Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH)

最新バージョン Universidad Nacional de Colombia によって公開 May 23, 2019 Universidad Nacional de Colombia

La colección Grupo de Estudios Relación Parásito Hospedero: Modelo Hemoparásitos Aviares (GERPH) de la Universidad Nacional de Colombia, fue fundada por la profesora Nubia Matta en 1998. Esta colección preserva micropreparados sanguíneos de fauna silvestre, sus parásitos y algunos ejemplares de posibles vectores. El grupo de hospederos más representativo en la colección son las aves, pero también se cuenta con ejemplares de anfibios, reptiles y mamíferos. El estudio de estos ejemplares permite extraer información sobre relaciones parásito-hospedero, diversidad de parásitos y algunos parámetros sanguíneos de fauna silvestre.

データ レコード

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バージョン

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引用方法

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Matta Camacho N E, Gonzalez Galindo A D, Pinto Osorio D F (2019): Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH). v2.1. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/bmzrb5

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Universidad Nacional de Colombia。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 4346356a-8773-4205-95ce-57d3541017d4が割り当てられています。   Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversidad Nacional de Colombia が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen; Hemoparásitos; malaria aviar; filarias; aves; Specimen

連絡先

リソースを作成した人:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá CO 3165000 ext 11302

リソースに関する質問に答えることができる人:

Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

メタデータを記載した人:

Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302

他に、リソースに関連付けられていた人:

データ所有者
Universidad Nacional de Colombia
Institución que avala la colección
Universidad Nacional de Colombia CO
http://unal.edu.co
研究代表者
Nubia Estela Matta Camacho
Profesor titular, curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 133 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11337
キュレーター
Angie Daniela Gonzalez Galindo
Profesor auxiliar, co-curador
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Ofi. 148 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11302
データ処理者
David Felipe Pinto Osorio
Estudiante auxiliar
Universidad Nacional de Colombia Carrera 30 # 45-03 Edificio 421 Lab. 126 Bogotá Bogotá CO 3165000 ext 11338

地理的範囲

Aunque la colección cuenta con ejemplares de numerosos lugares en Colombia, en esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, Parque Nacional Natural Los Nevados sector Laguna del Otún y La Secreta, Parque Regionial Natural Ucumarí sector La Pastora y El Cedral.

座標(緯度経度) 南 西 [4.629, -75.611], 北 東 [4.778, -74.081]

生物分類学的範囲

Los hospederos vertebrados fueron identificados hasta especie en su mayoría, los parásitos protozooarios hasta género y algunos a especie, los parásitos nemátodos se categorizan hasta superfamilia.

Order  Anseriformes (patos),  Apodiformes (colibries y vencejos),  Charadriiformes,  Columbiformes (palomas),  Coraciiformes,  Cuculiformes,  Gruiformes,  Passeriformes,  Pelecaniformes,  Piciformes,  Trogoniformes (trogones)
Superfamily  Filaroidea
Family  Haemoproteidae,  Leucocytozoidae,  Plasmodiidae,  Trypanosomatidae

時間的範囲

開始日 / 終了日 2009-09-06 / 2013-06-03

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル Colección Biológica GERPH: Porque los parásitos también son biodiversidad
ファンデイング Convocatoria Nacional para el Fortalecimiento de Colecciones de la Universidad Nacional de Colombia 2017-2018

プロジェクトに携わる要員:

研究代表者
Nubia Estela Matta Camacho
キュレーター
Angie Daniela Gonzalez Galindo
データ処理者
David Felipe Pinto Osorio
データ提供者
Ingrid Astrid Lotta Arevalo
データ提供者
Rafael Gutierrez

収集方法

Las aves fueron capturadas usando redes de niebla, luego de ser identificadas se les realizo la toma de muestra sanguínea para diagnostico molecular y por frotis sobre laminas portaobjetos. Las laminas son procesadas y revisadas en el laboratorio por microscopia de luz.

Study Extent En esta versión de publicación de datos solo se incluyen las localidades: Campus Universidad Nacional de Colombia sede Bogotá, a 2556 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos. Parque Nacional Natural Los Nevados Laguna del Otún, a 3927 m s.n.m. presenta una vegetación de páramo. Parque Nacional Natural Los Nevados La Secreta, a 3100-3400 m s.n.m. es un área transformada compuesta principalmente por pastos, cultivos de papa y relictos de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector La Pastora a 2461 m s.n.m. presenta vegetación de bosque altoandino. Parque Regional Natural Ucumarí sector El Cedral, a 2122-2021 m s.n.m. es un área muy transformada compuesta principalmente por pastos.
Quality Control La información sobre la identidad los hospederos tomada en campo fue contrastada con las fotografías y guías de campo para su identificación final. La información sobre los diagnósticos de infección e identidad de parasitos fue confirmada por los curadores de la colección, teniendo en cuenta el registro fotográfico de los mismos y/o su identificación molecular. Se unificaron los nombres de las localidades, los colectores e identificadores de los distintos grupos taxonómicos.

Method step description:

  1. Se capturaron las aves mediante redes de niebla, se identificaron en campo con la guía Hilty, Brown W, Brown L (1986), se fotografiaron, midieron, pesaron y anillaron (excepto colibríes). De cada ave se obtuvo por corte distal de uña (para colibríes) o punción de la vena braquial una cantidad pequeña de sangre que fue utilizada para hacer al menos tres extendidos sanguíneos y una parte para ser almacenada en Etanol absoluto, EDTA o buffer SET para posteriores análisis moleculares.
  2. Las laminas fueron fijadas con metanol absoluto por 5 minutos y teñidas con Giemsa pH 7.2 por 45 minutos. Mediante microscopia de luz se observaron los extendidos, primero a menor aumento en 100X por 10 minutos y posteriormente a 1000x por cuarenta minutos. En los casos de diagnósticos positivos los parásitos fueron fotografiados con un microscopio con cámara referencia Leica DM570. A partir de las fotografías se tomaron algunas medidas morfológicas necesarias para la identificación de acuerdo a las claves propuestas por Valkiunas (2005) para los haemosporidios, y se indicó genero Trypanosma para los tripanosomatidos encontrados, así como superfamilia Filaroidea para las larvas (microfilarias) halladas en la sangre.
  3. En algunos casos la presencia de los parásitos haemosporidios fue confirmada mediante diagnostico molecular. Para esto se realizo la extracción del ADN genómico mediante el método de Fenol-Cloroformo modificado de Sambrook et al. (1989), seguido de la amplificación de una sección del gen Citocromo b del parásito usando los primers de Waldenstrom et al. (2004), Beadell et al. (2004) y Pacheco et al. (2011). Adicionalmente los productos de amplificación se secuenciaron y dicha infamación se depositó en el GenBank y la base especializada MalAvi (Bensch et al., 2009).

コレクションデータ

コレクション名 Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito-Hospedero
コレクション識別子 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 198
Parent Collection Identifier GERPH
標本保存方法 Alcohol,  Microscopic preparation,  Refrigerated
Curatorialユニット 範囲 3,700 ~ 3,900 Micropreparados

書誌情報の引用

  1. Hilty, S. L., Brown, W. L., & Brown, B. (1986). A guide to the birds of Colombia. Princeton University Press.
  2. VALKIUNAS G. 2005. Avian malaria parasites and other haemosporidia. CRC Press, Boca Raton.
  3. WALDENSTROM J, BENSCH S, HASSELQUIST D, ÖSTMAN Ö. 2004. A new nested polymerase chain reaction method very efficient in detecting Plasmodium and Haemoproteus Infections From Avian Blood. Journal of parasitology, 90(1): 191-194.
  4. BEADELL JS, GERING E, AUSTIN J, DUMBACHER JP, PEIRCE MA, PRATT TK, ATKINSON CT, FLEISCHER RC. .2004 .Prevalence and differential host-specificity of two avian blood parasite genera in the Australo-Papuan region. Molecular Ecology, 13: 3829–3844.
  5. PACHECO MA, ESCALANTE AA, GARNER MM, BRADLEY GA. 2011. Haemosporidian infection in captive masked bobwhite quail (Colinus virginianus ridgwayi), an endangered subspecies of the northern bobwhite quail. Veterinary Parasitology, 182: 113-120.
  6. BENSCH S, HELLGREN, O, PEREZ-TRIS J, 2009. MalAvi: a public database of malaria parasites and related haemosporidians in avian hosts based on mitochondrial cytochrome b lineages. Molecular Ecology Resources. 9: 1353–1358.

追加のメタデータ

目的 Por tratarse de organismos parásitos muchas veces olvidados de los inventarios biológicos, la colección busca visibilizar la presencia este grupo de microorganismos en el país y la región. Al tiempo que da el primer paso en la consolidación de una base de datos de la colección que sea publica y estandarizada.
メンテナンス内容 Este recurso se irá actualizando con otras localidades o ejemplares de las localidades incluidas aquí en la medida en que los datos sean curados.
代替識別子 10.15472/bmzrb5
4346356a-8773-4205-95ce-57d3541017d4
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=unal_col_hemoparasitos