Descripción
La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.
Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.
Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.
Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.
Registros
Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 336 registros.
también existen 4 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.
- Occurrence (core)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Permit
- Amplification
Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.
Descargas
Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:
Versiones
La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.
¿Cómo referenciar?
Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:
Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024): Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. v1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/dpbwjh
Derechos
Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:
El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Registro GBIF
Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.
Palabras clave
Bacterias del rumen; Bacterias Ácidolácticas; Nutrición animal; Lactobacilos; bacterias celuloliticas; PERMISO_COLECTA; Specimen; Occurrence
Datos externos
Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos
| 1466_agrocmina_20201113 | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=1466_agrocmina_20201113 UTF-8 DWC-A 1 |
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Contactos
¿Quién creó el recurso?:
¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:
¿Quién documentó los metadatos?:
¿Quién más está asociado con el recurso?:
Cobertura geográfica
Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.
| Coordenadas límite | Latitud Mínima Longitud Mínima [1,615, -76,302], Latitud Máxima Longitud Máxima [8,751, -71,336] |
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Cobertura taxonómica
Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.
| Familia | Bacillaceae, Carnobacteriaceae, Clostridiaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Fibrobacteraceae, Lachnospiraceae, Lactobacillaceae, Paenibacillaceae, Ruminococcaceae, Staphylococcaceae, Streptococcaceae, Veillonellaceae |
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Cobertura temporal
| Fecha Inicial / Fecha Final | 1996-01-01 / 2022-09-01 |
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Datos del proyecto
Conservar las accesiones y/o poblaciones vinculadas a los Bancos de Germoplasma de la Nación Colombiana, mediante actividades de incremento, mantenimiento, descripción, documentación e investigación en conservación
| Título | Una Colección de germoplasma de microorganismos con interés en nutrición animal conservado |
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| Fuentes de Financiación | Ministerio de Agricultura-Agrosavia |
Personas asociadas al proyecto:
Métodos de muestreo
Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas
| Área de Estudio | La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país. |
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Descripción de la metodología paso a paso:
- Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
- Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración
Datos de la colección
| Nombre de la Colección | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Identificador de la Colección | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 129 |
| Identificador de la Colección Parental | BGMA |
| Nombre de la Colección | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Identificador de la Colección | https://scientific-collections.gbif.org/collection/71eaa757-81de-4c4b-840b-766efd57673d |
| Identificador de la Colección Parental | BGMA |
| Métodos de preservación de los ejemplares | Congelado |
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Metadatos adicionales
| Propósito | https://ipt.biodiversidad.co/sib/manage/metadata-additional.do?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |
|---|---|
| Identificadores alternativos | 10.15472/dpbwjh |
| 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |