Description
La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.
Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.
Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.
Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 336 enregistrements.
4 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
- Occurrence (noyau)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Permit
- Amplification
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Téléchargements
Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :
| Données sous forme de fichier DwC-A (zip) | télécharger 336 enregistrements dans Espagnol (42 kB) - Fréquence de mise à jour: quand cela est nécessaire |
|---|---|
| Métadonnées sous forme de fichier EML | télécharger dans Espagnol (22 kB) |
| Métadonnées sous forme de fichier RTF | télécharger dans Espagnol (17 kB) |
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024): Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. v1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/dpbwjh
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.
Mots-clé
Bacterias del rumen; Bacterias Ácidolácticas; Nutrición animal; Lactobacilos; bacterias celuloliticas; PERMISO_COLECTA; Specimen; Occurrence
Données externes
Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats
| 1466_agrocmina_20201113 | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=1466_agrocmina_20201113 UTF-8 DWC-A 1 |
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Contacts
Personne ayant créé cette ressource:
Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:
Personne ayant renseigné les métadonnées:
Autres personnes associées à la ressource:
Couverture géographique
Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [1,615, -76,302], Nord Est [8,751, -71,336] |
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Couverture taxonomique
Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.
| Family | Bacillaceae, Carnobacteriaceae, Clostridiaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Fibrobacteraceae, Lachnospiraceae, Lactobacillaceae, Paenibacillaceae, Ruminococcaceae, Staphylococcaceae, Streptococcaceae, Veillonellaceae |
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Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 1996-01-01 / 2022-09-01 |
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Données sur le projet
Conservar las accesiones y/o poblaciones vinculadas a los Bancos de Germoplasma de la Nación Colombiana, mediante actividades de incremento, mantenimiento, descripción, documentación e investigación en conservación
| Titre | Una Colección de germoplasma de microorganismos con interés en nutrición animal conservado |
|---|---|
| Financement | Ministerio de Agricultura-Agrosavia |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas
| Etendue de l'étude | La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país. |
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Description des étapes de la méthode:
- Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
- Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración
Données de collection
| Nom de la collection | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Identifiant de collection | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 129 |
| Identifiant de la collection parente | BGMA |
| Nom de la collection | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Identifiant de collection | https://scientific-collections.gbif.org/collection/71eaa757-81de-4c4b-840b-766efd57673d |
| Identifiant de la collection parente | BGMA |
| Méthode de conservation des spécimens | Deep frozen |
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Métadonnées additionnelles
| Objet | https://ipt.biodiversidad.co/sib/manage/metadata-additional.do?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |
|---|---|
| Identifiants alternatifs | 10.15472/dpbwjh |
| 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |