ICN - Universidad Nacional de Colombia

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 72.363 registros.

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Raz L, Agudelo H (2023): ICN - Universidad Nacional de Colombia. v2.3. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/v2lnzj

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad Nacional de Colombia. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 79684ec1-01e8-46cc-83cb-cd5bdfb469fe.  Universidad Nacional de Colombia publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras clave

Occurrence; Specimen; Occurrence

Contactos

Cobertura geográfica

La cobertura de este recurso es limitada para Colombia.

Cobertura taxonómica

Los registros biológicos en este conjunto de datos están distribuidos en Plantas y Moluscos

Datos del proyecto

El proyecto implementó plenamente los estándares exigidos por IABIN, como son el DarwinCore para especímenes y el PlinianCore para especies. Si bien el proyecto propuso inicialmente utilizar las extensiones de polinizadores del DarwinCore, estas extensiones están planteadas en términos de porcentajes de ocurrencia y este tipo de información no se encuentra en etiquetas de ejemplares de colección de museo. Por esta razón empleamos la extension de interacción del Darwincore. En esta fase final, se ha cumplido el 100% de las metas establecidas con xxx registros sistematizados. Mediante el establecimiento del protocolo TAPIRLink, la información está disponible en las direcciones www.biovirtual.unal.edu.co para el ICN, y http://icn.unal.edu.co/biologia/LABUN/servicios.htm para la colección LABUN. También se han remitido los datos a los administradores de la red PTN para hacer disponible la información en su sistema.

Personas asociadas al proyecto:

Métodos de muestreo

No hay descripción disponible

Descripción de la metodología paso a paso:

1. Objetivo 1. Sistematizar y digitalizar los datos biológicos de los ejemplares de abejas y murciélagos polinizadores depositados en dos colecciones (ICN, LABUN) de la Universidad Nacional de Colombia. Este objetivo se circunscribió a las características de la aplicación Specify y a los estándares para el intercambio de información biológica del DarwinCore y PlinianCore para especimenes y especies respectivamente. Para lograrlo se adelantaron las siguientes actividades: 1. Definición de campos. Se definieron los campos que se van a sistematizar para cada espécimen así: a. Información General: número consecutivo, usuario que digita la información, y fecha de sistematización. b. Catálogo: Número de Catálogo, código de barras y número de ejemplares. c. Información Taxonómica: Reino, Phyllum, Clase, Orden, Suborden, Familia, Subfamilia, Tribu, Género, Subgénero, epíteto específico, rango infraespecífico, abreviación rango infraespecífico, epíteto infraespecífico, precisión determinación, autor y año, nombre taxonómico completo, tipo, nombre determinador abreviado, apellido determinador abreviado, nombre completo determinador, fecha de determinación y observación de determinación. d. Evento de colección: continente, país, departamento, municipio, lugar citado, localidad, altura máxima, altura mínima, unidad altitud, Lat. (neg.=s), long (neg.=w), Datum, nombre colector abreviado, apellido colector abreviado, nombre completo colector, fecha de colección inicial y final, número de colección, observación de localidad, hábitat y material preservado. e. Atributos: sexo, estado de desarrollo, actividad y castas. f. Relación de polinizadores: tipo de relación, Soporte del registro, Nombre común de la planta, nombre científico, familia de la planta. Los campos de este temático se desarrollaron teniendo en cuenta la Extensión de Interacciones del Darwincore puesto que la extensión de polinizadores presenta todos sus campos en términos de probabilidad (por ejemplo, “nectarremoval probability”) y este tipo de información no suele registrarse en material de museo. En el mejor de los casos hay información en las etiquetas de colección indicando que la abeja o polinizador fue capturado visitando una planta específica. Esta situación fue analizada durante la participación del director de este proyecto en contexto del taller de la red temática de polinizadores IABIN-PTN realizado entre el 20 y 23 de julio de 2008 en la ciudad de Riberao Preto, Brasil. La propuesta que desarrollamos nosotros logra el mejor ajuste posible a los fines de la PTN, los estándares Darwincore y la información disponible en colecciones de organismos polinizadores. Estos campos se encuentran desarrollados en un 100% y su desarrollo hace parte del manual de buenas prácticas. 2. Definición de lenguajes controlados para ingreso de información. Esta actividad se hizo por medio de listas desplegables, tesauros (de hábitos, hábitats, etnias, lenguas), listados (de la división administrativo-política y de las categorías taxonómicas, y de los recolectores y determinadores), lo que reduce el error producto de la digitación y también disminuye el tiempo en sistematizar cada uno de los registros. De esta manera, la información es uniforme y es posible compartirla a través de redes. Estos lenguajes se desarrollaron en su totalidad (100%.) 3. Documentación de los datos de polinizadores. La información de los polinizadores se desarrolló en un formato Excel mientras se recibe la nueva versión de Specify (6.0) que se estima aparecerá en septiembre. Esta medida se tomó pues el equipo que desarrolla Specify notificó cambios en la estructura del programa que serían más fáciles de cubrir desde Excel que desde el Specify 5.2.3. Como medida de prueba de la calidad y seguimiento de parámetros de las plantillas Excel, se hizo exitosamente un montaje piloto en Specify 5.2.3. En esta etapa contamos con el apoyo del ingeniero de sistemas. Se ha adelantado tanto el trabajo de conformación de los Archivos de Autoridad Taxonómica (en adelante AAT) como la documentación Plinian Core. Los AAT son indispensables para la elaboración del árbol taxonómico que requiere Specify para cargar los datos en el sistema de búsqueda. Una fuente primordial para el desarrollo del listado oficial de nombres es el catálogo de abejas neotropicales del proyecto CRIA (http://moure.cria.org.br/). El AAT desarrollado cuenta con 301 nombres de abejas de las familias Apidae, Andrenidae, Colletidae, Megachilidae y Antophoridae cubriendo la totalidad de nombres con representantes depositados en las dos colecciones. En el caso de los murciélagos de la familia Phyllostomidae tenemos 58 nombres desarrollados de los 161 existentes en la colección ICN. A la fecha se han sistematizado 13.050 ejemplares lo que corresponde a un 100% del total mínimo comprometido en el proyecto. Los logros por colección se pueden discriminar así: Colección LABUN: se han digitalizado 8.722 especimenes. Colección ICN Phyllostomidae: se han digitalizado 1.479 especimenes. Colección ICN Abejas: se han digitalizado 3.000 especimenes.
2. Objetivo 2. Hacer disponibles los datos de polinizadores depositados en las colecciones ICN y LABUN a través de las páginas web del ICN, LABUN y la red del IABIN siguiendo estándares de lenguajes controlados para bases de datos biológicos de acceso libre El protocolo TAPIRLink (www.tdwg.org/dav/subgroups/tapir/1.0/docs/ TAPIRSpecification_2008-02-07.html) se utilizó para convertir la información sistematizada en un modo interoperable con las bases de datos donde presentamos la información de polinizadores. Los datos hasta ahora sistematizados se encuentran disponibles en las páginas web www.biovirtual.unal.edu.co para el ICN, http://icn.unal.edu.co/biologia/LABUN/servicios.htm para la colección LABUN. También se han remitido los datos a los administradores de la red PTN para hacerlos disponibles en sus sistemas. La documentación de metadatos se realizará durante la fase final del proyecto una vez se haya consolidado la información. El Manual de Mejores Prácticas se tiene plenamente desarrollado para la documentación pero deseamos entregarlo en la fase final del proyecto para así recoger las experiencias en la sistematización.

Datos de la colección

Metadatos adicionales