Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH)

最新版本 由 Universidad Nacional de Colombia 發佈於 May 23, 2019 Universidad Nacional de Colombia

La colección Grupo de Estudios Relación Parásito Hospedero: Modelo Hemoparásitos Aviares (GERPH) de la Universidad Nacional de Colombia, fue fundada por la profesora Nubia Matta en 1998. Esta colección preserva micropreparados sanguíneos de fauna silvestre, sus parásitos y algunos ejemplares de posibles vectores. El grupo de hospederos más representativo en la colección son las aves, pero también se cuenta con ejemplares de anfibios, reptiles y mamíferos. El estudio de estos ejemplares permite extraer información sobre relaciones parásito-hospedero, diversidad de parásitos y algunos parámetros sanguíneos de fauna silvestre.

Data Records

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版本

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如何引用

研究者應依照以下指示引用此資源。:

Matta Camacho N E, Gonzalez Galindo A D, Pinto Osorio D F (2019): Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH). v2.1. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/bmzrb5

Rights

研究者應尊重以下權利聲明。:

The publisher and rights holder of this work is Universidad Nacional de Colombia. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊,並指定以下之GBIF UUID: 4346356a-8773-4205-95ce-57d3541017d4。  Universidad Nacional de Colombia 發佈此資源,並經由Colombian Biodiversity Information System同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Occurrence; Specimen; Hemoparásitos; malaria aviar; filarias; aves; Specimen

聯絡資訊

資源建立者:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá CO 3165000 ext 11302

可回覆此資源相關問題者:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

元數據填寫者:

Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302

與此資源的相關者:

擁有者
Universidad Nacional de Colombia
Institución que avala la colección
Universidad Nacional de Colombia CO
http://unal.edu.co
研究主持人
Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
典藏經理
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
處理者
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

地理涵蓋範圍

Aunque la colección cuenta con ejemplares de numerosos lugares en Colombia, en esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, Parque Nacional Natural Los Nevados sector Laguna del Otún y La Secreta, Parque Regionial Natural Ucumarí sector La Pastora y El Cedral.

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [4.629, -75.611], 緯度北界 經度東界 [4.778, -74.081]

分類群涵蓋範圍

Los hospederos vertebrados fueron identificados hasta especie en su mayoría, los parásitos protozooarios hasta género y algunos a especie, los parásitos nemátodos se categorizan hasta superfamilia.

Order  Anseriformes (patos),  Apodiformes (colibries y vencejos),  Charadriiformes,  Columbiformes (palomas),  Coraciiformes,  Cuculiformes,  Gruiformes,  Passeriformes,  Pelecaniformes,  Piciformes,  Trogoniformes (trogones)
Superfamily  Filaroidea
Family  Haemoproteidae,  Leucocytozoidae,  Plasmodiidae,  Trypanosomatidae

時間涵蓋範圍

起始日期 / 結束日期 2009-09-06 / 2013-06-03

計畫資料

無相關描述

計畫名稱 Colección Biológica GERPH: Porque los parásitos también son biodiversidad
經費來源 Convocatoria Nacional para el Fortalecimiento de Colecciones de la Universidad Nacional de Colombia 2017-2018

The personnel involved in the project:

研究主持人
Nubia Estela Matta Camacho
典藏經理
Angie Daniela Gonzalez Galindo
處理者
David Felipe Pinto Osorio
內容提供者
Ingrid Astrid Lotta Arevalo
內容提供者
Rafael Gutierrez

取樣方法

Las aves fueron capturadas usando redes de niebla, luego de ser identificadas se les realizo la toma de muestra sanguínea para diagnostico molecular y por frotis sobre laminas portaobjetos. Las laminas son procesadas y revisadas en el laboratorio por microscopia de luz.

研究範圍 En esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, a 2556 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos. Parque Nacional Natural Los Nevados Laguna del Otún, a 3927 m s.n.m. presenta una vegetación de páramo. Parque Nacional Natural Los Nevados La Secreta, a 3100-3400 m s.n.m. es un área transformada compuesta principalmente por pastos, cultivos de papa y relictos de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector La Pastora a 2461 m s.n.m. presenta vegetación de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector El Cedral, a 2122-2021 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos.
品質控管 La información sobre la identidad los hospederos tomada en campo fue contrastada con las fotografías y guías de campo para su identificación final. La información sobre los diagnósticos de infección e identidad de parasitos fue confirmada por los curadores de la colección, teniendo en cuenta el registro fotográfico de los mismos y/o su identificación molecular. Se unificaron los nombres de las localidades, los colectores e identificadores de los distintos grupos taxonómicos.

方法步驟描述:

  1. Se capturaron las aves mediante redes de niebla, se identificaron en campo con la guía Hilty, Brown W, Brown L (1986), se fotografiaron, midieron, pesaron y anillaron (excepto colibríes). De cada ave se obtuvo por corte distal de uña (para colibríes) o punción de la vena braquial una cantidad pequeña de sangre que fue utilizada para hacer al menos tres extendidos sanguíneos y una parte para ser almacenada en Etanol absoluto, EDTA o buffer SET para posteriores análisis moleculares.
  2. Las laminas fueron fijadas con metanol absoluto por 5 minutos y teñidas con Giemsa pH 7.2 por 45 minutos. Mediante microscopia de luz se observaron los extendidos, primero a menor aumento en 100X por 10 minutos y posteriormente a 1000x por cuarenta minutos. En los casos de diagnósticos positivos los parásitos fueron fotografiados con un microscopio con cámara referencia Leica DM570. A partir de las fotografías se tomaron algunas medidas morfológicas necesarias para la identificación de acuerdo a las claves propuestas por Valkiunas (2005) para los haemosporidios, y se indicó genero Trypanosma para los tripanosomatidos encontrados, así como superfamilia Filaroidea para las larvas (microfilarias) halladas en la sangre.
  3. En algunos casos la presencia de los parásitos haemosporidios fue confirmada mediante diagnostico molecular. Para esto se realizo la extracción del ADN genómico mediante el método de Fenol-Cloroformo modificado de Sambrook et al. (1989), seguido de la amplificación de una sección del gen Citocromo b del parásito usando los primers de Waldenstrom et al. (2004), Beadell et al. (2004) y Pacheco et al. (2011). Adicionalmente los productos de amplificación se secuenciaron y dicha infamación se depositó en el GenBank y la base especializada MalAvi (Bensch et al., 2009).

收藏資料

蒐藏名稱 Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito-Hospedero
蒐藏編號 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 198
上層採集品識別碼 GERPH
Specimen preservation methods Alcohol,  Microscopic preparation,  Refrigerated
管理單位 在...之間 3,700 和 3,900 Micropreparados

引用文獻

  1. Hilty, S. L., Brown, W. L., & Brown, B. (1986). A guide to the birds of Colombia. Princeton University Press.
  2. VALKIUNAS G. 2005. Avian malaria parasites and other haemosporidia. CRC Press, Boca Raton.
  3. WALDENSTROM J, BENSCH S, HASSELQUIST D, ÖSTMAN Ö. 2004. A new nested polymerase chain reaction method very efficient in detecting Plasmodium and Haemoproteus Infections From Avian Blood. Journal of parasitology, 90(1): 191-194.
  4. BEADELL JS, GERING E, AUSTIN J, DUMBACHER JP, PEIRCE MA, PRATT TK, ATKINSON CT, FLEISCHER RC. .2004 .Prevalence and differential host-specificity of two avian blood parasite genera in the Australo-Papuan region. Molecular Ecology, 13: 3829–3844.
  5. PACHECO MA, ESCALANTE AA, GARNER MM, BRADLEY GA. 2011. Haemosporidian infection in captive masked bobwhite quail (Colinus virginianus ridgwayi), an endangered subspecies of the northern bobwhite quail. Veterinary Parasitology, 182: 113-120.
  6. BENSCH S, HELLGREN, O, PEREZ-TRIS J, 2009. MalAvi: a public database of malaria parasites and related haemosporidians in avian hosts based on mitochondrial cytochrome b lineages. Molecular Ecology Resources. 9: 1353–1358.

額外的元數據

目的 Por tratarse de organismos parásitos muchas veces olvidados de los inventarios biológicos, la colección busca visibilizar la presencia este grupo de microorganismos en el país y la región. Al tiempo que da el primer paso en la consolidación de una base de datos de la colección que sea publica y estandarizada.
維護說明 Este recurso se irá actualizando con otras localidades o ejemplares de las localidades incluidas aquí en la medida en que los datos sean curados.
替代的識別碼 10.15472/bmzrb5
4346356a-8773-4205-95ce-57d3541017d4
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=unal_col_hemoparasitos