OCCURRENCE

Colección de microorganismos con interés en nutrición animal

最新バージョン Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA によって公開 2024/09/10 Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.... 以上

説明

La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.

Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.

Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.

Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、336 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは4 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

  • Occurrence (コア)
    336
  • ExtendedMeasurementOrFact 
    1981
  • Preservation 
    566
  • Permit 
    336
  • Amplification 
    283

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

ダウンロード

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 336 レコード Spanish で (42 kB) - 更新頻度: as needed
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (22 kB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード Spanish で (17 kB)

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024): Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. v1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/dpbwjh

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858ddが割り当てられています。   Colombian Biodiversity Information System によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているCorporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Bacterias del rumen; Bacterias Ácidolácticas; Nutrición animal; Lactobacilos; bacterias celuloliticas; PERMISO_COLECTA; Specimen; Occurrence

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

連絡先

リソースを作成した人:

Juan Camilo Ovalle Masmela
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335
Lina Marcela Botero Rute
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335
Fernando Rodriguez Villamizar
Investigador PhD
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria- AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335
Rocio Fenney Herrera León
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335
Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal
Investigador PhD
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO

リソースに関する質問に答えることができる人:

Juan Camilo Ovalle Masmela
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335
Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal
Investigador PhD
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335

メタデータを記載した人:

Juan Camilo Ovalle Masmela
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria-AGROSAVIA
C.I. Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
(601) 4227300 Ext. 1335

他に、リソースに関連付けられていた人:

研究代表者
Juan Camilo Ovalle Másmela
Profesional de Apoyo a la Investigación
Corporación Colombiana de Investigacion Agropecuaria AGROSAVIA
C.I Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
キュレーター
Lina Marcela Botero
Profesional de apoyo a la investigacion
Corporación Colombiana de Investigacion Agropecuaria AGROSAVIA
CI Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
キュレーター
Fernando Rodriguez Villamizar
Investigador PhD
Corporación Colombiana de Investigacion Agropecuaria AGROSAVIA
CI Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
キュレーター
Rocio Fenney Herrera León
Profesional de apoyo a la investigacion
Corporación Colombiana de Investigacion Agropecuaria AGROSAVIA
CI Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO
キュレーター
Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal
Investigador PhD
Corporación Colombiana de Investigacion Agropecuaria AGROSAVIA
CI Tibaitatá
Mosquera
Cundinamarca
CO

地理的範囲

Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.

座標(緯度経度) 南 西 [1.615, -76.302], 北 東 [8.751, -71.336]

生物分類学的範囲

Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.

Family  Bacillaceae,  Carnobacteriaceae,  Clostridiaceae,  Enterobacteriaceae,  Enterococcaceae,  Fibrobacteraceae,  Lachnospiraceae,  Lactobacillaceae,  Paenibacillaceae,  Ruminococcaceae,  Staphylococcaceae,  Streptococcaceae,  Veillonellaceae

時間的範囲

開始日 / 終了日 1996-01-01 / 2022-09-01

プロジェクトデータ

Conservar las accesiones y/o poblaciones vinculadas a los Bancos de Germoplasma de la Nación Colombiana, mediante actividades de incremento, mantenimiento, descripción, documentación e investigación en conservación

タイトル Una Colección de germoplasma de microorganismos con interés en nutrición animal conservado
ファンデイング Ministerio de Agricultura-Agrosavia

プロジェクトに携わる要員:

論文著者
Lina Marcela Botero Rute
論文著者
Fernando Rodriguez Villamizar
論文著者
Rocio Fenney Herrera León
論文著者
Hugo Rodolfo Jimenez Sabogal

収集方法

Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas

Study Extent La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país.

Method step description:

  1. Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
  2. Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración

コレクションデータ

コレクション名 Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA
コレクション識別子 Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 129
Parent Collection Identifier BGMA
コレクション名 Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA
コレクション識別子 https://scientific-collections.gbif.org/collection/71eaa757-81de-4c4b-840b-766efd57673d
Parent Collection Identifier BGMA
標本保存方法 Deep frozen