Описание
La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.
Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.
Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.
Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 336 записей.
Также в наличии 4 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.
- Occurrence (core)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Permit
- Amplification
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Загрузки
Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024): Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. v1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/dpbwjh
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Colombian Biodiversity Information System.
Ключевые слова
Bacterias del rumen; Bacterias Ácidolácticas; Nutrición animal; Lactobacilos; bacterias celuloliticas; PERMISO_COLECTA; Specimen; Occurrence
Внешние данные
Ресурс также доступен в других форматах
| 1466_agrocmina_20201113 | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=1466_agrocmina_20201113 UTF-8 DWC-A 1 |
|---|
Контакты
Кто является создателем ресурса:
Кто может ответить на вопросы о ресурсе:
Кем заполнены метаданные:
Кто еще связан с данным ресурсом:
Географический охват
Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [1,615, -76,302], Север Восток [8,751, -71,336] |
|---|
Таксономический охват
Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.
| Family | Bacillaceae, Carnobacteriaceae, Clostridiaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Fibrobacteraceae, Lachnospiraceae, Lactobacillaceae, Paenibacillaceae, Ruminococcaceae, Staphylococcaceae, Streptococcaceae, Veillonellaceae |
|---|
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 1996-01-01 / 2022-09-01 |
|---|
Данные проекта
Conservar las accesiones y/o poblaciones vinculadas a los Bancos de Germoplasma de la Nación Colombiana, mediante actividades de incremento, mantenimiento, descripción, documentación e investigación en conservación
| Название | Una Colección de germoplasma de microorganismos con interés en nutrición animal conservado |
|---|---|
| Финансирование | Ministerio de Agricultura-Agrosavia |
Исполнители проекта:
Методы сбора
Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas
| Охват исследования | La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país. |
|---|
Описание этапа методики:
- Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
- Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración
Данные коллекции
| Название коллекции | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Идентификатор коллекции | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 129 |
| Идентификатор родительской коллекции | BGMA |
| Название коллекции | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Идентификатор коллекции | https://scientific-collections.gbif.org/collection/71eaa757-81de-4c4b-840b-766efd57673d |
| Идентификатор родительской коллекции | BGMA |
| Методы сохранения образцов | Deep frozen |
|---|
Дополнительные метаданные
| Цель | https://ipt.biodiversidad.co/sib/manage/metadata-additional.do?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |
|---|---|
| Альтернативные идентификаторы | 10.15472/dpbwjh |
| 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |