Bacterias aisladas de líquenes en el PNN Chingaza

Latest version published by Corporación CorpoGen on Aug 6, 2019 Corporación CorpoGen

Se aislaron microorganismos a partir de muestras de líquenes sembrando en diversos medios de cultivo. Estos aislamientos se seleccionaron según su taxonomía y, en algunos casos, por su actividad antimicrobiana. La identificación se hizo por secuenciación parcial del gen 16S rRNA.

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How to cite

Researchers should cite this work as follows:

Zambrano M M, Sierra M A (2019): Bacterias aisladas de líquenes en el PNN Chingaza. v1.1. Corporación CorpoGen. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/vwolz3

Rights

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The publisher and rights holder of this work is Corporación CorpoGen. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: e158f18a-50b3-498b-8885-39a4d8193705.  Corporación CorpoGen publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.

Keywords

Diversidad bacteriana Líquenes Actividad antimicrobiana; Occurrence; PERMISO_COLECTA

Contacts

Who created the resource:

María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación Corpogen
María Alejandra Sierra
Investigadora
Corporación Corpogen

Who can answer questions about the resource:

María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org

Who filled in the metadata:

Maria Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación Corpogen Carrera 4 #20-41 Bogotá DC CO

Who else was associated with the resource:

Principal Investigator
María Mercedes Zambrano
Directora Científica
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org
Originator
María Alejandra Sierra
Investigadora
Corporación CorpoGen Carrera 4 # 20-41 110311 Bogotá DC CO
http://www.corpogen.org

Geographic Coverage

Muestras del PNN Chingaza

Bounding Coordinates South West [4.474, -73.789], North East [4.709, -73.569]

Taxonomic Coverage

Bacterias, identificadas a nivel de género.

Order  Corynebacteriales,  Corynebacteriales,  Micrococcales,  Pseudomonadales,  Pseudonocardiales,  Rhizobiales,  Streptomycetales,  Streptosporangiales,  Xanthomonadales

Temporal Coverage

Start Date 2018-03-05

Project Data

Este proyecto conjunto entre Corpogen, la Pontificia Universidad Javeriana y la Universidad de los Andes identificó microorganismos mediante cultivo de muestras de aguas, suelos y líquenes para fomentar el conocimiento y consolidar la conservación de nuestra diversidad microbiana. Para esto se realizó lo siguiente: 1) se hicieron mustreos en diversos ambientes, como páramos y agunas manantiales termales y salinas; 2) se recuperaron grupos de microorganismos poco representados en las colecciones de las instituciones participantes y que resultan de interés por su potencial ecológico, biotecnológico y diversidad funcional, con un enfoque hacia recuperación de hongos, actinobacterias y microorganismos halotolerantes, halófilos y termófilos; 3) se caracterizó la diversidad microbiana mediante ensayos fenotípicos y secuenciación metagenómica y genómica de algunos aislamientos; y 4) se depositan los microorganismos aislados en las colecciones biológicas, con el interés particular de consolidar la colección de la Universidad Javeriana.

Title Identificación, valoración y conservación de diversidad microbiana de ambientes extremos y endémicos seleccionados de Colombia
Funding Colciencias, las entidades participantes (Corpogen, la Pontificia Universidad Javeriana y Universidad de los Andes)
Study Area Description Se recolectaron muestras en manantiales en Boyacá y en los Parques Nacionales Naturales Chingaza y los Nevados. Las muestras se procesaron en Bogotá.
Design Description La motivación del trabajo es contribuir al conocimiento básico sobre diversidad microbiana en el país, como complemento a las expediciones biológicas enmarcadas dentro del trabajo de Colombia Bio. En el país aun se desconoce mucho sobre la diversidad microbiana y su potencial como fuente de posibles nuevos productos y procesos biológicos. Este trabajo se construye sobre fortalezas de los grupos de investigación participantes para identificar y conservar grupos microbianos de interés por su novedad biológica y su poca representatividad en colecciones biológicas del país: hongos, actinobacterias y microorganismos halotolerantes, halófilos y termófilos Los objetivos del proyecto son: 1. Aislar microorganismos de ambientes extremos y endémicos seleccionados, poco representados en colecciones biológicas a nivel nacional, aplicando diferentes metodologías. 2. Caracterizar la biodiversidad microbiana de ambientes extremos y endémicos seleccionados 3. Consolidar la colección de microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana como la colección de referencia en Colombia de microorganismos aislados de ambientes extremos en un esfuerzo colaborativo interinstitucional e internacional.

The personnel involved in the project:

Principal Investigator
María Mercedes Zambrano
Author
María Alejandra Sierra

Sampling Methods

Se tomaron muestras de líquenes en divesos puntos que se transportaron al laboratorio para sembrar en medios de cultivo para bacterias.

Study Extent Parque Nacional Natural Chingaza. Se hizo muestreo puntual en marzo 2018.

Method step description:

  1. Las muestras de líquenes se sembraron sobre medios de cultivo para enriquecimiento de Actinobacterias. Estas bacterias se purificaron y analizaron para actividad antimicrobiana.
  2. Se aisló el ADN genómico para secuenciacón parcial del gen 16S rRNA para identifcación taxonómica que se hizo comparando con la base de datos del NCBI.

Collection Data

Collection Name Cepario Corpogen
Collection Identifier Registro Nacional de Colecciones Biológicas:140
Parent Collection Identifier CG
Specimen preservation methods Deep frozen

Additional Metadata

Purpose Estos datos representan microorganismos provenientes de líquenes en el Parque Chingaza que se guardan en la colección de Corpogen por su taxonomía y posible actividad antimicrobiana.
Alternative Identifiers 10.15472/vwolz3
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cepas_pnnchingaza_corpogen
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=cepas_pnnchingaza_corpogen