Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 48 enregistrements.
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Versions
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Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia. v2.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/hen46i
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 55591114-cdec-443a-becc-45851cb29fb0. Universidad Pontificia Bolivariana publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.
Mots-clé
Ticks; Tick-Borne Diseases; cattle; zoonoses; Occurrence; Observation; PERMISO_COLECTA
Données externes
Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats
Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_zoonosis_20200220 UTF-8 DWC-A |
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Contacts
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Personne ayant renseigné les métadonnées:
Autres personnes associées à la ressource:
Couverture géographique
Zonas de muestreo en el Magdalena Medio de Antioquia, Colombia
Enveloppe géographique | Sud Ouest [5,797, -74,79], Nord Est [6,645, -74,456] |
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Couverture taxonomique
Los especímenes de garrapatas adultas recolectados en este proyecto (en bovinos) correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus, mientras que en el estado de nifas colectadas en potreros en pastoreo activo se identificaron a las especies Rhipicephalus microplus y Dermacentor nitens y en el estado de larvas también se identifico a la especie Amblyomma patinoi.
Species | Rhipicephalus microplus, Dermacentor nitens, Amblyomma patinoi |
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Couverture temporelle
Date de début / Date de fin | 2015-08-03 / 2015-10-08 |
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Données sur le projet
SINOPSIS TÉCNICA El diseño de este estudio fue descriptivo transversal. Se ejecutaron muestreos en un total de 48 fincas ubicadas en los municipios de Belmira, Entrerrios y San Pedro de los milagros en la zona norte, y en Puerto Berrio, Puerto Triunfo y Puerto Nare en el Magdalena medio de Antioquia. Se recolectaron muestras de sangre de un total de 384 bovinos y 332 personas, con exposición a ganado bovino, además se realizaron muestreos entomológicos para valorar la infestación por garrapatas en bovinos y potreros activos. Se realizó una tamización serológica de las muestras de bovinos y humanos para evaluar la seropositividad de anticuerpos séricos IgM e IgG para los géneros de bacterias Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, Borrelia y Coxiella. Además, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de muestras de sangre de humanos y bovinos, así como de especímenes de las garrapatas recolectadas en las zonas de estudio, con el fin de identificar la infección natural por estos mismos agentes, mediante la amplificación por PCR de diferentes marcadores moleculares específicos para estos géneros. Además, se recopilo información sociodemográfica, de antecedentes epidemiológicos, técnico-económica y ambiental de los grupos y agroecológica de las zonas de estudio, y se hicieron análisis geoespaciales a partir de este conjunto de datos, tomando como modelo, los resultados obtenidos para la bacteria del género Anaplasma. En general, se obtuvo seropositividad entre moderada a alta para la detección de anticuerpos IgM e IgG anti Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, y Coxiella, tanto en personas como en bovinos de los 6 municipios analizados. En el análisis microscópico ejecutado, no se evidenció positividad para la detección microscópica de estructuras compatibles con la infección por bacterias intracelulares del género Anaplasma ni en las personas incluidas en el estudio ni en las muestras de los bovinos pertenecientes a la subregión del Norte de Antioquia. Mientras que en las muestras de sangre de bovinos de la subregión del Magdalena Medio si se evidencio positividad bajo este análisis. En el análisis molecular de las muestras de humanos, se detectaron muestras positivas para los géneros Anaplasma, Rickettsia y Coxiella, mientras que en los bovinos y las garrapatas se encontraron muestras positivas para los distintos géneros bacterianos en estudio. El análisis de las secuencias de los marcadores moleculares usados para la detección mediante PCR de cada genero bacteriano, mostró un porcentaje de identidad mayor para la especie Anaplasma marginale en el caso de las secuencias obtenidas en distintas muestras para el género Anaplasma. Asimismo, en el análisis BLASTn ejecutado, para las secuencias de ADN obtenidas para los géneros Ehrlichia, Rickettsia, Coxiella se observó un mayor porcentaje de identidad (99-100%) con las especies Ehrlichia minasensis, Rickettsia amblyommatis y Coxiella burnetii, respectivamente; sin embargo, se requerirán estudios futuros que permitan la designación de la especie(s) involucrada(s) en las infecciones detectadas en los bovinos, humanos y garrapatas de las zonas estudiadas. En su conjunto, los resultados serológicos, microscópicos y moleculares obtenidos en las muestras de bovinos, garrapatas y humanos, sugieren la circulación de este tipo de agentes en el contexto ganadero de las subregiones estudiadas, por lo cual será pertinente evaluar su papel como agentes etiológicos potenciales de enfermedades infecciosas en estas zonas, para establecer algún tipo de diagnóstico diferencial, tanto para el ganado como para los humanos, así como métodos de control ambientalmente sostenibles, para las infestaciones por garrapatas.
Titre | Prevalencia de enfermedades emergentes zoonóticas asociadas con síndrome febril: anaplasmosis, borreliosis, ehrlichiosis, rickettsiosis y coxiellosis en zonas ganaderas de Antioquia |
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Identifiant | UPB:211B-02/14-65:PG |
Financement | Proyecto financiado por COLCIENCIAS: Código 121056934576 y contrato Nº 653- 2013. Investigación ejecutada por la Universidad Pontificia Bolivariana y coejecutada por la Universidad de Antioquia y COLANTA. Con el apoyo logístico de COREGAN, APAGRONAR, COOLETRIUNFO y del Consejo técnico departamental de zoonosis de la Dirección de factores de riesgo de la Secretaría Seccional de Salud y Protección Social de Antioquia. |
Description du domaine d'étude / de recherche | Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia. |
Description du design | En el componente entomológico de esta investigación se realizaron muestreos de garrapatas tanto en bovinos como en potreros en pastoreo activo. Los especímenes recolectados fueron identificados usando claves taxonómicas dicotomicas y ademas se realizó un análisis molecular complementario para confirmar dicha identificación hasta el nivel de género o especie, cuando fue posible. Para los aspectos de identificación molecular de las especies de garrapatas y la detección molecular de las bacterias de los géneros en estudio, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de especímenes de garrapatas individuales o en pooles. Posteriormente a cada procedimiento de extracción se cuantificó la concentración de ADN genómico obtenido usando el equipo Nanodrop® 2000c (Thermo Fisher Scientific, Waltham, USA) y se almacenó a -20ºC hasta el análisis molecular. |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
-Para el caso de las garrapatas recolectadas en los bovinos estas fueron obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron almacenadas en etanol al 70% a temperatura ambiente y posteriormente se realizó la extracción del ADN genomico. -Muestreo de formas no parasíticas de las garrapatas en los potreros en pastoreo activo: con el fin de recolectar formas no parasíticas de las garrapatas que pudieran estar presentes en praderas, en la zona norte la metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2 la cual se arrastró de manera horizontal en el potrero seleccionado para el análisis, se siguió un patrón de recorrido aleatorio hasta cubrir un área con una superficie de 1 m x 70 m, con la ejecución de cuatro recorridos lineales dirigidos en forma de cruz, uno de ida y otro de regreso, por trayecto, en un tiempo de 7 minutos por recorrido, para un total de 28 minutos. En la zona del Magdalena Medio antioqueño, el muestreo se realizó en dos potreros de cada finca que se encontraban en pastoreo activo. La metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2, para realizar el arrastre o Dragging en ocho transectos lineales de 90 metros, formando una malla para un recorrido total de 720 metros por potrero, inspeccionando la franela de forma frecuente, las garrapatas fueron retiradas con cepillo quitapelusa y depositadas en bolsas sellables con silica gel.
Etendue de l'étude | 24 fincas ganaderas ubicadas en la región del Norte (municipios de Belmira, San Pdero de los Milagros y Entrerrios) y 24 ubicadas en la región del Magdalena medio (Puerto Berrio, Puerto triunfo y Puerto Nare) de Antioquia. |
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Contrôle qualité | En las pruebas moleculares se utilizaron controles de ADN de identificación reconocida con el fin de realizar procesos de validación interna de cada prueba molecular usada. Ademas se efectuaron pruebas para verificar la posible interferencia de inhibidores de la amplificación que pudieran estar presentes en las muestras de ADN genomico extraídas a partir de los especímenes de garrapatas. |
Description des étapes de la méthode:
- La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte de la identificación de especies encontradas y de los indices de infestación detectados en la zonas de estudio y un segundo articulo contendrá la información asociada con la infección natural detectada para los géneros Anaplasma, Rickettsia, Babesia y Coxiella en las garrapatas colectadas en el Magdalena medio de Antioquia. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral.
Données de collection
Nom de la collection | Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I) |
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Identifiant de collection | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003 |
Identifiant de la collection parente | IAvH |
Méthode de conservation des spécimens | Alcohol |
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Unités de conservation | Entre (nombre minimal) 2 951 et (nombre maximal) 2 953 Espécimen completo |
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Métadonnées additionnelles
Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.
Objet | Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana. |
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Description de la fréquence de mise à jour | Cada que sea necesario |
Identifiants alternatifs | 10.15472/hen46i |
55591114-cdec-443a-becc-45851cb29fb0 | |
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=prevalencia_zoonosis_radicado_cidi-upb_211b-02-14-65 |