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Moluscos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV)

Última versión Publicado por Universidad del Valle en 26 de agosto de 2023 Universidad del Valle
Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Actualmente posee 6320 registros de crustáceos, de los cuales se han revisado y curado 2630 registros biológicos hasta el momento, correspondientes a 365 especies, que se encuentran repartidas en 3 clases (Bivalvia, Gastropoda y Polyplacophora). Los registros provienen casi que en su totalidad, de la región del Pacífico colombiano. Estos registros datan desde el año 1972 hasta el año 2022, en donde el Biólogo Jaime Ricardo Cantera Kintz fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar esta colección en los años 1970's. Esta colección de referencia se estableció formalmente ante el instituto Alexander Von Humboldt en el año 2002.
Fecha de publicación:
26 de agosto de 2023
Alojado por:
Universidad del Valle
Licencia:
CC-BY 4.0

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 2.630 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    2630
  • Permit 
    2630
  • Identifier
    2630

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Salazar Hernandez J A, Londoño-Cruz E, Montoya-Cadavid E, Cantera Kintz J R (2023): Moluscos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV). v8.5. Universidad del Valle. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/hnrpqx

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad del Valle. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: f8f6714c-e846-4ce8-819e-7d39839c2bf7.  Universidad del Valle publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras clave

Occurrence; Specimen; Mollusca; Moluscos; Gastropoda; Gasteropodos; Nudibranquios; Bivalvia; Bivalvos; Polyplacophora; Quitones; Pacífico colombiano; Universidad del Valle

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

John Alexander Salazar Hernandez
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
3015315725
Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+60 2 3212100, ext. 2894
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/edgardo-londono
Erika Montoya-Cadavid
Profesional en Biología Marina
Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives de Andreis” INVEMAR
Calle 25 No. 2-55, Playa Salguero, Santa Marta D.T.C.H.
470006 Santa Marta
Magdalena
CO
(+57) (+5) 4380 808, ext. 252
Jaime Ricardo Cantera Kintz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+57 2 321 21 00, ext. 2147
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/jaime-cantera

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Jaime Ricardo Cantera Kintz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
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+57 2 321 21 00, ext. 2147
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/jaime-cantera
Andres Felipe Carmona Guerra
Laboratorista de apoyo de Biología Marina
Universidad del Valle
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76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
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+57 2 321 21 00, ext. 3232
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/funcionarios
Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
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Valle del Cauca
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¿Quién documentó los metadatos?:

John Alexander Salazar Hernandez
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
3015315725
Edgardo Londoño-Cruz
Profesor
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+60 2 3212100, ext. 2894
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/docentes/edgardo-londono

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Punto de Contacto
Andres Felipe Carmona Guerra
Laboratorista de apoyo de Biología Marina
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+57 2 321 21 00, ext. 3232
https://ciencias.univalle.edu.co/departamento-de-biologia/funcionarios
Curador
Diana Valeria Gallego-Sánchez
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+60 2 3212100, ext. 2894
Curador
Hernán David Flórez Ríos
Profesional en Biología Marina
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+57 2 321 21 00, ext. 2147
Curador
David Felipe Vasquez Salazar
Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+57 2 321 21 00, ext. 2147
Curador
Bellineth Valencia Ramirez
Investigador
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20, Sección Zoologia (Sede Meléndez)
76001 Santiago de Cali
Valle del Cauca
CO
+60 2 321 21 00, ext. 2170

Cobertura geográfica

Este conjunto de datos posee información de los moluscos del Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. En adición, se cuentan con 16 registros del Caribe colombiano, correspondientes al departamento del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina. Además se cuentan con 2 registros externos de Colombia, donde 1 proviene de la Provincia de Santa Elena en Ecuador y el otro proviene de California en Estados Unidos. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta los 100 metros (más profundo).

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [1,582, -79,717], Latitud Máxima Longitud Máxima [12,983, -72,334]

Cobertura taxonómica

Los 2630 registros de moluscos de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 20 órdenes, 102 familias, 221 géneros, 342 especies y 1 subespecie.

Class  Gastropoda (Gasteropodos),  Bivalvia (Bivalvos),  Polyplacophora (Chitones)
Orden  Aplysiida,  Arcida,  Cardiida,  Carditida,  Cephalaspidea,  Chitonida,  Cycloneritida,  Ellobiida,  Lepetellida,  Littorinimorpha,  Lucinida,  Myida,  Nudibranchia,  Ostreida,  Pleurobranchida,  Siphonariida,  Systellommatophora,  Trochida,  Venerida

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1972-03-01 / 2022-09-29

Datos del proyecto

Este recurso contiene información asociada a Moluscos provenientes de diferentes proyectos custodiados en la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle - CRM-UV, los cuales cual han sido depositados por personal de la Universidad, tanto docente como de estudiantes e investigadores, quienes han obtenido los ejemplares en el marco de diferentes actividades académicas y de investigación adelantadas por la universidad.

Título Moluscos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV)
Identificador BID-CA2020-055-NAC
Fuentes de Financiación La Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle hace parte de la Vicerrectoría de Investigación, dependencia que provee los recursos de funcionamiento básicos, complementados con los recursos generados por proyectos a cargo de los docentes encargados de cada colección. En el año 2013, mediante el Convenio de Cooperación No. 13-13-014-242 entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y la Universidad del Valle, se realizó la estandarización y georreferenciación de las localidades asociadas a los registros disponibles hasta ese momento, y se publicaron en el entonces funcional IPT-Valle del Cauca. Recursos adicionales para la documentación, digitalización y publicación de los datos de la colección fueron provistos entre el 2021-07-01 y 2023-06-30 por el Proyecto BID-CA2020-055-NAC "Increasing the accessibility of marine information from Colombians Natural History Collections by mobilizing data, strengthening infrastructure, and training" financiado por la unión Europea a través del Programa BID Caribe (Biodiversity Information for Development Programme) y GBIF (The Global Biodiversity Information Facility). El proyecto fue realizado bajo la coordinación del Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras "José Benito Vives de Andréis" - INVEMAR en conjunto con la Universidad del Magdalena; Universidad de Antioquia; Universidad del Valle; Universidad Tecnológica del Chocó; Universidad el Bosque; la Red Nacional de Museos de Ciencia, Historia Natural y Colecciones Biológicas; el SiB Colombia; SiBM-OBIS Colombia y GBIF. Los moluscos de la colección y sus datos asociados fueron fortalecidos y actualizados durante el desarrollo de dicho proyecto, siendo el actual recurso uno de los productos asociado al entregable "Invertebrados de las colecciones marinas de la Universidad del Valle"
Descripción del área de estudio Pacífico colombiano, abarcando los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño; y en el Caribe colombiano, en el departamento del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina. Adicionalmente hay 2 registros externos a Colombia, uno de la Provincia de Santa Elena (Ecuador) y el otro de California, Estados Unidos. Área marinas y costeras desde los 0 hasta los 100 m de profundidad.
Descripción del diseño Desarrollo de actividades curatoriales y control de calidad de información siguiendo cuatro criterios de trabajo: 1. Criterios curatoriales: verificación física de lotes (existencia, preservación, etiquetas); verificación de datos de los registros biológicos asociados (concordancia de datos de etiqueta e información disponible, complementación de datos). Se asignan y verifican los números de catálogo de los registros, evitando duplicidad. 2. Criterios taxonómicos: validación de nombres científicos hasta el nivel más bajo de identificación del lote. Corroboración del taxón con especialista. Validación de autoridad taxonómica con base en WoRMS - World Register of Marine Species (https://www.marinespecies.org/). 3. Criterio espacial: Validación de la georrefenciación del punto de recolecta del espécimen representado en coordenadas decimales; especificación de la profundidad de obtención en metros; y validación de correspondencia de la localidad indicada. Herramientas: Conversor de coordenadas Canadensys (https://data.canadensys.net/tools/coordinates); Google Earth Pro 2022, versión 7.3.6.9345; Marine Regions Gazetteer 2022 (https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search). Datos previos de la colección tuvieron en cuenta la división político-administrativa del DANE (Colombia) para los departamentos, municipios y centros poblados. 4. Criterios de documentación: estandarización de datos acorde a Darwin Core considerando el uso de vocabularios controlados y la documentación de los Términos de obligatorio diligenciamiento acorde a los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros (Nodo OBiS Colombia y SiB Colombia), y los requeridos de forma general por los sistemas globales de OBiS y GBIF.

Personas asociadas al proyecto:

Métodos de muestreo

Los especímenes de moluscos son colectados manualmente en su mayoría. Luego se les realiza un tratamiento con agua dulce para relajar a los organismos (en caso de ser necesario), donde posteriormente son fijados en alcohol al 70% y son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% y de etiquetas a los lotes que lo requirieron y se les asignó un número de catálogo único a cada uno de los 64 nuevos registros que se ingresaron a la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV).

Área de Estudio Pacífico colombiano y Caribe colombiano
Control de Calidad Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
  2. Asignación de nuevos números de catálogo a cada nuevo registro
  3. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
  4. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
  5. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros
  6. Curaduría física: Para los nuevos registros, se realizó la identificación de los organismos hasta el nivel taxonómico más bajo posible (tarea realizada por la tesista Diana Valeria Gallego-Sánchez, el profesor Edgardo Londoño-Cruz y la bióloga-investigadora Bellineth Valencia Ramirez). Posteriormente, se realizaron etiquetas físicas nuevas con su respectivo número de catálogo (siguiendo el estándar de la Universidad del Valle), incluyendo la información correspondiente de cada nuevo lote. Finalmente, se ubicaron los lotes dentro de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV), organizándolos taxonómicamente por familia.
  7. Curaduría física: Para los registros antiguos, se corroboró el estado del alcohol, del recipiente y de las etiquetas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos se encontraran deteriorados o que no estuvieran presentes en el contenedor, se daban de baja o se reportaban como extraviados respectivamente en la base de datos (CRM-UV).

Datos de la colección

Nombre de la Colección Colección de Referencia (Moluscos) CRM-UV
Identificador de la Colección https://www.gbif.org/es/grscicoll/collection/00fb7b47-e39d-4d97-91ba-285b7903624f
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol,  Secado,  Formalina
Unidades curatoriales Entre 1 y 2.630 Lotes ,  Entre 1 y 2.630 Registros Biologicos

Referencias bibliográficas

  1. Cantera, J. (ed). 2011. Estadíos de vida vulnerable de organismos marinos de Bahía Málaga: Guía para su identificación. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 144 p.
  2. Cantera, J. & Londoño-Cruz, E. (Eds.). 2011. Colombia Pacífico: Una visión sobre su biodiversidad marina. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 420 p. ISBN: 978-958-670-954-5
  3. Keen, A. & McLean, J. 1971. Sea shells of Tropical West America: Marine mollusks from Baja California to Peru. Stanford University Press. 1064 p.
  4. WoRMS (2023). Mollusca. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=51 on 2023-04-13
  5. Universidad del Valle (2014 -). Moluscos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle, 3689 registros, aportados por Lizcano-Sandoval, L.D. (Creador del recurso), Cantera, J. (Curador de la colección, Contacto del recurso) & Carmona, A. (Proveedor de los metadatos, Contacto del recurso), En línea, http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=mollusca_univalle, versión 3 (actualizado el 13/04/2021).

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos f8f6714c-e846-4ce8-819e-7d39839c2bf7
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=mollusca_univalle