説明
Este conjunto de datos contiene los registros biológicos y medidas de rasgos funcionales asociados a las imágenes digitales de alta resolución de los ejemplares del herbario virtual bosques secos de Colombia. Este ecosistema se caracteriza por presentar una fuerte estacionalidad de lluvias y un período de tres a ocho meses de sequía. Se encuentra en las zonas bajas de la costa Caribe, los valles interandinos de los ríos Cauca y Magdalena, la región del Chicamocha en Santander y Norte de Santander, el cañón del río Patía en los departamentos de Cauca y Nariño, y los Llanos. Se presentan 2000 registros de bosque seco del herbario ICESI, los cuales fueron seleccionados con base al sitio de colecta; sólo los registros que provenían de localidades donde hay bosque seco fueron incluidos. Éstos fueron ubicados en la colección, codificados, sistematizados y digitalizados con el fin de publicar las imágenes en el recurso virtual "Herbario virtual Bosques Secos de Colombia" en Flickr. Cada registro tiene una dirección electrónica que permite acceder a la imagen del ejemplar en alta resolución.
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、2,000 レコードが含まれています。
拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。
- Occurrence (コア)
- MeasurementOrFacts
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ダウンロード
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バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Universidad ICESI & Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2014). Herbario virtual Bosques Secos de Colombia- Sección herbario ICESI, 2000 registros, Aportados por: Vargas, W. (Contacto del recurso), En línea: http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=herbario-bs-icesi, versión 1.0 (actualizado el 04/03/2015)
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Universidad Icesi。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 2cc1e048-96db-40d2-b9b7-54d0d6975d54が割り当てられています。 Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているUniversidad Icesi が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
bosque seco tropical; ejemplar de herbario; colección botánica; herbario virtual; Plantae; ICESI; Specimen; Occurrence; VALLE_DEL_CAUCA; Occurrence
外部データ
リソース データは他の形式で入手可能です。
| Herbario ICESI | https://www.flickr.com/photos/109886592@N04/ NA .jpg |
|---|---|
| Herbario virtual Bosques Secos de Colombia | https://www.flickr.com/groups/herbario_virtual_bosques_secos_de_colombia/ NA .jpg |
連絡先
リソースを作成した人:
リソースに関する質問に答えることができる人:
メタデータを記載した人:
他に、リソースに関連付けられていた人:
地理的範囲
El conjunto de datos contiene información de los ejemplares botánicos de bosque seco tropical de Colombia, con énfasis es localidades del Caribe Colombiano, los valles geográficos de los ríos Magdalena, el valle del cañón del río Patía. Abarca los departamentos de Antioquia, Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Boyacá, Caldas, Caquetá, Cauca, Cesar, Cundinamarca, Huila, Nariño, Putumayo, Quindio, Risaralda, Santander, Tolima y Valle del Cauca.
| 座標（緯度経度） | 南 西 [-0.95, -81.384], 北 東 [13.34, -73.11] |
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生物分類学的範囲
Por medio de la búsqueda de especímenes pertenecientes a Bosque Seco Tropical de Colombia, depositados en el herbario ICESI, de la Universidad ICESI, se consolidaron 2000 registros de ejemplares botánicos correspondientes a 154 familias, 607 géneros y 1077 especies. Se utilizó el código APG III como sistema de clasificación de las especies y las actualizaciones nomenclaturales se realizaron con base en los datos proporcionados en los recursos The Plant List (http://www.theplantlist.org/), Tropicos (http://www.tropicos.org/) y IPNI (http://www.ipni.org/)
| Family | Anacardiaceae, Amaranthaceae, Acanthaceae, Achariaceae, Achatocarpaceae, Actinidiaceae, Adoxaceae, Aizoaceae, Alismataceae, Amaranthaceae, Amaryllidaceae, Anacardiaceae, Annonaceae, Apiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Arecaceae, Aristolochiaceae, Asclepiadaceae, Asparagaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Balanophoraceae, Basellaceae, Bignoniaceae, Bixaceae, Blechnaceae, Bombacaceae, Boraginaceae, Brassicaceae, Bromeliaceae, Burseraceae, Cactaceae, Calophyllaceae, Campanulaceae, Cannabaceae, Capparaceae, Caprifoliaceae, Caricaceae, Cecropiceae, Celastraceae, Chloranthaceae, Chrysobalanaceae, Cleomaceae, Clethraceae, Clusiaceae, Combretaceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Costaceae, Cucurbitaceae, Cupressaceae, Cyclanthaceae, Cyperaceae, Davalliaceae, Dilleniaceae, Dryopteridaceae, Elaeocarpaceae, Equisetaceae, Ericaceae, Eriocaulaceae, Erythroxylaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Gesneriaceae, Gleicheniaceae, Heliconiaceae, Hydrophyllaceae, Hypericaceae, Iridaceae, Juncaceae, Lacistemataceae, Lamiaceae, Lauraceae, Lecythidaceae, Loasaceae, Loganiaceae, Loranthaceae, Lycopodiaceae, Lythraceae, Malpighiaceae, Malvaceae, Marantaceae, Marattiaceae, Marcgraviaceae, Melastomataceae, Meliaceae, Menispermaceae, Monimiaceae, Moraceae, Moringaceae, Muntingiaceae, Myrtaceae, Nyctaginaceae, Nymphaeaceae, Olacaceae, Onagraceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Orobanchaceae, Oxalidaceae, Pandanaceae, Papaveraceae, Passifloraceae, Phyllanthaceae, Phytolaccaceae, Picramniaceae, Pinaceae, Piperaceae, Plantaginaceae, Plumbaginaceae, Poaceae, Polygalaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Pontederiaceae, Primulaceae, Proteaceae, Pteridaceae, Ranunculaceae, Rhamnaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Salicaceae, Santalaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Schlegeliaceae, Simaroubaceae, Siparunaceae, Smilacaceae, Solanaceae, Staphyleaceae, Sterculiaceae, Talinaceae, Tapisciaceae, Thelypteridaceae, Thymelaeaceae, Tiliaceae, Turneraceae, Typhaceae, Urticaceae, Verbenaceae, Violaceae, Viscaceae, Vitaceae, Vochysiaceae, Xyridaceae, Zingiberaceae, Zygophyllaceae |
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時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 1992-10-01 / 2014-11-30 |
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プロジェクトデータ
説明がありません
| タイトル | Cerrando la brecha entre parcelas permanentes y la conservación de plantas en Colombia |
|---|---|
| ファンデイング | Fundación JRS Biodiversity. Convenio de cooperación 13-12-117-030CE entre el Instotuto Humboldt y la Universidad ICESI. |
| Study Area Description | Este conjunto de datos contiene registros biológicos y medidas de rasgos funcionales asociados a imágenes digitales de alta resolución de material de herbario de plantas de bosque seco tropical de Colombia. |
| 研究の意図、目的、背景など（デザイン） | El proyecto “Cerrando la brecha entre parcelas permanentes y la conservación de plantas en Colombia”, financiado por la fundación JRS biodiversity (http://jrsbiodiversity.org/grant/instituto-de-investigacion-de-recursos-biologicos-alexander-von-humboldt/), tiene como objetivo digitalizar el material de herbario de bosque seco de cinco herbarios del país: Universidad ICESI, Universidad de Córdoba, jardín botánico de Tuluá, Universidad del Tolima y herbario FMB del Instituto de investigación Alexander von Humboldt (IAvH). Este material hace parte de las colecciones de herbarios pero también ha sido recolectado en campo a través del establecimiento de parcelas permanentes de bosque seco en las diferentes regiones del país. El propósito de este proyecto es poner a disposición de toda la comunidad en general la información sobre la especies vegetales y sus rasgos funcionales de bosque seco para promover la investigación y conservación de este ecosistema en Colombia. En esta sección se encuentran los datos digitalizados del herbario ICESI de la Universidad ICESI. |
プロジェクトに携わる要員:
収集方法
Los datos contenidos en este recurso pertenecen a ejemplares de bosque seco tropical del herbario ICESI que fueron digitalizados y publicados en el recurso electrónico "Herbario ICESI" y compartidos en el "Herbario virtual Bosques Secos de Colombia", a través de FlickR. Los exicados fueron seleccionados por la localidad en la que fueron colectados (la cual debe pertenecer a bosque seco tropical). Estos ejemplares se seleccionaron en la base de datos del herbario, posteriormente se ubicaron en la colección y fueron extraídos de la misma para transportarlos al laboratorio de fotografía.
| Study Extent | Ejemplares de bosque seco del herbario ICESI de la Universidad ICESI, ubicado en ciudad de Cali (Valle del Cauca). |
|---|---|
| Quality Control | En cada una de las actividades desarrolladas durante la digitalización de especímenes de herbario se realiza control de calidad. El control de calidad usualmente se efectúa mediante la selección y el examen de las imágenes en intervalos regulares, las imágenes seleccionas son evaluadas en el enfoque, la exposición correcta, manchas, desajustes entre los nombres de los archivos, valor del código de barras o numero de identificación y otros signos evidentes de error al inspeccionar. Este control se realiza de la siguiente manera: 1. Se realiza el curado y actualización nomenclatural de los ejemplares seleccionados para la digitalización mediante el uso de bases de datos virtuales como The Plant List, trópicos, El catálogo de la vida, IPNI, entre otros 2. El control de calidad de las imágenes se realiza en un solo espacio y un solo computador con dos monitores, preferiblemente calibrados, para asegurar una visualización óptima. Este control debe llevarse a cabo aproximadamente cada 20 imágenes. 3. Los archivos de imagen son visualizados utilizando el software de edición de imágenes de la cámara (Digital Photo Professional). 4. Las imágenes se magnifican a 100% para verificar que contengan todos los elementos necesarios (reglilla, tarjeta de color, etiqueta completa), la calidad requerida, confirmar el enfoque, la exposición correcta, manchas o rayas, desajustes entre los nombres de los archivos y valor del código de barras del espécimen. Ajuste de vocabularios controlados en: Elementos geográficos: country, stateProvince y county; |
Method step description:
- La digitalización de especímenes se refiere a la captura fotográfica y el registro de información de especímenes o colecciones. Típicamente los especímenes incluyen etiquetas y notas de campo que contienen información sobre el evento de colecta (Ejemplo: Nombre del colector, fechas, localidad, etc.) determinaciones taxonómicas y números de catálogo o identificadores. La digitalización de la información de las etiquetas incluye captura del texto como caracteres, y almacenamiento de esta información en bases de datos, igualmente la digitalización también incluye la captura de imágenes digitales. El proceso de digitalización incluye las siguientes tareas: 1. Curado y pre-digitalización 2. Captura de imágenes (fotografía de especímenes y etiquetas) 3. Procesamiento de las imágenes 4. Captura electrónica de los datos 1. CURADO Y PRE-DIGITALIZACIÓN Constituye el primer paso en la digitalización de especímenes y brinda la oportunidad de realizar las siguientes actividades: -Inspeccionar y restaurar los especímenes dañados y evaluar la salud de la colección. -Tratar las pestes. -Descubrir especímenes perdidos pertenecientes a otras instituciones o tipos no conocidos en la colección. -Actualizar las determinaciones taxonómicas. -Reorganizar los contenidos de los gabinetes o compactadores. -Seleccionar los ejemplares para la digitalización. -Adjuntar un identificador único (código de barras) a cada espécimen. 2. CAPTURA DE IMÁGENES (fotografía de especímenes y etiquetas) La captura de imágenes consiste en fotografiar los ejemplares codificados previamente y descargar las imágenes en el computador destinado para la edición y marcaje. Durante el proceso de fotografía de una familia se debe llevar un registro detallado de las diferentes actividades realizadas. A continuación se explican los pasos y se dan las instrucciones necesarias para el proceso de Captura de imagen. La captura de imágenes generalmente requiere: -Pre-configuración e iniciación de los equipos. -Organización de los especímenes que serán fotografiados. -Toma de la imagen. -Descarga y almacenamiento de la imagen. -Captura del código de barras. -Mover el espécimen a una nueva estación o incluirlo nuevamente en la colección. 3. PROCESAMIENTO DE LAS IMÁGENES El procesamiento de las imágenes incluye todas las tareas o grupo de tareas desarrolladas sobre una imagen, seis tareas son las más comunes: 1. Control de calidad. 2. Procesamiento de la imagen. 3. Conversión de archivos. 4. Copia de Seguridad. Durante el procesamiento de la imagen se debe llevar un registro detallado de las diferentes actividades realizadas. Para este proceso se parte de la fotografía descargada en rutas preestablecidas. 4. CAPTURA ELECTRÓNICA DE LOS DATOS La captura electrónica de datos involucra la extracción de datos de las etiquetas y la digitalización de estos datos en una base de datos electrónica. Según este protocolo la captura de datos debe ser después de la captura de la imagen. En las colecciones donde una gran cantidad especímenes son fotografiados, los datos son tomados directamente de las imágenes, reduciendo las posibilidades de daño en los múltiples viajes de los especímenes. Existen muchas formas de capturar la información de las etiquetas de herbario, pero la más común es mediante la digitalización directa en una plantilla estándar, como las ofrecidas por el formato Darwin Core. En nuestro proyecto “Cerrando la brecha entre parcelas permanentes y la conservación de plantas en Colombia” trabajaremos con las plantillas DwC para la documentación de registros biológicos. Esta plantilla se encuentra adjunta a este documento. El estándar Darwin Core (Versión 2011-10-26) está conformado por 175 elementos, de los cuáles solo cinco son obligatorios (ID del registro biológico, base del registro, código de la institución, código de la colección, número de catálogo). Nosotros trabajaremos con elementos comunes y elementos de extensión que incluirán información sobre las imágenes y los rasgos funcionales tomados de los especímenes de herbario.
コレクションデータ
| コレクション名 | Herbario ICESI |
|---|---|
| コレクション識別子 | Registro nacional de colecciones: 193 |
| Parent Collection Identifier | ICESI |
| 標本保存方法 | Dried and pressed |
|---|
| Curatorialユニット | 範囲 1 ～ 700 Exicado |
|---|
書誌情報の引用
- Missouri Botanical Garden. Trópicos, 49163 registros. En Línea, http://www.tropicos.org/Home.aspx, publicado el 13/01/2014
- Universidad Nacional (2004). Nombres comunes de las plantas de Colombia, 18600 registros, apoyado por Bernal, R., (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Galeano, G., (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Rodríguez, A., (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Sarmiento, H. , (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Gutiérrez, M., (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido). En línea, http://www.biovirtual.unal.edu.co/nombrescomunes/
- Universidad Nacional de Bogotá (2004). Biovirtual, 527000 registros. En línea, http://www.biovirtual.unal.edu.co/ICN/?controlador=Forms&accion=quickFormScientific&group=1&searchType=scientific. Continuamente actualizado.
- Gentry, A. H. (1993). A Field Guide to the Families and Genera of Woody Plants of Northwest South America (Colombia, Ecuador, Perú). Washington: Conservation International
- Judd, W. S., Campbell, C. S., Kellogg, E. A., Stevens, P. F., & Donoghue, M. J. (2008). Plant Systematics A Phylogenetic Approach (Tercera ed.). Sunderland: Sinauer Associates, Inc.
- Vargas, W. (2002). Guía ilustrada de plantas de las montañas del Quindío y los Andes Centrales. Manizales: Universidad de Caldas, Centro Editorial.
- The Field Museum (1999. Neotropical Herbarium Specimens, 27000 registros, aportados por Foster, Robin, (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Hensold, Nancy, (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido), Vriesendorp, Corine, (Publicador, Proveedor de los metadatos, Proveedor de Contenido). En línea, http://fm1.fieldmuseum.org/vrrc/index.php
追加のメタデータ
Los ejemplares digitalizados a los cuales hace referencia este recurso están en linea en: https://www.flickr.com/photos/109886592@N04/ Adicional a esto, el Herbario virtual ICESI hace parte del grupo "Herbario Virtual Bosque Seco de Colombia", el cual se puede consultar en el siguiente enlace: https://www.flickr.com/groups/herbario_virtual_bosques_secos_de_colombia/
| 目的 | El proyecto “Cerrando la brecha entre parcelas permanentes y la conservación de plantas en Colombia”, financiado por la fundación JRS biodiversity (http://www.jrsbdf.org/v3/home.asp), tiene como objetivo digitalizar el material de herbario de bosque seco. El propósito de este proyecto es poner a disposición de todos la información sobre las especies vegetales de bosque seco y sus rasgos funcionales para promover la investigación y conservación de este ecosistema en Colombia. |
|---|---|
| 代替識別子 | doi:10.15472/ahcjrq |
| 2cc1e048-96db-40d2-b9b7-54d0d6975d54 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=herbario-bs-icesi |