ICN - Universidad Nacional de Colombia

Data Records

The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 72,363 records.

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Raz L, Agudelo H (2023): ICN - Universidad Nacional de Colombia. v2.3. Universidad Nacional de Colombia. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/v2lnzj

Rights

Researchers should respect the following rights statement:

The publisher and rights holder of this work is Universidad Nacional de Colombia. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 79684ec1-01e8-46cc-83cb-cd5bdfb469fe.  Universidad Nacional de Colombia publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.

Keywords

Occurrence; Specimen; Occurrence

Contacts

Geographic Coverage

La cobertura de este recurso es limitada para Colombia.

Taxonomic Coverage

Los registros biológicos en este conjunto de datos están distribuidos en Plantas y Moluscos

Project Data

El proyecto implementó plenamente los estándares exigidos por IABIN, como son el DarwinCore para especímenes y el PlinianCore para especies. Si bien el proyecto propuso inicialmente utilizar las extensiones de polinizadores del DarwinCore, estas extensiones están planteadas en términos de porcentajes de ocurrencia y este tipo de información no se encuentra en etiquetas de ejemplares de colección de museo. Por esta razón empleamos la extension de interacción del Darwincore. En esta fase final, se ha cumplido el 100% de las metas establecidas con xxx registros sistematizados. Mediante el establecimiento del protocolo TAPIRLink, la información está disponible en las direcciones www.biovirtual.unal.edu.co para el ICN, y http://icn.unal.edu.co/biologia/LABUN/servicios.htm para la colección LABUN. También se han remitido los datos a los administradores de la red PTN para hacer disponible la información en su sistema.

The personnel involved in the project:

Sampling Methods

No Description available

Method step description:

1. Objetivo 1. Sistematizar y digitalizar los datos biológicos de los ejemplares de abejas y murciélagos polinizadores depositados en dos colecciones (ICN, LABUN) de la Universidad Nacional de Colombia. Este objetivo se circunscribió a las características de la aplicación Specify y a los estándares para el intercambio de información biológica del DarwinCore y PlinianCore para especimenes y especies respectivamente. Para lograrlo se adelantaron las siguientes actividades: 1. Definición de campos. Se definieron los campos que se van a sistematizar para cada espécimen así: a. Información General: número consecutivo, usuario que digita la información, y fecha de sistematización. b. Catálogo: Número de Catálogo, código de barras y número de ejemplares. c. Información Taxonómica: Reino, Phyllum, Clase, Orden, Suborden, Familia, Subfamilia, Tribu, Género, Subgénero, epíteto específico, rango infraespecífico, abreviación rango infraespecífico, epíteto infraespecífico, precisión determinación, autor y año, nombre taxonómico completo, tipo, nombre determinador abreviado, apellido determinador abreviado, nombre completo determinador, fecha de determinación y observación de determinación. d. Evento de colección: continente, país, departamento, municipio, lugar citado, localidad, altura máxima, altura mínima, unidad altitud, Lat. (neg.=s), long (neg.=w), Datum, nombre colector abreviado, apellido colector abreviado, nombre completo colector, fecha de colección inicial y final, número de colección, observación de localidad, hábitat y material preservado. e. Atributos: sexo, estado de desarrollo, actividad y castas. f. Relación de polinizadores: tipo de relación, Soporte del registro, Nombre común de la planta, nombre científico, familia de la planta. Los campos de este temático se desarrollaron teniendo en cuenta la Extensión de Interacciones del Darwincore puesto que la extensión de polinizadores presenta todos sus campos en términos de probabilidad (por ejemplo, “nectarremoval probability”) y este tipo de información no suele registrarse en material de museo. En el mejor de los casos hay información en las etiquetas de colección indicando que la abeja o polinizador fue capturado visitando una planta específica. Esta situación fue analizada durante la participación del director de este proyecto en contexto del taller de la red temática de polinizadores IABIN-PTN realizado entre el 20 y 23 de julio de 2008 en la ciudad de Riberao Preto, Brasil. La propuesta que desarrollamos nosotros logra el mejor ajuste posible a los fines de la PTN, los estándares Darwincore y la información disponible en colecciones de organismos polinizadores. Estos campos se encuentran desarrollados en un 100% y su desarrollo hace parte del manual de buenas prácticas. 2. Definición de lenguajes controlados para ingreso de información. Esta actividad se hizo por medio de listas desplegables, tesauros (de hábitos, hábitats, etnias, lenguas), listados (de la división administrativo-política y de las categorías taxonómicas, y de los recolectores y determinadores), lo que reduce el error producto de la digitación y también disminuye el tiempo en sistematizar cada uno de los registros. De esta manera, la información es uniforme y es posible compartirla a través de redes. Estos lenguajes se desarrollaron en su totalidad (100%.) 3. Documentación de los datos de polinizadores. La información de los polinizadores se desarrolló en un formato Excel mientras se recibe la nueva versión de Specify (6.0) que se estima aparecerá en septiembre. Esta medida se tomó pues el equipo que desarrolla Specify notificó cambios en la estructura del programa que serían más fáciles de cubrir desde Excel que desde el Specify 5.2.3. Como medida de prueba de la calidad y seguimiento de parámetros de las plantillas Excel, se hizo exitosamente un montaje piloto en Specify 5.2.3. En esta etapa contamos con el apoyo del ingeniero de sistemas. Se ha adelantado tanto el trabajo de conformación de los Archivos de Autoridad Taxonómica (en adelante AAT) como la documentación Plinian Core. Los AAT son indispensables para la elaboración del árbol taxonómico que requiere Specify para cargar los datos en el sistema de búsqueda. Una fuente primordial para el desarrollo del listado oficial de nombres es el catálogo de abejas neotropicales del proyecto CRIA (http://moure.cria.org.br/). El AAT desarrollado cuenta con 301 nombres de abejas de las familias Apidae, Andrenidae, Colletidae, Megachilidae y Antophoridae cubriendo la totalidad de nombres con representantes depositados en las dos colecciones. En el caso de los murciélagos de la familia Phyllostomidae tenemos 58 nombres desarrollados de los 161 existentes en la colección ICN. A la fecha se han sistematizado 13.050 ejemplares lo que corresponde a un 100% del total mínimo comprometido en el proyecto. Los logros por colección se pueden discriminar así: Colección LABUN: se han digitalizado 8.722 especimenes. Colección ICN Phyllostomidae: se han digitalizado 1.479 especimenes. Colección ICN Abejas: se han digitalizado 3.000 especimenes.
2. Objetivo 2. Hacer disponibles los datos de polinizadores depositados en las colecciones ICN y LABUN a través de las páginas web del ICN, LABUN y la red del IABIN siguiendo estándares de lenguajes controlados para bases de datos biológicos de acceso libre El protocolo TAPIRLink (www.tdwg.org/dav/subgroups/tapir/1.0/docs/ TAPIRSpecification_2008-02-07.html) se utilizó para convertir la información sistematizada en un modo interoperable con las bases de datos donde presentamos la información de polinizadores. Los datos hasta ahora sistematizados se encuentran disponibles en las páginas web www.biovirtual.unal.edu.co para el ICN, http://icn.unal.edu.co/biologia/LABUN/servicios.htm para la colección LABUN. También se han remitido los datos a los administradores de la red PTN para hacerlos disponibles en sus sistemas. La documentación de metadatos se realizará durante la fase final del proyecto una vez se haya consolidado la información. El Manual de Mejores Prácticas se tiene plenamente desarrollado para la documentación pero deseamos entregarlo en la fase final del proyecto para así recoger las experiencias en la sistematización.

Collection Data

Additional Metadata