Description
La colección de microorganismos con interés en nutrición animal (CMINA) hace parte de las colecciones que conforman el banco de microorganismos de la nación colombiana custodiado por AGROSAVIA. La colección CMINA se encuentra conservada principalmente bajo un sistema de criopreservación en nitrógeno líquido a -196ºC y ultra frío a -80ºC, manteniendo la viabilidad de las accesiones además de la capacidad para ser reactivados muchos años después, para su estudio y uso en investigación.
Esta colección esta conformada por dos grandes grupos de microorganismos. El primer grupo, corresponde a bacterias aisladas del tracto gastrointestinal de herbívoros silvestres y el segundo, por bacterias ácido-lácticas provenientes de ensilajes. Por sus características el primer grupo son microorganismos anaerobios estrictos, en su mayoría con potencial celulítico. El grupo de bacterias Ácidolácticas son bacterias Gram positivas, catalasa negativo y en su mayoría con potencial biocontrolador y probiótico.
Este recurso contiene la información de 191 microorganismos actualmente presentes en la colección y de 145 que han sido dados de baja, estos datos han sido tomados entre 1996 al 2022 en 10 departamentos de Colombia.
Ademas contiene información de la actividad antagónica contra algunas bacterias en el campo dynamicProperties. Adicionalmente, en las extensiones contiene información del medio de cultivo, métodos de preservación y datos de primers para la amplificación.
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 336 records.
4 extension data tables also exist. An extension record supplies extra information about a core record. The number of records in each extension data table is illustrated below.
- Occurrence (core)
- ExtendedMeasurementOrFact
- Preservation
- Permit
- Amplification
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Downloads
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Versions
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Ovalle Masmela J C, Botero Rute L M, Rodriguez Villamizar F, Herrera León R F, Jimenez Sabogal H R (2024): Colección de microorganismos con interés en nutrición animal. v1.6. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/dpbwjh
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd. Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria - AGROSAVIA publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
Bacterias del rumen; Bacterias Ácidolácticas; Nutrición animal; Lactobacilos; bacterias celuloliticas; PERMISO_COLECTA; Specimen; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
| 1466_agrocmina_20201113 | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=1466_agrocmina_20201113 UTF-8 DWC-A 1 |
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Contacts
Who created the resource:
Who can answer questions about the resource:
Who filled in the metadata:
Who else was associated with the resource:
Geographic Coverage
Las muestras han sido recolectadas en todo el territorio nacional, abarcando 10 departamentos, en los que se encuentra: Antioquia, Boyacá, Caquetá, Casanare, Córdoba, Cundinamarca, Magdalena, Meta, Tolima y Valle del Cauca.
| Bounding Coordinates | South West [1.615, -76.302], North East [8.751, -71.336] |
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Taxonomic Coverage
Este recurso contiene 336 registros de Bacterias, pertenecientes a 4 filos, 5 clases, 6 ordenes, 13 familias y 22 géneros. Un 73% esta clasificado a especie, 14% a reino y 13% a género.
| Family | Bacillaceae, Carnobacteriaceae, Clostridiaceae, Enterobacteriaceae, Enterococcaceae, Fibrobacteraceae, Lachnospiraceae, Lactobacillaceae, Paenibacillaceae, Ruminococcaceae, Staphylococcaceae, Streptococcaceae, Veillonellaceae |
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Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 1996-01-01 / 2022-09-01 |
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Project Data
Conservar las accesiones y/o poblaciones vinculadas a los Bancos de Germoplasma de la Nación Colombiana, mediante actividades de incremento, mantenimiento, descripción, documentación e investigación en conservación
| Title | Una Colección de germoplasma de microorganismos con interés en nutrición animal conservado |
|---|---|
| Funding | Ministerio de Agricultura-Agrosavia |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
Los muestreos se realizaron a bovinos de razas criollas para el aislamiento de microorganismos provenientes del rumen. Adicionalmente se realizaron muestreos de ensilajes de avena y maíz del altiplano cundiboyacense para la obtención de bacterias Ácidolácticas
| Study Extent | La muestras han sido tomadas a hospederos (Mamíferos y plantas) en 10 departamentos del país. |
|---|
Method step description:
- Para microorganismos del rumen: 1.Obtención de fluido ruminal por sonda orofaringea, 2.Inoculación y transporte de medios inoculados a una temperatura de 30°C, 3.Repique en medio de cultivo selectivo para aislamiento
- Para Bacterias Ácidolácticas: 1.Obtención de muestras de ensilaje de avena y maíz recién abierto, 2.Embalaje y transporte de muestras en condiciones de refrigeración
Collection Data
| Collection Name | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Collection Identifier | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 129 |
| Parent Collection Identifier | BGMA |
| Collection Name | Banco de Germoplasma de Microorganismos - AGROSAVIA |
|---|---|
| Collection Identifier | https://scientific-collections.gbif.org/collection/71eaa757-81de-4c4b-840b-766efd57673d |
| Parent Collection Identifier | BGMA |
| Specimen preservation methods | Deep frozen |
|---|
Additional Metadata
| Purpose | https://ipt.biodiversidad.co/sib/manage/metadata-additional.do?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |
|---|---|
| Alternative Identifiers | 10.15472/dpbwjh |
| 1f7c2e95-ebec-4d14-9adb-ee958da858dd | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=agrosavia_microorganismos_interes_nutricional |