial de la palma Elaeis oleifera

Elzbieta Bochno Hernández1, Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite CENIPALMA2, Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite CENIPALMA2

1 Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite, Calle 98 no. 70-91 piso 14, Bogotá, Colombia; 2 Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite, Calle 98 no. 70-91 piso 14, Bogotá, Colombia

Corresponding author(s): Elzbieta Bochno Hernández, Elzbieta Bochno Hernández (direcciongeneral@cenipalma.org), Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite CENIPALMA (direcciongeneral@cenipalma.org)

Received {date}; Revised {date}; Accepted {date}; Published {date}

Citation: Combination of authors, year of data paper publication (in parentheses), Title, Journal Name, Volume, Issue number (in parentheses), and doi of the data paper.

Resource Citation

Bochno Hernández E (2021): Estudio de la estructura genética espacial de la palma Elaeis oleifera. v2.7. Corporación Centro de Investigación en Palma de Aceite - CENIPALMA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/uibdzw https://doi.org/10.15472/uibdzw

Abstract

Las muestras colectadas corresponden a palmas de la especie E. oleifera encontradas en distintos municipios de los departamentos de Antioquia, Boyacá, Caldas, Cesar, Chocó, Córdoba, Cundinamarca, Guajira, Magdalena, Santander y Sucre. 

En cada sitio se colectaron racimos y folíolos de máximo 10 palmas. Sin embargo, la colecta de racimos por palma se hizo solo sí había disponibilidad de estos. Los frutos de los racimos son usados para hacer perfiles de ácidos grasos y para la germinación de semillas con el fin de tener plantas conservadas ex situ. Por otra parte, se tomaron 6 folíolos del tercio medio de la hoja número uno de cada una de las palmas identificada por sitio, con el fin de realizar una posterior extracción del ADN.

Keywords: Elaeis oleifera, biogeografía, diversidad genética, Occurrence, Observation, PERMISO_COLECTA

General description

Purpose: Objetivo general
Estudiar la estructura genética espacial de Elaeis oleifera en las zonas de distribución natural de las regiones Caribe y Andina de  
Colombia con fines de conservación ex situ.

Objetivos específicos
•	Prospectar las poblaciones naturales de la especie E. oleifera en las regiones Caribe y Andina de Colombia.
•	Caracterizar a nivel agronómico y fisicoquímico las poblaciones de E. oleifera seleccionadas.
•	Evaluar la diversidad genética de las poblaciones de E. oleifera seleccionadas.
•	Determinar la estructura poblacional de las palmas E. oleifera seleccionadas.
•	Relacionar la diversidad genética y estructura poblacional con la distribución espacial de las poblaciones bajo estudio.
•	Establecer una colección de semillas en estado de germinación de E. oleifera en CENIPALMA, que sea representativa de la diversidad genética de la especie en las zonas de estudio.

Project details

Project title: Estudio de la estructura genética espacial de la palma Elaeis oleifera (H.B.K) Cortés en zonas de distribución natural de Colombia con fines de conservación ex situ.
Personnel: Carmenza Montoya Jaramillo
Funding: Fondo de Fomento Palmero y Colciencias.
Study area descriptions/descriptor: Los 83 nichos identificados, es decir, antes de las colectas, pertenecen a cuatro zonas de vida de acuerdo con la clasificación de Caldas-Lang. Predomina el clima semiárido cálido, seguido del semi húmedo y húmedo cálido. Solo un nicho fue clasificado como seco cálido. Los paisajes predominantes fueron planicies aluviales, humedales, pantano y humedales lacustrinos. También se registró paisajes de colinas suaves y los datos de elevación indican que el hábitat de esta especie va de 0 a 500 msnm. La mayoría de los nichos identificados pertenecen a propiedades privadas con vocación ganadera y en un grado menor, a tierra cultivada con arroz o frutales, y los individuos observados se encontraban con alta frecuencia en zonas inundadas.
Design description: En cada sitio se colectó material foliar de máximo 10 palmas para los estudios de diversidad genética y racimos maduros para realizar análisis de ácidos grasos y para preservar semilla.

Data published through GBIF: https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cenipalma01

Taxonomic coverage

General taxonomic coverage description: Tronco con frecuencia rastrero. Aumentos anuales de altura entre 5 a 10 cm. El desarrollo de la raíz es parecido al de E. guineensis, pero las raíces que pueden crecer a 1 m de longitud se forman a lo largo del tronco rastrero. Todos los foliolos yacen en un plano y no tienen hinchazones basales y las espinas en el peciolo son cortas y gruesas. El racimo no tiene espigas largas. Los racimos son redondos y anchos en su centro, con tendencia a ser puntiagudos en el ápice. Con frecuencia los frutos partenocárpicos son numerosos.

R.H.V. Corley y P.B. Tinker. 2009. La palma de aceite. Primera edición en español. Fedepalma. Bogotá.
Taxonomic ranks
Species: Elaeis oleifera
Common names: Nolí o palma de corozo

Spatial coverage

General spatial coverage: 11 departamentos y 28 municipios de las regiones Caribe y Andina de Colombia.
Coordinates: 4°26'2.4''N and 12°10'4.8''N Latitude; 77°41'42''W and 71°56'16.8''W Longitude 

Temporal coverage: October 4, 2017 - May 5, 2019

Natural collections description

Parent collection identifier: CVEOC
Collection name: Colección viva Elaeis oleifera-Cenipalma
Collection identifier: Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 227
Specimen preservation method: Other

Methods

Method step description: Con el fin de establecer los polígonos o localidades sobre las cuales se pediría permiso de colecta, en 2016 se realizaron salidas con fines de pre prospección. En esta oportunidad se tomaron las coordenadas de los lugares en los que se ubicaban las palmas que eran de interés colectar. Los resultados de este trabajo se pueden consultar a profundidad en el Ceniavances titulado: “Biogeografía de Elaeis oleifera (HBK) Cortés en las regiones Caribe y Andina de Colombia, para la conservación ex situ y uso sostenible del recurso genético” (No 188, ISSN 0123-8353, septiembre del 2018).

Luego de la obtención del permiso de recolección se realizó la prospección de los nichos silvestres de la especie entre los meses de octubre del 2017 y abril del 2018 y abril-mayo 2019. Para esto, se efectuaron cinco salidas de campo en las cuales se prospectaron un total de 58 sitios (nichos), los cuales se distribuyen en 42 localidades y en ese momento se tomó la coordenada específica del lugar en el que se encontraba cada palma.

En cada sitio se colectó material de máximo 10 palmas. Se colectaron racimos en cada palma, si había disponibilidad de estos, se tomó una muestra de suelo por sitio para la identificación química de sus componentes y en algunos sitios se realizaron mediciones de intercambio de gases o lo que es equivalente, la tasa de fotosíntesis. 

Los racimos colectados se utilizaron para realizar el perfil de ácidos grasos y la preservación de semilla ex situ. Si el racimo colectado no se encontraba en punto óptimo de cosecha (maduro), no se utilizaba para el análisis de ácidos grasos, ya que estos análisis son válidos cuando la formación del fruto es completa. Sin embargo, todos los racimos colectados ingresaron a la cadena de preservación de semilla.

Respecto a la toma de muestras para efectuar los estudios genéticos se tomaron seis (6) folíolos del tercio medio de la hoja número uno y se guardaron en bolsas con 200 gr de sílica gel, para quitar humedad a la muestra, con el fin de realizar una posterior extracción del ADN.
Study extent description: Los 83 nichos identificados, es decir, antes de las colectas, pertenecen a cuatro zonas de vida de acuerdo con la clasificación de Caldas-Lang. Predomina el clima semiárido cálido, seguido del semi húmedo y húmedo cálido. Solo un nicho fue clasificado como seco cálido. Los paisajes predominantes fueron planicies aluviales, humedales, pantano y humedales lacustrinos. También se registró paisajes de colinas suaves y los datos de elevación indican que el hábitat de esta especie va de 0 a 500 msnm. La mayoría de los nichos identificados pertenecen a propiedades privadas con vocación ganadera y en un grado menor, a tierra cultivada con arroz o frutales, y los individuos observados se encontraban con alta frecuencia en zonas inundadas.

Los departamentos fueron Antioquia, Chocó, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena y Sucre, Boyacá, Cesar, La Guajira, Santander y Caldas.
Sampling description: En cada sitio se colectó material foliar de máximo 10 palmas. Sin embargo, la colecta de racimos por palma se hizo solo sí había disponibilidad de estos. Los frutos de los racimos son usados para hacer perfiles de ácidos grasos y para la germinación de semillas con el fin de tener plantas conservadas ex situ. Por otra parte, se tomaron 6 folíolos del tercio medio de la hoja número uno de cada una de las palmas identificada por sitio, con el fin de realizar una posterior extracción del ADN.
Quality control description: Ajuste de vocabulario controlado en el elemento geográfico county.

Datasets

Dataset description
Object name: Darwin Core Archive Estudio de la estructura genética espacial de la palma Elaeis oleifera
Character encoding: UTF-8
Format name: Darwin Core Archive format
Format version: 1.0
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/sib/archive.do?r=cenipalma01
Publication date of data: 2021-03-02
Language: Spanish
Licences of use: Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License

External datasets

Dataset description
Object name: Estudio de la estructura genética espacial de la palma Elaeis oleifera
Character encoding: UTF-8
Format name: DWC-A
Distribution: https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=1225_palma_20191121

Metadata language: Spanish
Date of metadata creation: 2018-11-07
Hierarchy level: Dataset

References
Montoya, C., Daza, E., Rincón, V., Ayala-Díaz, I., & Romero, H.M. 2018. Biogeografía de Elaeis oleifera (HBK) Cortés en las regiones Caribe y Andina de Colombia, para la conservación ex situ y uso sostenible del recurso genético. Ceniavances no. 188.
R.H.V. Corley y P.B. Tinker. 2009. La palma de aceite. Primera edición en español. Fedepalma. Bogotá.