Bacterias aisladas de líquenes en el PNN Chingaza

Última versión Publicado por Corporación CorpoGen en Aug 6, 2019 Corporación CorpoGen

Se aislaron microorganismos a partir de muestras de líquenes sembrando en diversos medios de cultivo. Estos aislamientos se seleccionaron según su taxonomía y, en algunos casos, por su actividad antimicrobiana. La identificación se hizo por secuenciación parcial del gen 16S rRNA.

Registros

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Versiones

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Zambrano M M, Sierra M A (2019): Bacterias aisladas de líquenes en el PNN Chingaza. v1.1. Corporación CorpoGen. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/vwolz3

Derechos

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Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: e158f18a-50b3-498b-8885-39a4d8193705.  Corporación CorpoGen publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

Diversidad bacteriana Líquenes Actividad antimicrobiana; Occurrence; PERMISO_COLECTA

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación Corpogen
María Alejandra Sierra
Investigadora
Corporación Corpogen

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org

¿Quién documentó los metadatos?:

Maria Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación Corpogen Carrera 4 #20-41 Bogotá DC CO

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Investigador Principal
María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org
Originador
María Alejandra Sierra
Investigadora
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org

Cobertura Geográfica

Muestras del PNN Chingaza

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [4.474, -73.789], Latitud Máxima Longitud Máxima [4.709, -73.569]

Cobertura Taxonómica

Bacterias, identificadas a nivel de género.

Orden  Corynebacteriales,  Corynebacteriales,  Micrococcales,  Pseudomonadales,  Pseudonocardiales,  Rhizobiales,  Streptomycetales,  Streptosporangiales,  Xanthomonadales

Cobertura Temporal

Fecha Inicial 2018-03-05

Datos del Proyecto

Este proyecto conjunto entre Corpogen, la Pontificia Universidad Javeriana y la Universidad de los Andes identificó microorganismos mediante cultivo de muestras de aguas, suelos y líquenes para fomentar el conocimiento y consolidar la conservación de nuestra diversidad microbiana. Para esto se realizó lo siguiente: 1) se hicieron mustreos en diversos ambientes, como páramos y agunas manantiales termales y salinas; 2) se recuperaron grupos de microorganismos poco representados en las colecciones de las instituciones participantes y que resultan de interés por su potencial ecológico, biotecnológico y diversidad funcional, con un enfoque hacia recuperación de hongos, actinobacterias y microorganismos halotolerantes, halófilos y termófilos; 3) se caracterizó la diversidad microbiana mediante ensayos fenotípicos y secuenciación metagenómica y genómica de algunos aislamientos; y 4) se depositan los microorganismos aislados en las colecciones biológicas, con el interés particular de consolidar la colección de la Universidad Javeriana.

Título Identificación, valoración y conservación de diversidad microbiana de ambientes extremos y endémicos seleccionados de Colombia
Fuentes de Financiación Colciencias, las entidades participantes (Corpogen, la Pontificia Universidad Javeriana y Universidad de los Andes)
Descripción del Área de Estudio Se recolectaron muestras en manantiales en Boyacá y en los Parques Nacionales Naturales Chingaza y los Nevados. Las muestras se procesaron en Bogotá.
Descripción del Diseño La motivación del trabajo es contribuir al conocimiento básico sobre diversidad microbiana en el país, como complemento a las expediciones biológicas enmarcadas dentro del trabajo de Colombia Bio. En el país aun se desconoce mucho sobre la diversidad microbiana y su potencial como fuente de posibles nuevos productos y procesos biológicos. Este trabajo se construye sobre fortalezas de los grupos de investigación participantes para identificar y conservar grupos microbianos de interés por su novedad biológica y su poca representatividad en colecciones biológicas del país: hongos, actinobacterias y microorganismos halotolerantes, halófilos y termófilos Los objetivos del proyecto son: 1. Aislar microorganismos de ambientes extremos y endémicos seleccionados, poco representados en colecciones biológicas a nivel nacional, aplicando diferentes metodologías. 2. Caracterizar la biodiversidad microbiana de ambientes extremos y endémicos seleccionados 3. Consolidar la colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana como la colección de referencia en Colombia de microorganismos aislados de ambientes extremos en un esfuerzo colaborativo interinstitucional e internacional.

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
María Mercedes Zambrano
Autor
María Alejandra Sierra

Métodos de Muestreo

Se tomaron muestras de líquenes en divesos puntos que se transportaron al laboratorio para sembrar en medios de cultivo para bacterias.

Área de Estudio Parque Nacional Natural Chingaza. Se hizo muestreo puntual en marzo 2018.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Las muestras de líquenes se sembraron sobre medios de cultivo para enriquecimiento de Actinobacterias. Estas bacterias se purificaron y analizaron para actividad antimicrobiana.
  2. Se aisló el ADN genómico para secuenciacón parcial del gen 16S rRNA para identifcación taxonómica que se hizo comparando con la base de datos del NCBI.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Cepario Corpogen
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones Biológicas:140
Identificador de la Colección Parental CG
Métodos de preservación de los ejemplares Congelado

Metadatos Adicionales

Propósito Estos datos representan microorganismos provenientes de líquenes en el Parque Chingaza que se guardan en la colección de Corpogen por su taxonomía y posible actividad antimicrobiana.
Identificadores Alternativos 10.15472/vwolz3
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cepas_pnnchingaza_corpogen
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cepas_pnnchingaza_corpogen