Описание
Las garrapatas son consideradas, después de los mosquitos, como el segundo grupo de artrópodos de mayor importancia como vectores de microorganismos patógenos en el mundo. Rhipicephalus microplus (Canestrini, 1887) es la principal especie de garrapata que afecta la ganadería bovina causando daños directos e indirectos en países tropicales y subtropicales. La amplia distribución de las garrapatas y su capacidad de alimentarse de un amplio número de hospedadores vertebrados contribuye con su potencial para diseminar patógenos, incluyendo virus, a huéspedes susceptibles. El conocimiento de aspectos biológicos de R. microplus, tales como los hospederos que infesta y su densidad en las diferentes ecorregiones/hospederos son aspectos clave para el diseño de programas de control selectivo e integrado de garrapatas; sin embargo, esta información es escasa y la poca información disponible no es sistemática en el contexto colombiano. En Colombia, la infestación por Rhipicephalus microplus, especie conocida como la garrapata común del bovino, es un problema económico y de salud para los agrosistemas ganaderos. La identificación de los virus presentes en este ectoparásito resulta un aspecto clave hacia el reconocimiento de su potencial como vector biológico. Este estudio buscó en primer lugar determinar índices entomológicos de infestación por garrapatas, en especial de R. microplus, en hospederos domésticos de dos ecorregiones contrastantes del Magdalena Medio antioqueño. En este sentido, se recolectaron especímenes de vacas, carneros, caballos y perros. La frecuencia de infestación en estos hospederos fueron variables en las tres salidas de campo ejecutadas, pero permanecieron sobre el 80% en los animales evaluados. En relación con las especies de garrapatas encontradas, se observó una tendencia, aunque no exclusividad, de algunas especies de garrapatas por su hospedero así: Rhipicephalus microplus sobre el ganado bovino y ovino (carneros), Dermacentor nitens en equinos y Rhipicephalus sanguineus en caninos. En segundo lugar, se utilizaron tecnologías de secuenciación de nueva generación para identificar el viroma de R. microplus de especímenes recolectados de diferentes hospederos domésticos. Para esto, se realizaron extracciones de ARN total, se prepararon las librerías transcriptómicas y se leyeron lecturas pareadas de 100 bases en las plataformas HiSeq 4000 (TruSeq Stranded mRNA-PolyA) y NovaSeq 6000 (rRNA- depleted RNA) de Illumina. Las secuencias con calidad depuradas se ensamblaron de novo y se identificaron los contigs correspondientes a virus mediante búsquedas por homología usando BLASTX y la comparación con una base de datos de referencia. Se identificaron dos virus putativos previamente identificados y detectados en garrapatas en China: WTV-2 (Wuhan tick virus 2) y LITV (Lihan Tick virus); además, un virus cercano al JMTV (Jingmen tick virus), el MGTV (Mogiana tick virus), y un virus desconocido, del grupo de los timovirus, que fue denominado preliminarmente ATV-1 (Antioquia tick virus 1). Estos resultados sugieren a esta especie, como reservorio importante también de virus, y proveen una línea base para profundizar en el estudio de su papel como vector biológico, así como el potencial de patogenicidad de este tipo de virus en los sistemas ganaderos de Antioquia.
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Gutierrez Builes L A, Gomez G F, Durango Manrique Y S (2020): Garrapatas duras (Acari: Ixodidae) colectadas en hospederos domésticos del Magdalena Medio Antioqueño. v1.2. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/k7gl1e
Права
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Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 09b33058-0e27-4608-bff3-ac21555614a3. Universidad Pontificia Bolivariana отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Colombian Biodiversity Information System.
Ключевые слова
Occurrence; Observation; Ticks; Animals; Domestic; Viruses; Livestock; PERMISO_COLECTA
Внешние данные
Ресурс также доступен в других форматах
| Garrapatas duras (Acari: Ixodidae) colectadas en hospederos domésticos del Magdalena Medio Antiqueño | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_vigilancia_20200220 UTF-8 DWC-A |
|---|
Контакты
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Географический охват
Delimitación de la Zona de muestreo
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [6,47, -74,57], Север Восток [6,5, -74,46] |
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Таксономический охват
Las larvas de garrapatas colectadas en este estudio fueron identificadas como Ixodidae y las especies de garrapatas adultas fueron Dermacentor nitens, Rhipicephalus microplus, Rhipicephalus sanguineus y Dermacentor albipictus.
| Family | Ixodidae (Garrapatas duras) |
|---|---|
| Species | Dermacentor nitens, Rhipicephalus microplus, Rhipicephalus sanguineus, Dermacentor albipictus |
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 2018-11-15 / 2019-04-03 |
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Данные проекта
En Colombia, la infestación por garrapatas de la especie Rhipicephalus microplus constituye uno de los principales problemas económicos para las explotaciones bovinas, por los efectos directos e indirectos que producen tales como acciones traumáticas, tóxicas, infecciosas, deterioro de las pieles, enfermedades agudas y crónicas que incluso pueden ser fatales. Aparte de infestar a los bovinos, se ha reportado que R. microplus puede infestar a otros hospederos domésticos y de fauna silvestre lo cual amplía su papel como ectoparásito y su potencial como vector biológico de diversos microorganismos de importancia veterinaria y medica humana. La influencia del hospedero sobre el viroma presente en la especie de garrapata R. microplus y su importancia en la circulación y evolución de los arbovirus y otros patógenos asociados es desconocida y tiene implicaciones para su control. Así, este estudio buscó en primer lugar determinar índices entomológicos de infestación por garrapatas, en especial de R. microplus, en hospederos domésticos de dos ecorregiones contrastantes del Magdalena Medio antiqueño. En segundo lugar, utilizar tecnologías de secuenciación de nueva generación para identificar el viroma de R. microplus de especímenes recolectados de diferentes hospederos domésticos. A nivel de los hospederos domésticos, se realizó recolección de garrapatas en bovinos, ovinos, equinos, caprinos y equinos. Las garrapatas recolectadas sobre cada hospedero indican una preferencia de algunas especies por su hospedero, aunque no son exclusivas. Así, R. microplus se encontró en bovinos (65-86%), ovinos (0-13,6%), equinos (5,8-21,5%) y caninos (0-1%).
| Название | Vigilancia entomológica y virológica de Rhipicephalus microplus en hospederos domésticos del Magdalena Medio antioqueño |
|---|---|
| Идентификатор | Universidad Pontificia Bolivariana |
| Финансирование | Este proyecto fue financiado por COLCIENCIAS con el código C145I000000008166-1 y Número de contrato FP44842-192-2018 y cofinanciado por la Universidad Pontificia Bolivariana Radicado CIDI UPB 042C-02/18-65. |
| Описание района исследования | Fincas ganaderas ubicadas en el municipio de Puerto Berrio, Antioquia |
| Описание плана выполнения исследований | El muestreo entomológico asociado con esta investigación fue ejecutado en fincas ganaderas del municipio de Puerto Berrio en la subregión del Magdalena Medio del departamento de Antioquia. Se recolectaron ninfas, larvas y garrapatas adultas mediante una técnica de muestreo directa en los hospederos domésticos seleccionados para obtener algunos estimativos relativos de su abundancia. Las garrapatas se colocaron vivas en recipientes plásticos humedecidos, diferenciando el animal del que fueron capturadas para determinar la prevalencia de infestación por cada tipo de hospedero y la cantidad de cada estado de vida. Para cada hospedero doméstico evaluado se completó un cuestionario que incluye fecha de muestreo, edad, sexo del huésped, número de ninfas, larvas y garrapatas adultas, entre otros. Las garrapatas se identificaron con base en caracteres morfológicos. Adicionalmente, a partir de los datos crudos de RNA-Seq se recuperaron secuencias del gen citocromo b y se compararon con secuencias de referencia de diferentes especies de garrapatas reportadas en la base de datos del NCBI. Se seleccionaron aleatoriamente 3-5 garrapatas adultas R. microplus recolectadas para proceder a formar “pooles” y a realizar los estudios moleculares. Se procesó al menos un pool por cada hospedero doméstico y lugar. El ARN total se extrajo de los tejidos blandos de la garrapata y el secuenciamiento se realizó en un maquina HiSeq y finalmente se realizo una identificación del viroma asociado a cada muestra analizada. |
Исполнители проекта:
Методы сбора
Se recolectaron especímenes de garrapatas en hospederos domésticos de fincas ganaderas, mediante búsqueda directa en los animales y método de Dragguin en los potreros.
| Охват исследования | Los sitios de muestreo estuvieron ubicados en el municipio de Puerto Berrio, Antioquia |
|---|---|
| Контроль качества | En las pruebas moleculares se utilizaron controles de ADN de identificación reconocida con el fin de realizar procesos de validación interna de cada prueba molecular usada. Ademas se efectuaron pruebas para verificar la posible interferencia de inhibidores de la amplificación que pudieran estar presentes en las muestras de ADN genomico extraídas a partir de los especímenes de garrapatas. |
Описание этапа методики:
- La información detallada de la metodología, paso a paso, estará disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de análisis y escritura.
Данные коллекции
| Название коллекции | Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I) |
|---|---|
| Идентификатор коллекции | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003 |
| Идентификатор родительской коллекции | IAvH |
| Методы сохранения образцов | Alcohol |
|---|
| Единицы хранения | Между 2 955 и 2 964 Espécimen completo |
|---|
Дополнительные метаданные
Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.
| Цель | Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana. |
|---|---|
| Описание частоты обновления ресурса | Cada que sea necesario |
| Альтернативные идентификаторы | 10.15472/k7gl1e |
| 09b33058-0e27-4608-bff3-ac21555614a3 | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=744_vigilancia_042c021865 |