Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH)

Последняя версия опубликована Universidad Nacional de Colombia May 23, 2019 Universidad Nacional de Colombia

La colección Grupo de Estudios Relación Parásito Hospedero: Modelo Hemoparásitos Aviares (GERPH) de la Universidad Nacional de Colombia, fue fundada por la profesora Nubia Matta en 1998. Esta colección preserva micropreparados sanguíneos de fauna silvestre, sus parásitos y algunos ejemplares de posibles vectores. El grupo de hospederos más representativo en la colección son las aves, pero también se cuenta con ejemplares de anfibios, reptiles y mamíferos. El estudio de estos ejemplares permite extraer información sobre relaciones parásito-hospedero, diversidad de parásitos y algunos parámetros sanguíneos de fauna silvestre.

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Matta Camacho N E, Gonzalez Galindo A D, Pinto Osorio D F (2019): Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH). v2.1. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/bmzrb5

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Universidad Nacional de Colombia. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

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Ключевые слова

Occurrence; Specimen; Hemoparásitos; malaria aviar; filarias; aves; Specimen

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá CO 3165000 ext 11302

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

Кем заполнены метаданные:

Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302

Кто еще связан с данным ресурсом:

Owner
Universidad Nacional de Colombia
Institución que avala la colección
Universidad Nacional de Colombia CO
http://unal.edu.co
Principal Investigator
Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Curator
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
Processor
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

Географический охват

Aunque la colección cuenta con ejemplares de numerosos lugares en Colombia, en esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, Parque Nacional Natural Los Nevados sector Laguna del Otún y La Secreta, Parque Regionial Natural Ucumarí sector La Pastora y El Cedral.

Ограничивающие координаты Юг Запад [4.629, -75.611], Север Восток [4.778, -74.081]

Таксономический охват

Los hospederos vertebrados fueron identificados hasta especie en su mayoría, los parásitos protozooarios hasta género y algunos a especie, los parásitos nemátodos se categorizan hasta superfamilia.

Order  Anseriformes (patos),  Apodiformes (colibries y vencejos),  Charadriiformes,  Columbiformes (palomas),  Coraciiformes,  Cuculiformes,  Gruiformes,  Passeriformes,  Pelecaniformes,  Piciformes,  Trogoniformes (trogones)
Superfamily  Filaroidea
Family  Haemoproteidae,  Leucocytozoidae,  Plasmodiidae,  Trypanosomatidae

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2009-09-06 / 2013-06-03

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Colección Biológica GERPH: Porque los parásitos también son biodiversidad
Финансирование Convocatoria Nacional para el Fortalecimiento de Colecciones de la Universidad Nacional de Colombia 2017-2018

Исполнители проекта:

Principal Investigator
Nubia Estela Matta Camacho
Curator
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Processor
David Felipe Pinto Osorio
Content Provider
Ingrid Astrid Lotta Arevalo
Content Provider
Rafael Gutierrez

Методы сбора

Las aves fueron capturadas usando redes de niebla, luego de ser identificadas se les realizo la toma de muestra sanguínea para diagnostico molecular y por frotis sobre laminas portaobjetos. Las laminas son procesadas y revisadas en el laboratorio por microscopia de luz.

Охват исследования En esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, a 2556 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos. Parque Nacional Natural Los Nevados Laguna del Otún, a 3927 m s.n.m. presenta una vegetación de páramo. Parque Nacional Natural Los Nevados La Secreta, a 3100-3400 m s.n.m. es un área transformada compuesta principalmente por pastos, cultivos de papa y relictos de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector La Pastora a 2461 m s.n.m. presenta vegetación de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector El Cedral, a 2122-2021 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos.
Контроль качества La información sobre la identidad los hospederos tomada en campo fue contrastada con las fotografías y guías de campo para su identificación final. La información sobre los diagnósticos de infección e identidad de parasitos fue confirmada por los curadores de la colección, teniendo en cuenta el registro fotográfico de los mismos y/o su identificación molecular. Se unificaron los nombres de las localidades, los colectores e identificadores de los distintos grupos taxonómicos.

Описание этапа методики:

  1. Se capturaron las aves mediante redes de niebla, se identificaron en campo con la guía Hilty, Brown W, Brown L (1986), se fotografiaron, midieron, pesaron y anillaron (excepto colibríes). De cada ave se obtuvo por corte distal de uña (para colibríes) o punción de la vena braquial una cantidad pequeña de sangre que fue utilizada para hacer al menos tres extendidos sanguíneos y una parte para ser almacenada en Etanol absoluto, EDTA o buffer SET para posteriores análisis moleculares.
  2. Las laminas fueron fijadas con metanol absoluto por 5 minutos y teñidas con Giemsa pH 7.2 por 45 minutos. Mediante microscopia de luz se observaron los extendidos, primero a menor aumento en 100X por 10 minutos y posteriormente a 1000x por cuarenta minutos. En los casos de diagnósticos positivos los parásitos fueron fotografiados con un microscopio con cámara referencia Leica DM570. A partir de las fotografías se tomaron algunas medidas morfológicas necesarias para la identificación de acuerdo a las claves propuestas por Valkiunas (2005) para los haemosporidios, y se indicó genero Trypanosma para los tripanosomatidos encontrados, así como superfamilia Filaroidea para las larvas (microfilarias) halladas en la sangre.
  3. En algunos casos la presencia de los parásitos haemosporidios fue confirmada mediante diagnostico molecular. Para esto se realizo la extracción del ADN genómico mediante el método de Fenol-Cloroformo modificado de Sambrook et al. (1989), seguido de la amplificación de una sección del gen Citocromo b del parásito usando los primers de Waldenstrom et al. (2004), Beadell et al. (2004) y Pacheco et al. (2011). Adicionalmente los productos de amplificación se secuenciaron y dicha infamación se depositó en el GenBank y la base especializada MalAvi (Bensch et al., 2009).

Данные коллекции

Название коллекции Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito-Hospedero
Идентификатор коллекции Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 198
Идентификатор родительской коллекции GERPH
Методы сохранения образцов Alcohol,  Microscopic preparation,  Refrigerated
Единицы хранения Между 3,700 и 3,900 Micropreparados

Библиографические ссылки

  1. Hilty, S. L., Brown, W. L., & Brown, B. (1986). A guide to the birds of Colombia. Princeton University Press.
  2. VALKIUNAS G. 2005. Avian malaria parasites and other haemosporidia. CRC Press, Boca Raton.
  3. WALDENSTROM J, BENSCH S, HASSELQUIST D, ÖSTMAN Ö. 2004. A new nested polymerase chain reaction method very efficient in detecting Plasmodium and Haemoproteus Infections From Avian Blood. Journal of parasitology, 90(1): 191-194.
  4. BEADELL JS, GERING E, AUSTIN J, DUMBACHER JP, PEIRCE MA, PRATT TK, ATKINSON CT, FLEISCHER RC. .2004 .Prevalence and differential host-specificity of two avian blood parasite genera in the Australo-Papuan region. Molecular Ecology, 13: 3829–3844.
  5. PACHECO MA, ESCALANTE AA, GARNER MM, BRADLEY GA. 2011. Haemosporidian infection in captive masked bobwhite quail (Colinus virginianus ridgwayi), an endangered subspecies of the northern bobwhite quail. Veterinary Parasitology, 182: 113-120.
  6. BENSCH S, HELLGREN, O, PEREZ-TRIS J, 2009. MalAvi: a public database of malaria parasites and related haemosporidians in avian hosts based on mitochondrial cytochrome b lineages. Molecular Ecology Resources. 9: 1353–1358.

Дополнительные метаданные

Цель Por tratarse de organismos parásitos muchas veces olvidados de los inventarios biológicos, la colección busca visibilizar la presencia este grupo de microorganismos en el país y la región. Al tiempo que da el primer paso en la consolidación de una base de datos de la colección que sea publica y estandarizada.
Описание частоты обновления ресурса Este recurso se irá actualizando con otras localidades o ejemplares de las localidades incluidas aquí en la medida en que los datos sean curados.
Альтернативные идентификаторы 10.15472/bmzrb5
4346356a-8773-4205-95ce-57d3541017d4
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=unal_col_hemoparasitos