Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia

Última versión Publicado por Universidad Pontificia Bolivariana en Feb 20, 2020 Universidad Pontificia Bolivariana

Este conjunto de datos corresponden a especímenes de garrapatas recolectadas en escenarios ganaderos del Magdalena Medio de Antioquia en el marco del componente entomologico asociado con el proyecto financiado por COLCIENCIAS Contrato 653-2013: "Prevalencia de enfermedades emergentes zoonóticas asociadas con síndrome febril: anaplasmosis, borreliosis, ehrlichiosis, rickettsiosis y coxiellosis en zonas ganaderas de Antioquia"

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 48 registros.

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 48 registros en Español (10 KB) - Frecuencia de actualización: cuando sea necesario
Metadatos como un archivo EML descargar en Español (23 KB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Español (15 KB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquia. v2.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/hen46i

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 55591114-cdec-443a-becc-45851cb29fb0.  Universidad Pontificia Bolivariana publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

Ticks; Tick-Borne Diseases; cattle; zoonoses; Occurrence; Observation; PERMISO_COLECTA

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Garrapatas (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Magdalena medio de Antioquiahttps://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_zoonosis_20200220 UTF-8 DWC-A

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 ext. 19333
https://www.upb.edu.co/es/investigacion/nuestro-sistema/grupos/grupo-investigaciones-biologia-sistemas-medellin
Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 Ext. 19333

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 ext. 19333
https://www.upb.edu.co/es/investigacion/nuestro-sistema/grupos/grupo-investigaciones-biologia-sistemas-medellin

¿Quién documentó los metadatos?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 Ext. 19333
https://www.upb.edu.co/es/investigacion/nuestro-sistema/grupos/grupo-investigaciones-biologia-sistemas-medellin
Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 Ext. 19333

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Investigador Principal
Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 4488388 ext. 19333
https://www.upb.edu.co/es/investigacion/nuestro-sistema/grupos/grupo-investigaciones-biologia-sistemas-medellin

Cobertura Geográfica

Zonas de muestreo en el Magdalena Medio de Antioquia, Colombia

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [5.797, -74.79], Latitud Máxima Longitud Máxima [6.645, -74.456]

Cobertura Taxonómica

Los especímenes de garrapatas adultas recolectados en este proyecto (en bovinos) correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus, mientras que en el estado de nifas colectadas en potreros en pastoreo activo se identificaron a las especies Rhipicephalus microplus y Dermacentor nitens y en el estado de larvas también se identifico a la especie Amblyomma patinoi.

Especie  Rhipicephalus microplus,  Dermacentor nitens,  Amblyomma patinoi

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2015-08-03 / 2015-10-08

Datos del Proyecto

SINOPSIS TÉCNICA El diseño de este estudio fue descriptivo transversal. Se ejecutaron muestreos en un total de 48 fincas ubicadas en los municipios de Belmira, Entrerrios y San Pedro de los milagros en la zona norte, y en Puerto Berrio, Puerto Triunfo y Puerto Nare en el Magdalena medio de Antioquia. Se recolectaron muestras de sangre de un total de 384 bovinos y 332 personas, con exposición a ganado bovino, además se realizaron muestreos entomológicos para valorar la infestación por garrapatas en bovinos y potreros activos. Se realizó una tamización serológica de las muestras de bovinos y humanos para evaluar la seropositividad de anticuerpos séricos IgM e IgG para los géneros de bacterias Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, Borrelia y Coxiella. Además, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de muestras de sangre de humanos y bovinos, así como de especímenes de las garrapatas recolectadas en las zonas de estudio, con el fin de identificar la infección natural por estos mismos agentes, mediante la amplificación por PCR de diferentes marcadores moleculares específicos para estos géneros. Además, se recopilo información sociodemográfica, de antecedentes epidemiológicos, técnico-económica y ambiental de los grupos y agroecológica de las zonas de estudio, y se hicieron análisis geoespaciales a partir de este conjunto de datos, tomando como modelo, los resultados obtenidos para la bacteria del género Anaplasma. En general, se obtuvo seropositividad entre moderada a alta para la detección de anticuerpos IgM e IgG anti Anaplasma, Ehrlichia, Rickettsia, y Coxiella, tanto en personas como en bovinos de los 6 municipios analizados. En el análisis microscópico ejecutado, no se evidenció positividad para la detección microscópica de estructuras compatibles con la infección por bacterias intracelulares del género Anaplasma ni en las personas incluidas en el estudio ni en las muestras de los bovinos pertenecientes a la subregión del Norte de Antioquia. Mientras que en las muestras de sangre de bovinos de la subregión del Magdalena Medio si se evidencio positividad bajo este análisis. En el análisis molecular de las muestras de humanos, se detectaron muestras positivas para los géneros Anaplasma, Rickettsia y Coxiella, mientras que en los bovinos y las garrapatas se encontraron muestras positivas para los distintos géneros bacterianos en estudio. El análisis de las secuencias de los marcadores moleculares usados para la detección mediante PCR de cada genero bacteriano, mostró un porcentaje de identidad mayor para la especie Anaplasma marginale en el caso de las secuencias obtenidas en distintas muestras para el género Anaplasma. Asimismo, en el análisis BLASTn ejecutado, para las secuencias de ADN obtenidas para los géneros Ehrlichia, Rickettsia, Coxiella se observó un mayor porcentaje de identidad (99-100%) con las especies Ehrlichia minasensis, Rickettsia amblyommatis y Coxiella burnetii, respectivamente; sin embargo, se requerirán estudios futuros que permitan la designación de la especie(s) involucrada(s) en las infecciones detectadas en los bovinos, humanos y garrapatas de las zonas estudiadas. En su conjunto, los resultados serológicos, microscópicos y moleculares obtenidos en las muestras de bovinos, garrapatas y humanos, sugieren la circulación de este tipo de agentes en el contexto ganadero de las subregiones estudiadas, por lo cual será pertinente evaluar su papel como agentes etiológicos potenciales de enfermedades infecciosas en estas zonas, para establecer algún tipo de diagnóstico diferencial, tanto para el ganado como para los humanos, así como métodos de control ambientalmente sostenibles, para las infestaciones por garrapatas.

Título Prevalencia de enfermedades emergentes zoonóticas asociadas con síndrome febril: anaplasmosis, borreliosis, ehrlichiosis, rickettsiosis y coxiellosis en zonas ganaderas de Antioquia
Identificador UPB:211B-02/14-65:PG
Fuentes de Financiación Proyecto financiado por COLCIENCIAS: Código 121056934576 y contrato Nº 653- 2013. Investigación ejecutada por la Universidad Pontificia Bolivariana y coejecutada por la Universidad de Antioquia y COLANTA. Con el apoyo logístico de COREGAN, APAGRONAR, COOLETRIUNFO y del Consejo técnico departamental de zoonosis de la Dirección de factores de riesgo de la Secretaría Seccional de Salud y Protección Social de Antioquia.
Descripción del Área de Estudio Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia.
Descripción del Diseño En el componente entomológico de esta investigación se realizaron muestreos de garrapatas tanto en bovinos como en potreros en pastoreo activo. Los especímenes recolectados fueron identificados usando claves taxonómicas dicotomicas y ademas se realizó un análisis molecular complementario para confirmar dicha identificación hasta el nivel de género o especie, cuando fue posible. Para los aspectos de identificación molecular de las especies de garrapatas y la detección molecular de las bacterias de los géneros en estudio, se realizó la extracción de ADN genómico a partir de especímenes de garrapatas individuales o en pooles. Posteriormente a cada procedimiento de extracción se cuantificó la concentración de ADN genómico obtenido usando el equipo Nanodrop® 2000c (Thermo Fisher Scientific, Waltham, USA) y se almacenó a -20ºC hasta el análisis molecular.

Personas asociadas al proyecto:

Métodos de Muestreo

-Para el caso de las garrapatas recolectadas en los bovinos estas fueron obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron almacenadas en etanol al 70% a temperatura ambiente y posteriormente se realizó la extracción del ADN genomico. -Muestreo de formas no parasíticas de las garrapatas en los potreros en pastoreo activo: con el fin de recolectar formas no parasíticas de las garrapatas que pudieran estar presentes en praderas, en la zona norte la metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2 la cual se arrastró de manera horizontal en el potrero seleccionado para el análisis, se siguió un patrón de recorrido aleatorio hasta cubrir un área con una superficie de 1 m x 70 m, con la ejecución de cuatro recorridos lineales dirigidos en forma de cruz, uno de ida y otro de regreso, por trayecto, en un tiempo de 7 minutos por recorrido, para un total de 28 minutos. En la zona del Magdalena Medio antioqueño, el muestreo se realizó en dos potreros de cada finca que se encontraban en pastoreo activo. La metodología utilizada incluyó la utilización de una franela blanca de un tamaño de 1m2, para realizar el arrastre o Dragging en ocho transectos lineales de 90 metros, formando una malla para un recorrido total de 720 metros por potrero, inspeccionando la franela de forma frecuente, las garrapatas fueron retiradas con cepillo quitapelusa y depositadas en bolsas sellables con silica gel.

Área de Estudio 24 fincas ganaderas ubicadas en la región del Norte (municipios de Belmira, San Pdero de los Milagros y Entrerrios) y 24 ubicadas en la región del Magdalena medio (Puerto Berrio, Puerto triunfo y Puerto Nare) de Antioquia.
Control de Calidad En las pruebas moleculares se utilizaron controles de ADN de identificación reconocida con el fin de realizar procesos de validación interna de cada prueba molecular usada. Ademas se efectuaron pruebas para verificar la posible interferencia de inhibidores de la amplificación que pudieran estar presentes en las muestras de ADN genomico extraídas a partir de los especímenes de garrapatas.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte de la identificación de especies encontradas y de los indices de infestación detectados en la zonas de estudio y un segundo articulo contendrá la información asociada con la infección natural detectada para los géneros Anaplasma, Rickettsia, Babesia y Coxiella en las garrapatas colectadas en el Magdalena medio de Antioquia. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I)
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003
Identificador de la Colección Parental IAvH
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol
Unidades Curatoriales Entre 2,951 y 2,953 Espécimen completo

Metadatos Adicionales

Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.

Propósito Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana.
Descripción de mantenimiento Cada que sea necesario
Identificadores Alternativos 10.15472/hen46i
55591114-cdec-443a-becc-45851cb29fb0
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=prevalencia_zoonosis_radicado_cidi-upb_211b-02-14-65